Interested Article - CAF-1

CAF-1 (chromatin assembly factor-1) представляет собой комплекс, состоящий из трёх субъединиц: (p150), (p60) и p50. Этот комплекс переносит тетрамер (четвёрку) гистонов H3/H4 на реплицирующуюся ДНК . CAF-1 участвует в создании клеточной эпигенетической памяти, необходимой для поддержания индивидуальных черт ( дифференцировки ) соматических клеток .

CAF-1 требуется для пространственной организации и эпигенетической маркировки доменов гетерохроматина в плюрипотентных эмбриональных стволовых клетках .

Путём подавления активности CAF-1 необходимой для сборки хроматина можно перевести эмбриональные стволовые клетки в состояние тотипотентности характерное для ранних эмбрионов 2-клеточной стадии .

Подбором оптимального уровня CAF-1 и факторов транскрипции можно повысить эффективность репрограммирования на несколько порядков и сократить продолжительность репрограммирования в ИПСК до всего лишь 4 дней. Очевидно, подавление активности CAF-1 приводит к образованию более доступной структуры хроматина на энхансерных участках во время ранних стадий репрограммирования. Эти изменения сопровождаются снижением численности соматических гетерохроматиновых доменов, увеличением связывания с участками, отвечающими за плюрипотентность , и активацией соответствующих генов. Подавление CAF-1 также повышает эффективность прямой трансдифференцировки В-клеток в макрофаги и фибробластов в нейроны .

Предполагается, что во время дифференцировки стволовых клеток и клеток-предшественников CAF-1 поддерживает точность и правильность клонирования клеток, целостность клонов, контролируя доступность хроматина в специфических локусах и ограничивая связывание транскрипционных факторов, таких как , что предотвращает их эктопическое связывание на альтернативных сайтах. Истощение CAF-1 способствует открытию хроматина в определенных локусах, что приводит к конкурентному связыванию факторов транскрипции на альтернативных сайтах и как результат к неоднородности программ транскрипции, что приводит к неоднородным результатам дифференцировки

Примечания

Kaufman PD, Kobayashi R, Kessler N, Stillman B (1995). The p150 and p60 subunits of chromatin assembly factor I: a molecular link between newly synthesized histones and DNA replication. Cell 81(7), 1105–14. doi : . PMID
Smith, S., & Stillman, B. (1989). . Cell, 58(1), 15-25.DOI:
Hoek, M. & Stillman, B. (2003). Chromatin assembly factor 1 is essential and couples chromatin assembly to DNA replication in vivo. Proc. Natl Acad. Sci. USA 100, 12183–12188
Houlard M, Berlivet S, Probst AV, Quivy J-P, Héry P, Almouzni G, et al. (2006). от 21 января 2022 на Wayback Machine . PLoS Genet 2(11): e181. doi :
Ishiuchi, T., Enriquez-Gasca, R., Mizutani, E., Bošković, A., Ziegler-Birling, C., Rodriguez-Terrones, D., ... & Torres-Padilla, M. E. (2015). . Nature Structural & Molecular Biology 22, 662–671 doi :
Cheloufi S., Elling U., Hopfgartner B. et al., & Zuber J., Hochedlinger K. (2015). . Nature 528, 218–224 doi :
Franklin, R., Guo, Y., He, S., Chen, M., Ji, F., Zhou, X., ... & Cheloufi, S. (2022). Regulation of chromatin accessibility by the histone chaperone CAF-1 sustains lineage fidelity. Nature Communications, 13(1), 1-17. PMID PMC doi :

Литература

. ScienceDaily
Yu, Z., Liu, J., Deng, W. M., & Jiao, R. (2015). . Cellular and Molecular Life Sciences, 72(2), 327-337. doi :
Kaufman, P. D. (2015). !. Nature structural & molecular biology, 22(9), 648-650. doi :
Polo, S. E., & Almouzni, G. (2015). Chromatin dynamics after DNA damage: The legacy of the access–repair–restore model. DNA repair. 36, 114–121 doi :
Wang, Z., Wu, R., Nie, Q., Bouchonville, K. J., Diasio, R. B., & Offer, S. M. (2021). . Journal of the National Cancer Center, 1(1), 15-22.
Sauer, P. V., Gu, Y., Liu, W. H., Mattiroli, F., Panne, D., Luger, K., & Churchill, M. E. (2018). Mechanistic insights into histone deposition and nucleosome assembly by the chromatin assembly factor-1. Nucleic acids research, 46(19), 9907-9917. PMID PMC doi :