Interested Article - Лигирование по Штаудингеру

Лигирование по Штаудингеру ( англ. Staudinger ligation) — модификация реакции Штаудингера , широко применяемая в области и для ковалентного связывания биомолекул с низкомолекулярными метками, а также для мечения клеток в живых организмах. Реакция предложена в 2000 году группой К. Бертоцци . Поскольку участвующие в ней функциональные группы ( азид и фосфин ) практически не представлены в организмах и не склонны взаимодействовать с природными соединениями, лигирование по Штаудингеру относится к биоортогональным реакциям .

Биоортогональность

Лигирование по Штаудингеру стало первым примером биоортогональной реакции , способной протекать в клетках живых организмов, не мешая естественным биохимическим процессам. Его открытие произошло в результате поиска химических реакций, протекающих между функциональными группами , которые редко встречаются в биомолекулах и, как следствие, имеют совершенно отличную реакционную способность, нежели наиболее часто встречающиеся природные функциональные группы.

Согласно , азид и фосфин относятся к мягким электрофилам и нуклеофилам соответственно, в то время как биомолекулы содержат, в основном, жёсткие нуклеофилы, которые к реакциям с азидами неспособны.

На примере лекарственных препаратов ( азидотимидин ) было показано, что азиды являются биосовместимыми , а фосфины практически не встречаются в биомолекулах и не восстанавливают дисульфидные связи .

Механизм

Реакция основана на взаимодействии азида , являющегося мягким электрофилом, и фосфина — мягкого нуклеофила. На первой стадии происходит нуклеофильное присоединение фосфина к азота азидной группы, в результате чего образуется фосфазид 1 . Далее через промежуточное образование четырёхчленного цикла 2 фосфазид отщепляет молекулу азота и образует иминофосфоран 3 . В классической реакции Штаудингера данная стадия являлась завершающей, после чего иминофосфоран обычно подвергали гидролизу с образованием двух продуктов - амина и оксида фосфина. Модификация, предложенная К. Бертоцци, состоит во введении в один из арильных заместителей фосфина сложноэфирной группы в качестве электрофильной ловушки. В таком случае нуклеофильный атом азота иминофосфорана атакует сложноэфирную группу с образованием бициклического продукта 4 . Гидролиз связи P—N даёт один конечный продукт 5 , в котором биомолекула и метка связаны посредством прочной амидной связи .

Бесследовое лигирование по Штаудингеру

Вскоре после появления публикации К. Бертоцци было предложено несколько вариантов лигирования по Штаудингеру, в которых образующийся в реакции оксид фосфина удаляется из конечного продукта путём гидролиза. Такая модификация получила название бесследового ( англ. traceless) лигирования по Штаудингеру . С точки зрения химии, удаление оксида фосфина было реализовано путём модификации реагентов таким образом, чтобы фосфин в итоге оказывался в спиртовой части сложного эфира и отщеплялся при атаке нуклеофильного атома азота иминофосфоранового интермедиата.

Группа Р. Т. Рейнса встроила вспомогательный меркаптановый фрагмент в фосфин для переэтерификации тиоэфира защищённой аминокислоты. При введении в реакцию азида образуется иминофосфоран, в результате перегруппировки в котором фосфин отщепляется и далее гидролизуется водой. Данный подход был применён для синтеза пептида и может стать альтернативой .

Саксон и Бертоцци также предложили свои фосфиновые реагенты для бесследового лигирования по Штаудингеру, продемонстрировав возможности реакции на примере азидсодержащего нуклеозида .

Подобный подход был использован для синтеза гликопротеинов. При этом фосфин вводился в сложноэфирную группу модифицированного углевода, который далее реагировал с азид-содержащим белком с образованием продукта, в котором углевод и белок были связаны прочной амидной связью .

Применение

Реакция применялась для модификации азид-содержащих биомолекул различными низкомолекулярными метками ( биотином , флуоресцентными красителями,), а также для пептидов, белков, модификации поверхностей и др.

