Генетическая история Кавказа
- 1 year ago
- 0
- 0
Генетическая генеалогия — раздел этногеномики [ источник не указан 895 дней ] , использующий ДНК-тесты совместно с традиционными генеалогическими методами исследования для выявления родства между людьми. и ДНК-профилирование позволяют строить предположения о степени генетического родства. Применение генетических методов для составления семейной истории широко распространилось в 21 веке с удешевлением тестов. Тестирования проводятся как частными группами, так и в рамках исследовательских проектов (см. Геногеография ).
По состоянию на 2019 год порядка 30 миллионов людей провели тесты , которые могут использоваться для выяснения родословной .
Обычно успех традиционных методов целиком зависит от сохранности и существования документов (например, переписных и писцовых книг, ревизских сказок и т. д.). Каждый человек несёт в себе своего рода «биологический документ», который не может быть утерян — это ДНК человека. Методы генетической генеалогии позволяют получить доступ как к тем частям ДНК, которые передаются практически неизменно по прямой мужской линии ( Y-хромосома ) и по женской линии ( мтДНК ), так и строить предположения по иным частям ДНК.
ДНК-тест Y-хромосомы позволяет, например, двум мужчинам определить, разделяют ли они общего предка по мужской линии или нет. ДНК-тесты не просто помощь в генеалогических исследованиях — это современный передовой инструмент, который генеалоги могут использовать для того, чтобы установить или опровергнуть родственные связи между несколькими людьми.
В процессе теста специальных ДНК-маркеров последовательность оснований в них повторяется множество раз (это называется « коротким тандемным повтором » ( англ. S hort T andem R epeat )). Например, специальное оборудование читает последовательность ДНК так:
Можно заметить, что TCTA повторяется 9 раз, а поскольку этот STR маркер называется DYS391 ( DNA Y-chromosome Segment № 391 ), делается запись: DYS391 = 9 .
В этом маркере число повторений может быть между 7 и 14. Y-хромосома уникальна в этом отношении, потому что не подвергается кроссинговеру с каждым новым поколением.
В результате слияния яйцеклетки и сперматозоида ребёнок получает гены , которые будут являться смесью генов отца и матери. Но Y-хромосома передается только от отца к сыну, таким образом, число повторов в маркерах сына будет тем же самым, что и у его отца. Генетические кузены также будут иметь ту же самую Y-хромосому, что и общий предок по мужским линиям.
Иногда число повторов увеличивается или уменьшается, обычно в одной из линий. Таким образом, отец может иметь DYS391 = 9 , а его сын - DYS391 = 10 . Это называется мутацией и случается, когда ДНК копируется неправильно. Зная примерную частоту возникновения мутаций, можно приблизительно оценить, когда жил последний общий предок (MRCA, Most Recent Common Ancestor) ( Y-хромосомный Адам , Митохондриальная Ева ).
После проверки и объединения результатов нескольких STR из одного генома определяется гаплотип , который может быть представлен в виде последовательности числа каждого маркера. Тест из 12 маркеров может быть похож на данную таблицу:
STR Маркеры Y-ДНК | ||||||||||||
19 | 385a | 385b | 388 | 389i | 389ii | 390 | 391 | 392 | 393 | 425 | 426 | |
Your Haplotype | 14 | 12 | 17 | 12 | 13 | 29 | 24 | 11 | 13 | 13 | 12 | 10 |
Маркеры STR записаны в заголовке, а сам гаплотип в ячейках таблицы. Так, например, для DYS19 написано 14 повторов. Гаплотип может дать информацию о том, откуда произошла ваша Y-хромосома, то есть проследить весь путь предков данного человека в течение 100 тысяч лет. Например, атлантический модальный гаплотип (AMH) определен только шестью маркерами, и это самый общий гаплотип в Западной Европе.
19 | 388 | 390 | 391 | 392 | 393 |
14 | 12 | 24 | 11 | 13 | 13 |
В базе данных «YHRD» каждый может сравнить его гаплотип с другими занесенными в неё образцами . Эта база данных содержит большое количество евразийских образцов, а теперь содержит ещё и образцы американцев и жителей восточной Азии, а также эскимосов . База данных YHDR использует до одиннадцати маркеров.
