С октября
1901 года
— декан теологического факультета Ян Фиялек отказался принимать от абитуриентов родословные на украинском языке. Эти и другие притеснения украинского в университете привели к так называемой «сецессии» украинских студентов из Львовского университета в декабре
1901 года
. Всего к концу 1901 университет покинули 583 украинских студента. Теологический факультет оставило 215 студентов, после чего обучение на нём в зимнем семестре 1901/1092 годов продолжало только 85 человек.
Изучал средневековую историю
Польши
и
ВКЛ
, историю культуры, канонического права.
Подготовил к изданию сборник латинских грамот
«Кодекс дипломатический кафедры Виленской и диоцезии»
«Kodeks dyplomatyczny katedry i diecezji wileńskiej = Codex diplomaticus ecclesiae cathedralis necnon Dioeceseos Vilnensis». T. 1 (1387—1507). — Krakow, 1932).
Библиография
Ustalenie chronologii biskupow Włocławskich / Jan Fijałek. — Krakow, 1894. — 110 s.
Średniowieczne biskupstwa kościoła wschodniego na Rusi i Litwie // Kwartalnik Historyczny. 1896. T. 10,
Biskupstwa greckie w ziemiach ruskich od połowy wieku XIV: Na podstawie źrudeł greckich // Kwartalnik Historyczny. — 1897. — T. 11.
Studia do dziejow Uniwersytetu Krakowskiego i jego Wydziału Teologicznego w XV wieku/ Jan Fijałek. — Krakow, 1898. — 182 s.
Moderniści katoliccy Kościoła Lwowskiego w wieku XVI; sam X. arcybiskup Paweł Tarło i mistrz Jan Trzciana kanonik-kaznodzieja katedralny// Pamiętnik Literacki. — 1908. — R. 7. — № 1/2. — S. 8 — 56; № 3/4. — S. 395—430; 1910. — R. 9. — № 1/4. — S. 173—213.
Kościoł rzymsko-katolicki na Litwie. Uchrześcijanienie Litwy przerz Polskę i zachowanie w niej języka ludu po koniec Rzeczypospolitej // Polska i Litwa w dziejowym stosunku. —
Warsz.
; Lublin; Łódź; Kraków;
N. Y.
, 1914. — S. 64—68, 73—75.
Uchrześcijanienie Litwy przez Polskę i zachowanie w niej języka ludu. — Krakow: druk Anczyca i Społki. — 1914. — 297 s.
Opisy Wilna aż do połowy wieku XVII-go // Ateneum Wileńskie. 1923. — R. 1, № 3—4; 1924. R. 2, z. 5—6.
Dwaj dominikanie krakowscy: Jan Biskupiec i Jan Falkenberg. — Lwow, 1925. — 82 s.
Zbior dokumentow zakonu paulinow w Polsce. — Krakow, 1938. — 316 s.
Życie i obyczaje kleru w Polsce średniowiecznej: na tle ustawodawstwa synodalnego. — Krakow: Universitas, 1997. — 96 s.
Переписка с попечителем Кременецкого лицея, с библиотекой Польской Академии Художеств и с Волынским Обществом Друзей Наук о проведении заседаний по изданию работы Я. Фиялка «О началах єпископств Владимирського и Хелмского» и проведение работ по сбору материалов по библиографии Волыни, 1935—1938 гг., 95 стр.// Государственный архив Ровенской области. — Ф. 160. — Оп. 1. — Д. 71.
Рукопись доктора Яна Фиялека о возникновении Волынских епископств вначале XIV — XV веках на 67 ст. // Государственный архив Ровенской области. — Ф. 160. — Оп. 1. — Д. 49.
Литература
Prawo Kanoniczne. — 1972. — № 3/4 (библиография трудов Я. Фиялека).
Vetulani A. Ks. Jan Fijałek, historyk kościoła Polskiego (1864—1936). // Portrety uczonych polskich. 51 sylwetek humanistow. — Krakow: wydawnictwo Literackie, 1974. — S. 167—181.
Wierzbicka M.
Fijałek Jan Nepomucen / Maria Wierzbicka. / Słownik historykow polskich. — Warszawa: Wiedza powszechna, 1994. — S. 132—133.
Баженов Л.
Історичне краєзнавство Правобережної України XIX — на початку XX ст.: Становлення. Історіографія. Біобібліографія. / Лев Баженов. — Хмельницький: Доля , 1995. — 255 с.
Білас Н.
Викладання біблійної археології у Львівському університеті / Наталя Білас // Вісник Інституту археології. — 2007. — Вип. 2. — С. 80—87.
Ярмошик І.
Польська історіографія 1800—1939 рр. суспільно-політичного і культурно-духовного розвитку Волині. — Житомир: Волинь, 2010. — 512 с.
Ярмошик І.
Українська православна церква в дослідженнях польського історика Яна Фіялека (1864—1936 рр.). // Наукові праці історичного факультету Запорізького нац. ун-ту. — Запоріжжя : ЗНУ, 2012. — Вип. XXXIV. — С. 146—149.