Зекцер — еврейская фамилия. Известные носители:

• Зекцер, Игорь Семёнович (1937—2016) — советский (российский) гидрогеолог, доктор геолого-минералогических наук.
• (род. 1928) — организатор «Новой коммунистической партии», диссидент, мемуарист.
• Зекцер, Иосиф Абрамович (1867—1933) — российский и советский архитектор.