В начале карьеры Пабло Себальос выступал за клуб «
Соль де Америка
», но известность он получил после подписания контракта с одним из грандов мексиканского футбола, «
Крус Асулем
», где на тот момент играли его соотечественники,
Кристиан Риверос
и
Карлос Бонет
.
После двух сезонов, проведённых в Мексике, Себальос вернулся на родину, в «
Серро Портеньо
». Спустя ещё год он перешёл в стан принципиального соперника своей прежней команды, клуб «
Олимпию
», с которой в конце года стал чемпионом Парагвая, причём это был первый титул чемпионов страны для «Олимпии» за 11 лет — с 2000 года.
12 июля 2012 года подписал контракт с
самарскими
«
Крыльями Советов
»
. 21 января 2013 года был отдан в аренду в
эквадорский
клуб «
Эмелек
»
. В феврале 2014 года перешёл в клуб «
Ботафого
». В начале 2015 года перешёл в клуб «
Атлетико Насьональ
». В 2015 году выступал за «Олимпию», с которой стал чемпионом Парагвая. В 2016 году перешёл в «Либертад» и вновь выиграл Апертуру. В 2017 году вернулся в «Соль Де Америку». Летом 2018 года вернулся в «
Ориенте Петролеро
». В 24 матчах за клуб забил 11 голов.
Был заявлен на чемпионат России как
Себайос
, такое же написание использовалось на официальном сайте клуба «Крылья Советов» и на футболке игрока; представители клуба объясняли подобное написание особыми правилами передачи парагвайского варианта испанского языка на русский
(неопр.)
. Дата обращения: 21 января 2013.
30 августа 2017 года.
(неопр.)
. Дата обращения: 21 января 2013.
14 апреля 2013 года.