Interested Article - НевГен

НевГен или NevGen — один из мировых проектов предсказания гаплогрупп , разработанный под руководством Сербского ДНК-проекта и Общества сербских генеалогов «Порекло» . Авторы — Ацо Невский (псевдоним) и Милош Цеткович-Гентула. Программа создана в мае 2014 года как настольное приложение для нужд сербских генеалогов, с конца 2015 года существует и онлайн-версия программы. НевГен использует фитнес-компьютер, а также байесовско-аллельно-частотный подход ( англ. Bayesian-Allele-Frequency Approach ) для предсказания того, какой гаплогруппе соответствует гаплотип Y-STR. Помимо этого, он использует взаимозависимость значений различных маркеров STR при вычислении вероятностей ветвления. Постоянный прогресс и многочисленные научные работы, в которых он применялся, делают его одним из наиболее известных в мире предсказателем гаплогруппы Y-ДНК .

Применение в науке

Используется в следующих научных работах (список может быть расширен):

  • Dogan S., Babic N., Gurkan C., Goksu A., Marjanovic D., Hadziavdic V. Y-chromosomal haplogroup distribution in the Tuzla Canton of Bosnia and Herzegovina: A concordance study using four different in silico assignment algorithms based on Y-STR data (англ.) // Homo : journal. — 2016. — Vol. 67 , no. 6 . — P. 471—483 . — doi : .
  • Szargut M., Ossowski A., Kuś M., Zielińska G., Rębacz-Maron E. Haplogroup prediction by different Y-STR-based tools in samples from United Republic of Tanzania (англ.) : journal. — 2016. — doi : .
  • Mustafin K. K., Alborova I. E., Semenov A. S., Vishnevsky V. P. Haplogroup Analysis for a Medieval Russian Burial оf 16th–17th Centures in Radonezh (Moscow Area) (англ.) // Studia Slavica et Balcanica Petropolitana : journal. — 2018. — Vol. 24 , no. 2 . — P. 169—180 . — doi : .
  • Diepenbroek M., Cytacka S., Szargut M., Arciszewska J., Zielińska G., Ossowski A. Analysis of male specific region of the human Y chromosome sheds light on historical events in Nazi occupied eastern Poland (англ.) // International journal of legal medicine : journal. — 2018. — P. 395—409 . — doi : .
  • Poriswanish N., Neumann R., Wetton J. H., Wagstaff J., Larmuseau M. H., Jobling M. A., May, C. A. Recombination hotspots in an extended human pseudoautosomal domain predicted from double-strand break maps and characterized by sperm-based crossover analysis (англ.) // (англ.) : journal. — 2018. — Vol. 14 , no. 10 . — doi : .
  • Kačar T., Stamenković G., Blagojević J., Krtinić J., Mijović D., Marjanović D. Y chromosome genetic data defined by 23 short tandem repeats in a Serbian population on the Balkan Peninsula (англ.) // Annals of human biology : journal. — 2019. — Vol. 46 , no. 1 . — P. 77—83 . — doi : .
  • Al-Snan N. R., Messaoudi S. A., Khubrani Y. M., Wetton J. H., Jobling M. A., Bakhiet M. Genetic variation at 27 y-strs in four regions of bahrain (англ.) // bioRxiv : journal. — 2019. — doi : .
  • Kiesler K. M., Andreaggi K. S., Ring J. D., Taylor C. R., Marshall C. K., Vallone P. M. Sequencing of full mitochondrial genomes for NIST population samples (неопр.) // (англ.) . — 2019. — С. 452—453 .
  • López-Ramírez Y. L., Aguilar-Velázquez J. A., López-Armenta M., Ruiz-Hernández M., Rangel-Villalobos H. Paternal lineages and forensic parameters based on 23 Y-STRs (Powerplex® Y23) in Mestizo males from Mexico City (англ.) // International journal of legal medicine : journal. — 2019. — P. 199—202 . — doi : .
  • Szargut M., Diepenbroek M., Zielińska G., Cytacka S., Arciszewska J., Jałowińska K., Ossowski A. Is MPS always the answer? Use of two PCR-based methods for Y-chromosomal haplotyping in highly and moderately degraded bone material (англ.) // (англ.) : journal. — 2019. — P. 181—189 . — doi : .
  • Daniels-Higginbotham J., Gorden E. M., Farmer S. K., Spatola B., Damann F., Bellantoni N., Parson W. DNA Testing Reveals the Putative Identity of JB55, a 19th Century Vampire Buried in Griswold, Connecticut (англ.) // Genes : journal. — 2019. — P. 1—11 . — doi : .
  • Jannuzzi J., Ribeiro J., Alho C., Arão G., Cicarelli R., Corrêa H., Mota M. F. Male lineages in Brazilian populations and performance of haplogroup prediction tools (англ.) // (англ.) : journal. — 2020. — Vol. 44 . — doi : .
  • Fóthi E., Gonzalez A., Fehér T., et al. Genetic analysis of male Hungarian Conquerors: European and Asian paternal lineages of the conquering Hungarian tribes (англ.) // Archaeol Anthropol Sci : journal. — 2020. — Vol. 12 , no. 31 . — P. 77—83 . — doi : .

См. также

Ссылки

  • (серб.)
Источник —

Same as НевГен