См. также

Примечания

Saxon E., Bertozzi C. R. Cell Surface Engineering by a Modified Staudinger Reaction (англ.) // Science. — 2000. — Vol. 287 , no. 5460 . — P. 2007–2010 . — doi : . — .
Chakraborty A., Wang D., Ebright Y. W., Ebright R. H. Azide-Specific Labelling of Biomolecules by Staudinger-Bertozzi Ligation: Phosphine Derivatives of Fluorescent Probes Suitable for Single-Molecule Fluorescence Spectroscopy (англ.) // Methods Enzymol. — 2010. — Vol. 472 . — P. 19–30 . — doi : .
Lin F. L., Hoyt H. M., van Halbeek H., Bergman R. G., Bertozzi C. R. Mechanistic Investigation of the Staudinger Ligation (англ.) // J. Am. Chem. Soc. — 2005. — Vol. 127 , no. 8 . — P. 2686–2695 . — doi : . — .
Nilsson B. L., Kiessling L. L., Raines R. T. Staudinger Ligation: A Peptide from a Thioester and Azide (англ.) // Org, Lett. — 2000. — Vol. 2 , no. 13 . — P. 1939–1941 . — doi : .
Saxon E., Armstrong J. I., Bertozzi C. R. A “Traceless” Staudinger Ligation for the Chemoselective Synthesis of Amide Bonds (англ.) // Org, Lett. — 2000. — Vol. 2 , no. 14 . — P. 2141-2143 . — doi : .
Bernardes G. J. L., Linderoth L., Doores K. J., Boutureira O., Davis B. G. Site-Selective Traceless Staudinger Ligation for Glycoprotein Synthesis Reveals Scope and Limitations (англ.) // ChemBioChem. — 2011. — Vol. 12 , no. 9 . — P. 1383–1386 . — doi : .
van Berkel S. S., van Eldijk M. B., van Hest J. C. M. Staudinger Ligation as a Method for Bioconjugation // Angew. Chem. Int. Ed. — 2011. — Т. 50 , № 38 . — С. 8806–8827 . — doi : .

Литература

van Berkel S. S., van Eldijk M. B., van Hest J. C. M. Staudinger Ligation as a Method for Bioconjugation // Angew. Chem. Int. Ed. — 2011. — Т. 50 , № 38 . — С. 8806–8827 . — doi : .
Schilling C. I., Jung N., Biskup M., Schepers U., Bräse S. // Chem. Soc. Rev. — 2011. — Т. 40 , № 9 . — С. 4840-4871 . — doi : .

[Saxon_2000-1] Saxon E., Bertozzi C. R. Cell Surface Engineering by a Modified Staudinger Reaction (англ.) // Science. — 2000. — Vol. 287 , no. 5460 . — P. 2007–2010 . — doi : . — .

[Chakraborty_2010-2] Chakraborty A., Wang D., Ebright Y. W., Ebright R. H. Azide-Specific Labelling of Biomolecules by Staudinger-Bertozzi Ligation: Phosphine Derivatives of Fluorescent Probes Suitable for Single-Molecule Fluorescence Spectroscopy (англ.) // Methods Enzymol. — 2010. — Vol. 472 . — P. 19–30 . — doi : .

[Lin_2005-3] Lin F. L., Hoyt H. M., van Halbeek H., Bergman R. G., Bertozzi C. R. Mechanistic Investigation of the Staudinger Ligation (англ.) // J. Am. Chem. Soc. — 2005. — Vol. 127 , no. 8 . — P. 2686–2695 . — doi : . — .

[Nilsson_2000-4] Nilsson B. L., Kiessling L. L., Raines R. T. Staudinger Ligation: A Peptide from a Thioester and Azide (англ.) // Org, Lett. — 2000. — Vol. 2 , no. 13 . — P. 1939–1941 . — doi : .

[SaxonE_2000-5] Saxon E., Armstrong J. I., Bertozzi C. R. A “Traceless” Staudinger Ligation for the Chemoselective Synthesis of Amide Bonds (англ.) // Org, Lett. — 2000. — Vol. 2 , no. 14 . — P. 2141-2143 . — doi : .

[Bernardes_2011-6] Bernardes G. J. L., Linderoth L., Doores K. J., Boutureira O., Davis B. G. Site-Selective Traceless Staudinger Ligation for Glycoprotein Synthesis Reveals Scope and Limitations (англ.) // ChemBioChem. — 2011. — Vol. 12 , no. 9 . — P. 1383–1386 . — doi : .

[vBerkel_2011-7] van Berkel S. S., van Eldijk M. B., van Hest J. C. M. Staudinger Ligation as a Method for Bioconjugation // Angew. Chem. Int. Ed. — 2011. — Т. 50 , № 38 . — С. 8806–8827 . — doi : .