Шифр КФ («классификация ферментов»), или код фермента — классификационный номер фермента по международной иерархической классификации. Принятая система классифицирует ферменты по группам и индексирует индивидуальные ферменты, что важно для стандартизации исследований.

Классификация ферментов основана и периодически обновляется Комиссией по ферментам ( англ. Enzyme commission , отсюда термин «EC number», принятый в англоязычной литературе) при . Каждый шифр КФ ассоциирован также с рекомендованным названием соответствующего фермента. Классифицировано более 3500 ферментов.

Принцип классификации

Классификация ферментов учитывает реакционную и субстратную специфичности ферментов, а не их белковую структуру. Шифр КФ определяет химическую реакцию , катализируемую ферментом. По этой причине аналогичные ферменты (иногда десятки) из различных организмов имеют один КФ, несмотря на структурные различия.

Иногда различные ферменты одного организма имеют один КФ. Например, панкреатическая липаза и печёночная липаза обе принадлежат к КФ , поскольку катализируют одну и ту же химическую реакцию ( гидролиз в триглицериде ), хотя первый фермент является ферментом пищеварения и работает в кишечнике , а второй относится к ферментам обмена липопротеинов в крови .

Существует база данных UniProt , которая идентифицирует каждый белок по его первичной последовательности. Обе базы данных дополняют друг друга.

Формат шифра

Каждый классификационный номер содержит сокращение КФ и последовательность из четырёх чисел, разделённых точками, и составляется по определенному принципу. Каждое последующее число представляет собой всё более и более уточняющую классификацию фермента. Так как база данных постоянно обновляется, коды могут меняться, причём коды некоторых уровней могут оставаться незаполненными.

Класс

• Код первого уровня ( первое число , может быть от 1 до 7) указывает номер одного из семи главных классов ферментов (см. таблицу Коды первого уровня ).

Подкласс

• Код второго уровня ( второе число ) означает подкласс, характеризующий основные виды субстратов , участвующих в данном типе химических реакций. Например, у трансфераз вторая цифра указывает на природу той группы, которая подвергается переносу, у гидролаз — на тип гидролизуемой связи и т. д.

Под-подкласс

• Код третьего уровня ( третье число ) определяет более частные подгруппы (под-подклассы), отличающиеся природой химических соединений доноров или акцепторов , участвующих в данной подгруппе реакций. У гидролаз , например, эта цифра уточняет тип гидролизуемой связи, а у лиаз — тип отщепляемой группы и т. д. Первые 3 числа шифра точно определяют тип фермента.

Код четвёртого уровня

Наконец, все ферменты, относящиеся к данному под-подклассу, получают свой порядковый номер ( четвёртое число в шифре).

• Например, глюкозоксидазе присвоен шифр КФ , что означает:

КФ 1 — Оксидоредуктазы

КФ 1.1 —

КФ 1.1.3 — Оксидоредуктазы, окисляющие группу CH-OH и восстанавливающие кислород .

КФ 1.1.3.4 — Оксидоредуктазы, окисляющие глюкозу в присутствии кислорода . Всего известно 3 глюкозоксидазы из разных организмов.

Коды первого уровня

Класс	Катализируемая реакция	Тип реакции	Примеры
КФ 1 Оксидоредуктазы	Окислительно-восстановительные реакции. Перенос атомов H и O или электронов от одного субстрата на другой	AH + B → A + BH ( восстановление ) A + O → AO ( окисление )	дегидрогеназа , оксидаза
КФ 2 Трансферазы	Перенос функциональной группы от одного субстрата на другой. Это может быть метильная, ацильная, фосфатная группа или аминогруппа.	AB + C → A + BC	аминотрансфераза , киназы
КФ 3 Гидролазы	Образование двух продуктов из одного субстрата в результате гидролиза .	AB + H 2 O → AOH + BH	липаза , амилаза , протеаза , фосфатаза
КФ 4 Лиазы (синтазы)	Негидролитическое добавление или удаление группы к или от субстрата. Образование C-C, C-N, C-O или C-S связи.	RCOCOOH → RCOH + CO 2	карбоксилазы
КФ 5 Изомеразы	Внутримолекулярная перестановка, то есть изомеризация молекулы субстрата.	AB → BA	изомеразы , и др.
КФ 6 Лигазы (синтетазы)	Соединение двух молекул в результате синтеза новой C-O, C-S, C-N или C-C связи , сопряжённое с одновременным гидролизом АТФ .	X + Y+ ATP → XY + ADP + P i	синтетазы
КФ 7 Транслоказы	Перенос ионов или молекул через мембраны или их разделение в мембранах.		мембранные транспортные белки

История

Схема номенклатуры ферментов была впервые разработана в 1955 году , когда Международный конгресс биохимии в Брюсселе учредил Комиссию по ферментам ( Enzyme Commission ). Первая версия номенклатуры появилась в 1961 году и включала около 900 ферментов, в версии 1978 года было более 2000 ферментов. Версия 1995 года содержит более 3500 ферментов.

См. также

• Ферменты

Примечания

Ссылки