Interested Article - Аллофикоцианин

Структура аллоцианина из цианобактерии Gloeobacter violaceus .

Аллофикоцианин (от Греческого : ἄλλος (аллос) — «другой», φύκος (фикос) — «водоросль», и κυανός (кианос) — «голубой») — светособирающий белок из семейства , в которое так же входят фикоцианин , фикоэритрин и фикоэритроцианин , и является вспомогательным пигментом для хлорофилла . Все фикобилипротеины растворимы в воде и следовательно не могут быть закреплены на мембране как каротиноиды , а вместо этого формируют закреплённые на мембране кластеры, называемые фикобилисомами . Аллофикоцианин поглощает и излучает красный свет (650 и 660 нм соответственно), и легко обнаруживается у цианобактерий и красных водорослях . Способность фикобилинов испускать свет используется в наборах иммунологического анализа. Аллофикоцианин довольно часто используют в проточной цитометрии , при счёте и сортировке клеток, и микроскопии . Для этого в него внедряют химическую сшивку.

Строение

Аллофикоцианин можно выделить из разных видов красных или сине-зелёных водорослей, каждый из которых синтезирует свою, несколько отличающуюся от других форму этой молекулы. Белок состоит из двух типов субъединиц (α и β), каждая несёт по одной хромофорной группе фикоцианобилина . Общую формулу белка можно описать как (αβ) 3 . Молекулярная масса аллофикоцианина 105 кДа.

Спектральные характеристики

Максимум поглощения 652 нм
Добавочный максимум поглощения 625 нм
Максимум излучения 657.5 нм
Сдвиг Стокса 5.5 нм
Коэффициент экстинкции 2.4 x 10 5 M −1 см −1
Квантовый выход 0.68
Яркость 1.6 x 10 5 M −1 см −1

Сшитый аллофикоцианин

Как упоминалось выше, чтобы использовать аллофикоцианин в иммунологическом анализе, его необходимо химически сшить, чтобы предотратить диссоциацию его субъединиц, что довольно часто происходит в стандартных физиологических буферах. Традиционным методом для этого служит смешивание с 1-этил-3-(3-диметиламинопропил)карбодиимидом — мощным сшивочным агентом. Затем его обрабатывают восьми молярным раствором мочевины , а затем дают ренатурировать, но уже в физиологическом буфере. Такая процедура позволяет избавится от несшившихся субъединиц. Существуют альтернативные способы, использование которых позволяет сохранить нативную структуру тримера и получить более яркий конечный продукт .

Примечания

  1. George C. Papageorgiou, Thoula Lagoyanni. Effects of chaotropic electrolytes on the structure and electronic excitation coupling of glutaraldehyde- and diimido ester-cross-linked phycobilisomes. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) — Bioenergetics Volume 724, Issue 3, 30 September 1983, Pages 323—332
  2. Yeh SW, Ong LJ, Clark JH, Glazer AN. Fluorescence properties of allophycocyanin and a crosslinked allophycocyanin trimer. Cytometry. 1987 Jan; 8(1):91-5.
  3. от 1 февраля 2015 на Wayback Machine ; High fluorescent intensity cross-linked allophycocyanin. Assigned to от 11 февраля 2014 на Wayback Machine
Источник —

Same as Аллофикоцианин