Клуб принимает участие в Чемпионате Литвы, А лиге. Клуб становился чемпионом Литвы 13 раз. В 2005 году Гинтра Университетас стала чемпионом в четвёртый раз и с тех пор побеждала в каждом чемпионате
.
Как победитель чемпионатов, клуб играл в Лиге, которая с 2009 года была реорганизована в Лигу чемпионов УЕФА среди женщин. Вначале клуб участвовал только в квалификационных раундах, проводя по три игры в каждом сезоне, лучшим результатом была одна победа, одна ничья и одно поражение, которые не позволили пройти в следующий раунд.
Клуб принимал участие в квалификационном раунде
Лиги чемпионов УЕФА среди женщин 2010/2011
и сумел занять второе место в группе, выиграв у
, сыграв в ничью с
и проиграв только английскому
Эвертону
. Хозяином всех игр был Гинтра (Литва). В сезоне 2014/15 клуб был лучшим среди клубов, занявших второе место в своих группах и прошёл в следующий раунд впервые за десять сезонов.