Вариация числа копий генов
- 1 year ago
- 0
- 0
Экспрессия генов — процесс, в ходе которого наследственная информация от гена (последовательности нуклеотидов ДНК ) преобразуется в функциональный продукт — РНК или белок . Некоторые этапы экспрессии генов могут регулироваться: это транскрипция , трансляция , сплайсинг РНК и стадия посттрансляционных модификаций белков . Процесс активации экспрессии генов короткими двухцепочечными РНК называется активацией РНК .
Регуляция экспрессии генов позволяет клеткам контролировать собственную структуру и функцию и является основой дифференцировки клеток, морфогенеза и адаптации. Экспрессия генов является субстратом для эволюционных изменений, так как контроль над временем , местом и количественными характеристиками экспрессии одного гена может иметь влияние на функции других генов в целом организме.
У прокариот и эукариот гены представляют собой последовательности нуклеотидов ДНК. На матрице ДНК происходит транскрипция — синтез комплементарной РНК. Далее на матрице мРНК происходит трансляция — синтезируются белки. Существуют гены, кодирующие нематричную РНК (например, рРНК , тРНК , малые РНК ), которые экспрессируются ( транскрибируются ), но не транслируются в белки.
МикроРНК — это короткие (18—25 нуклеотидов ) последовательности односпиральной РНК , вызывают подавление экспрессии генов. МикроРНК связываются со своей мишенью — информационной РНК — по принципу комплементарности . Это вызывает подавление синтеза белка или деградацию информационной РНК .
МикроРНК могут иметь большую или меньшую специфичность благодаря большей или меньшей доле комплементарных своей мишени азотистых оснований. Низкая специфичность позволяет одной микроРНК подавлять экспрессию сотен разных генов .
Основными способами определения экспрессии генов в данное время являются секвенирование РНК , содержащих поли-А хвост ( мРНК ), а также применение экспрессионных ДНК-микрочипов . Секвенирование РНК становится всё более распространённым методом в связи с усовершенствованием методов секвенирования нового поколения . Секвенирование РНК не только позволяет определить уровень экспрессии каждого белоккодирующего гена в геноме, но и различать варианты мРНК, получающиеся в результате альтернативного сплайсинга .
Примером сложной экспрессии генов в онтогенезе может служить генный контроль синтеза гемоглобинов у человека. Молекула гемоглобина состоит из 4 частей: двух идентичных альфа-цепей и двух идентичных бета-цепей. Гемоглобин нормального взрослого человека (Нв А ) отличается от гемоглобина эмбриона человека (эмбриональный гемоглобин, Нв F ). Различия между ними касаются бета-цепи. В гемоглобине плода она заменена на полипептидную гамма-цепь. Наконец, в крови взрослых людей в небольшом количестве встречается Нв А2 , в котором бета-цепь заменена на сигма-цепь. Все 3 типа нормальных гемоглобинов человека(Нв А Нв А2 Нв F ) контролируются отдельными локусами. Локус α А определяет формирование альфа-цепей. Он эффективен в течение всей жизни, обеспечивая наличие альфа-цепей во всех указанных гемоглобинах .
Моноаллельная экспрессия у эукариот характерна:
В настоящее время известно, что около 5—10 % генов эукариот экспрессируются в клетках моноаллельно, среди таких генов чаще наблюдаются гены, кодирующие поверхностные клеточные белки и, в частности, гены, кодирующие иммуноглобулины, Т-клеточные и обонятельные рецепторы. Это явление носит также название аллельное исключение . Выбор экспрессирующегося аллеля происходит рано в развитии, и этот выбор осуществляется случайно, в результате около половины клеток организма экспрессируют отцовский аллель, а другая половина клеток — материнский аллель. Иногда наблюдается тканеспецифичная моноаллельная экспрессия гена, в других тканях такой ген может экспрессироваться биаллельно. К случайной моноаллельной экспрессии аутосомных генов не относят случаи, когда разные аллели гена экспрессируются на различном уровне из-за полиморфизма в cis-регуляторных последовательностях гена .