Кроме этого, — полезный инструмент исследователя, позволяет добавить результаты своих тестов Y-хромосомы в базу данных.
Интереснейший проект — база данных гаплотипов и генеалогических данных — «Sorenson Molecular Genealogy Foundation» . После заполнения в критериях поиска гаплотип программа покажет в результатах самые близкие по совпадениям гаплотипы с фамилиями людей и покажет генеалогическое древо , где будет показан предполагаемый общий предок и все другие образцы, с которыми совпали результаты маркеров. В этой базе данных зарегистрировано более 50000 гаплотипов. На данный момент проект закрыли.
Тестирование Y-хромосомы наиболее интересно, если сравнивать результаты двух и более человек совместно с результатами традиционных генеалогических поисков. Ниже описан гипотетический случай, где три генетических кузена с одной фамилией прошли тест.
В какой-то момент в прошлом этой семьи произошла единственная мутация в Y-хромосоме. Эта мутация оставила след в ДНК всех мужчин этой семьи. При сравнении их гаплотипов наблюдается следующее:
Y-DNA STR Markers | ||||||||||||
19 | 385a | 385b | 388 | 389i | 389ii | 390 | 391 | 392 | 393 | 425 | 426 | |
Кузен 1 | 14 | 12 | 17 | 12 | 13 | 29 | 24 | 11 | 13 | 13 | 12 | 10 |
Кузен 2 | 14 | 12 | 17 | 12 | 13 | 29 | 24 | 11 | 13 | 13 | 12 | 10 |
Кузен 3 | 14 | 12 | 17 | 12 | 13 | 29 | 24 | 11 | 14 | 13 | 12 | 10 |
В этой таблице большинство чисел совпадают, за исключением маркера, помеченного серым цветом. У участника № 3 показана мутация в DYS392. Участники № 1 и № 2, цифры которых полностью совпадают, очень близкие родственники. Участник № 3 тоже является их родственником, но более далеким.
Генетическая генеалогия помогает подтвердить результаты традиционных архивных исследований, показывая, что два или более человека с той же фамилией связаны родством, то есть имеют общего предка. Оценка времени жизни их гипотетического общего предка сводится к математике и статистике. Исследования показывают, что мутация в любом маркере — редкий случай, и происходит примерно каждые 500 поколений (то есть раз в 10000 лет). Если есть точное совпадение в 21 маркере, то среднее время, прошедшее с тех пор, когда жил общий предок (MRCA), - только 8,3 поколения. Если есть хотя бы одно единственное несовпадение (мутация), тогда время увеличивается до 20,5 поколений.
Сколько мутаций (несоответствий) должно присутствовать в результатах тестов двух людей, чтобы можно было исключить их принадлежность к одному клану? Большое количество мутаций говорит о более отдалённом родстве или его отсутствии. В случае с 21 маркером 2 мутации между гаплотипами — это пограничный результат, а 3 мутации обычно исключают вообще достаточно близкое родство между этими людьми (в пределах тысячелетий).
Правоохранительные органы могут использовать генетическую генеалогию для выявления лиц, виновных в преступлениях . Этот вид криминалистической, следственной генетической генеалогии стал особенно популярен после ареста Джозефа Деанджело — американского серийного убийцы , насильника и грабителя . Профиль ДНК преступника был помещён в генеалогическую базу данных GEDmatch, в результате чего были найдены его отдалённые родственники . Дальнейшее расследование помогло раскрыть личность преступника. В то же время такое использование генетической генеалогии вызвало негативную реакцию экспертов в области защиты персональной информации .
В 2019 году генетическая генеалогия была объявлена в некоторых СМИ «самым мощным средством борьбы с преступностью со времён открытия ДНК» .
Публичные ДНК-базы данных
Y-ДНК проекты относительно фамилий
Компьютерные программы для исследования Y-ДНК
Статьи по теме