Колимовирусы ( лат. Caulimoviridae ) — семейство ДНК-содержащих вирусов растений с механизмом обратной транскрипции и двуцепочечной ДНК , то есть вирусов, содержащих стадию обратной транскрипции в своём репликативном цикле.

Структура вирионов

Вирион является простым, без липидной оболочки. Морфология нуклеокапсида представлена 2 основными формами: палочковидной и икосаэдрической. Форма нуклеокапсида зависит от размера вируса. Вирионы палочковидной формы имеют диаметр приблизительно 35—50 нм и могут быть в длину до 900 нм. Икосаэдрический капсид имеет диаметр 45—50 нм и примерно такую же длину.

Структура генома и репликация

Геном данного вируса представляет собой несегментированную линейную или циклическую двуцепочечную ДНК . Размер генома насчитывает приблизительно 6—8 kbs. В зависимости от вируса геном может иметь либо одну открытую рамку считывания (ORF), как например у , или больше восьми как у . Геном данного вирусного семейства кодирует такие белки: обратная транскриптаза , протеаза , структурные белки, а также остальные белки с неизвестными функциями, но так или иначе нужные для репликации вируса.

Репликация происходит как в цитоплазме, так и в ядре клетки-хозяина. Сначала, вирусный геном попадает в цитоплазму. Там он формирует суперскрученную минихромосому. На ней транскибируется мРНК вируса, которая избыточна (потому что в некоторые части генома експресируются дважды). Эта транскибируемая РНК попадает в цитоплазму, где она играет две роли. Она может использоваться либо как шаблон для трансляции вирусных белков, либо подвергаться обратной транскрипции до дцДНК, с помощью вирусной ревертазы . Так как эти вирусы имеют много общего с ретровирусами , их часто объединяют в группу параретровирусов. Однако здесь существует важное различие между ретровирусами и вирусами семейства Caulimoviridae . В отличие от ретровирусов они не интегрируют свой геном в хромосомы , так как их геном не кодирует фермента интегразы

Однако существуют виды семейства колимовирусов, такие как , которые изредка (в основном в стрессовых условиях) могут интегрировать свой геном в хозяйственный геном . Обычно такие провирусы часто называют эндогенными параретровирусами (EPRVs).

Классификация

По данным Международного комитета по таксономии вирусов (ICTV) , на март 2016 года в семейство включают 8 родов :

• Род (40 видов)
  • Типовой вид
• Род (11 видов)
  • Типовой вид
• Род (2 вида)
  • Типовой вид
• Род (1 вид)
  • Вид
• Род (1 вид)
  • Вид
• Род (2 вида)
  • Типовой вид
• Род (4 вида)
  • Типовой вид
• Род (1 вид)
  • Вид

Вид имеет необычную организацию генома, которое делает его уникальным видом .

Примечания

Ссылки

• от 17 июля 2010 на Wayback Machine
• Livia Stavolone, Antonio Ragozzino, and Thomas Hohn. (2003). Journal of General Virology 84 : 3459—3464.