NAMD ( NA noscale M olecular D ynamics) — бесплатная программа для молекулярной динамики , написанная с использованием модели параллельного программирования Charm++ , обладающей высокой эффективностью распараллеливания и часто используемой для симуляции больших систем (миллионы атомов). Программа была создана совместно Группой Теоретической и Вычислительной Биофизики (TCB) и Лабораторией параллельного программирования (PPL) из Иллинойсского университета в Урбане и Шампейне .

Программа была анонсирована в 1995 г Нэльсоном и др. как параллельная программа для молекулярной динамики, включающая интерактивное моделирование, связанное с программой визуализации . Программа поддерживает мультипроцессорность , возможность использовать для расчетов графические процессоры (технология CUDA ).

См. также

• GROMACS
• Charm++
• LAMMPS

Примечания

Ссылки