Interested Article - SECIS-элемент

susan
  • 2020-07-29
  • 1

Предполагаемая вторичная структура элемента SECIS

SECIS-элеме́нт (от англ. se leno c ysteine i nsertion s equence — последовательность вставки селеноцистеина ) — участок РНК длиной около 60 нуклеотидов , формирующий шпилькообразную структуру . Этот (набор нуклеотидов) заставляет стоп-кодон UGA кодировать селеноцистеин. Поэтому элемент SECIS является неотъемлемым элементом мРНК, кодирующих селенопротеины ( белки , содержащие один или более остатков селеносодержащей аминокислоты селеноцистеина).

У бактерий элемент SECIS располагается почти сразу после кодона UGA, на который он воздействует. У архей и эукариот он находится в 3'-нетранслируемой области ( англ. 3' untranslated region, 3' UTR ) мРНК, и один элемент SECIS может заставить несколько UGA-кодонов кодировать селеноцистеин. У одного рода архей, , элемент SECIS расположен в 5'-нетранслируемой области ( англ. 5' untranslated region, 5' UTR ).

Элемент SECIS можно отличить по характерной последовательности нуклеотидов, то есть в нём определённые нуклеотиды занимают строго определённые места, а также характерной вторичной структуре. Вторичная структура обусловлена образованием водородных связей между комплементарными азотистыми основаниями , в результате чего формируется структура, похожая на шпильку. Эукариотический SECIS содержит неканонические пары A-G, которые редки в природе, однако чрезвычайно важны для нормального функционирования SECIS. Хотя и у эукариот, и у архей, и у бактерий SECIS имеет характерную форму шпильки, они не совмещаются друг с другом, то есть порядок расположения нуклеотидов, характерный для эукариотических SECIS, не является таковым для SECIS архей.

Было создано несколько компьютерных программ для поиска элемента SECIS в геноме, их работа основана на поиске специфических последовательностей и элементов вторичной структуры. Эти программы были использованы для поиска новых селенопротеинов .

Элемент SECIS обнаружен у самых разнообразных организмов из всех трёх доменов жизни, а также их вирусов .

Примечания

  1. Walczak, R; Westhof E., Carbon P., Krol A. A novel RNA structural motif in the selenocysteine insertion element of eukaryotic selenoprotein mRNAs (англ.) // RNA : journal. — 1996. — Vol. 2 , no. 4 . — P. 367—379 . — . — PMC .
  2. ↑ Lambert, A; Lescure A., Gautheret D. A survey of metazoan selenocysteine insertion sequences (англ.) // (англ.) ( : journal. — 2002. — Vol. 84 , no. 9 . — P. 953—959 . — doi : . — .
  3. Mix H., Lobanov A. V., Gladyshev V. N. SECIS elements in the coding regions of selenoprotein transcripts are functional in higher eukaryotes (англ.) // (англ.) ( : journal. — 2007. — Vol. 35 , no. 2 . — P. 414—423 . — doi : . — . — PMC .
  4. Cassago A., Rodrigues E. M., Prieto E. L., et al. Identification of Leishmania selenoproteins and SECIS element (англ.) // Mol. Biochem. Parasitol. : journal. — 2006. — Vol. 149 , no. 2 . — P. 128—134 . — doi : . — .
  5. Mourier T., Pain A., Barrell B., Griffiths-Jones S. A selenocysteine tRNA and SECIS element in Plasmodium falciparum (неопр.) // RNA. — 2005. — Т. 11 , № 2 . — С. 119—122 . — doi : . — . — PMC .
  6. G. V. Kryukov, S. Castellano, S. V. Novoselov, A. V. Lobanov, O. Zehtab, R. Guigó, and V. N. Gladyshev. Characterization of mammalian selenoproteomes (англ.) // Science. — 2003. — Vol. 300 , no. 5624 . — P. 1439—1443 . — doi : . — .
  7. Gregory V. Kryukov and Vadim N. Gladyshev. The prokaryotic selenoproteome (англ.) // (англ.) ( : journal. — 2004. — Vol. 5 , no. 5 . — P. 538—543 . — doi : . — . — PMC .
  8. Alain Krol. Evolutionarily different RNA motifs and RNA-protein complexes to achieve selenoprotein synthesis (англ.) // (англ.) ( : journal. — 2002. — Vol. 84 , no. 8 . — P. 765—774 . — doi : . — .
Источник —

susan
  • 2020-07-29
  • 1
  • Tags:

Same as SECIS-элемент

The title for the last searches