Во время войны, пребывая в эвакуации вместе с институтом в
Уфе
, Бабко выполнял работы важные для оборонной промышленности: изучал цветные и редкостные элементы уральских залежей руды, изучал приборы зажигания авиамоторов, вел организацию контроля производства некоторых новых сплавов. Позже Анатолий Кириллович создал наверное, самую большую в Украине школу химиков-аналитиков. Она была известна также и за границей. В школе проводились важные исследования в области аналитической химии.