В некрологе ему С.Ф. Ольденбург писал, что в списке публикаций покойного «нет ни одной сколько-нибудь значительной по объёму книги, это почти только одни статьи, в большинстве случаев даже небольшие статьи». Далее, однако, как отмечает С. Д. Серебряный, это «порицание» переходит в похвалу и говорится, что даже небольшие работы покойного на самом деле «дорогого стоят»)
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Труды
Handschriften-Reste in Estrangelo-Schrift aus Turfan, Chinesisch-Turkistan. I Teil // SPAW, 1904, S. 348—352.
Handschriften-Reste in Estrangelo-Schrift aus Turfan, Chinesisch-Turkistan. II Teil // Anhang zu APAW, 1904.
Über die kultur- und sprachgeschichtliche Bedeutung eines Teils der Turfan-Handschriften // Zeitschrift für Ethnologie 37, 1905, S. 414—415.
Eine Hermas-Stelle in manichäischer Version // SPAW, 1905, S. 1077—1083.
Beitrag zur genaueren Bestimmung der unbekannten Sprachen Mittelasiens // SPAW, 1907, S. 958—960.
Antrittsrede bei Aufnahme in die Königlich Preußische Akademie der Wissenschaften // SPAW, 1907.
Die persischen Kalenderausdrücke im chinesischen Tripitaka // SPAW, 1907, S. 458—465.
Neutestamentliche Bruchstücke in Soghdischer Sprache // SPAW, 1907, S. 260—270.
Uigurica I. 1. Die Anbetung der Magier, ein christliches Bruchstück. 2. Die Reste des buddhistischen Goldglanz-Sūtra. Ein vorläufiger Bericht // APAW, 1908.
Ein iranisches Sprachdenkmal aus der nördlichen Mongolei // SPAW XXVII, 1909, S. 726—730.
Uigurica II // APAW 1911.
Der Hofstaat eines Uiguren-Königs // Festschrift V. Thomsen zur Vollendung des 70. Lebensjahres, Leipzig, 1912, S. 207—213.
Soghdische Texte. I // APAW, 1912; Berlin, 1913.
Ein Doppelblatt aus einem manichäischen Hymnenbuch (Maḥrnâmag) // APAW 1912; Berlin, 1913.
Zwei Pfahlinschriften aus den Turfanfunden. 1. Die uigurische Inschrift auf dem Pfahle I B 4672. 2. Die chinesische Pfahlinschrift // APAW 1915, Nr.3, 1915.
Ein syrisch-neupersisches Psalmenbruchstück aus Chinesisch-Turkistan // Festschrift E. Sachau, ed. G. Weil. Berlin, 1915, S. 215—222.
F. W. K. Müller und E. Sieg.
Maitrisimit und Tocharisch // SPAW, 1916, S. 395—417.
Toxri und Kuišan (Küšän) // SPAW, 1918, S. 566—586.
Uigurische Glossen // Festschrift für F. Hirth (Ostasiatische Zeitschrift 8 (1919—1920), Berlin 1920, S. 310—324.
Uigurica III. Uigurische Avadāna-Bruchstücke (I—VIII) // APAW, 1922.
Reste einer soghdischen Übersetzung des Padmacintāmaṇi-dhāraṇī-sūtra // SPAW,1926, S. 2-8.
Eine soghdische Inschrift in Ladakh // SPAW, 1925; Berlin 1926, S. 371—372.
Ein uigurisch-lamaistisches Zauberritual aus den Turfanfunden // SPAW, 1928, S. 381—386.
F. W. K. Müller und A. von Gabain.
Uigurica IV // SPAW, 1931, S. 675—727.
F. W. K. Müller und W. Lentz.
Soghdische Texte. II. Aus dem Nachlaß herausgegeben von Wolfgang Lentz // SPAW 1934, S. 504—607.
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Literatur-Bruchstücke aus Chinesisch-Turkestan // SPAW, 1905, S. 964—978.
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Gedanken zur Bearbeitung der alttürkischen buddhistischen Texte // H. Klengel und W. Sundermann (publishers). Ägypten Vorderasien Turfan, S. 134—140.