Interested Article - ТАТА-бокс

ashanti
  • 2021-07-06
  • 1

Упрощённая модель транскрипции эукариот . 1 — ; 2 — ТАТА-бокс с РНК-полимеразой и транскрипционными факторами ; 3 — энхансер , связанный с активирующим белком

ТАТА-бокс ( - повторяющаяся последовательность нуклеотидов, которая формирует транскрипционный или регуляторный сигнал), или бокс Хогнесса, ящик Прибнова — консервативный мотив ДНК ( цис-регуляторный элемент ) эукариот , имеющий последовательность 5'- TATAAA -3' . ТАТА-бокс располагается в промоторной области генов у архей и эукариот примерно на 30 нуклеотидов выше сайта начала транскрипции . По наличию ТАТА-бокса можно узнать матричную цепь ДНК, которая будет транскрибироваться . С ним связываются транскрипционные факторы , привлекающие РНК-полимеразу к сайту начала транскрипции (например, фактор TFIID, или ТАТА-фактор ). Таким образом, ТАТА-бокс функционально эквивалентен Прибнов-боксу у бактерий .

Функционирование

Пространственная структура ТАТА-связывающего белка

В норме ТАТА-бокс в начале транскрипции связывается с (TBP), который расплетает ДНК. АТ-богатый участок облегчает расплетание, поскольку 2 водородные связи в паре А-Т менее прочны, чем 3 в паре G-C . TBP представляет собой необычный белок , который связывается с малой бороздкой ДНК и состоит из β-слоёв .

ТАТА-бокс, как правило, обнаруживается в сайтах связывания РНК-полимеразы II . Транскрипционный фактор связывается с ТАТА-боксом, и вслед за ним к его верхней части присоединяется другой транскрипционный фактор, , а к нижней части — . Связыванию с этими факторами также способствует расплетание ДНК, индуцированное TBP . РНК-полимераза II распознаёт этот многобелковый комплекс и связывается с ним в сопровождении различных других транскрипционных факторов, таких как , и . Тем самым инициируется транскрипция, и РНК-полимераза II движется по цепи ДНК, а TFIID и TFIIA остаются связанными с ТАТА-боксом. В дальнейшем это может облегчить присоединение дополнительных молекул РНК-полимеразы II. Кроме того, показано, что ТАТА-бокс может инициировать транскрипцию, осуществляемую не только РНК-полимеразой II, но и РНК-полимеразой III .

Распространение

ТАТА-бокс является очень древним, высококонсервативным на протяжении эволюции промоторным мотивом эукариот и первым идентифицированным таким мотивом. Тем не менее, у позвоночных ТАТА-бокс не очень широко распространён . У большей части генов человека ТАТА-бокс отсутствует, и в них его роль выполняет или более сложный промотор типа . Примерно 24 % генов человека содержат ТАТА-бокс, расположенный в пределах центрального промотора (по данным другим исследователей, ТАТА-бокс встречается в 10 % промоторов генов человека ). Чуть ранее анализ приблизительно тысячи генов выявил наличие ТАТА-бокса в промоторах 32 % из них . Установлено, что наиболее широко ТАТА-бокс распространён среди генов, вовлечённых в клеточные ответы и органогенез. Судя по всему, промоторы с ТАТА-боксом свойственны генам, специфичным для клеток определённого типа, в то время как промоторы CpG характерны для генов домашнего хозяйства .

См. также

Примечания

  1. ↑ . Дата обращения: 6 марта 2014. 8 марта 2014 года.
  2. Smale S. T. , Kadonaga J. T. (англ.) // Annual review of biochemistry. — 2003. — Vol. 72. — P. 449—479. — doi : . — . [ ]
  3. ↑ , p. 4.
  4. , с. 265.
  5. Арефьев В. А., Лисовенко Л. А. ТАТА-бокс // Англо-русский толковый словарь генетических терминов. — М. : Изд-во ВНИРО, 1995. — ISBN 5-85382-132-6 .
  6. Patikoglou G. A. , Kim J. L. , Sun L. , Yang S. H. , Kodadek T. , Burley S. K. (англ.) // Genes & development. — 1999. — Vol. 13, no. 24 . — P. 3217—3230. — . [ ]
  7. Wang Y. , Jensen R. C. , Stumph W. E. (англ.) // Nucleic acids research. — 1996. — Vol. 24, no. 15 . — P. 3100—3106. — . [ ]
  8. Yang C. , Bolotin E. , Jiang T. , Sladek F. M. , Martinez E. (англ.) // Gene. — 2007. — Vol. 389, no. 1 . — P. 52—65. — doi : . — . [ ]
  9. Carninci P. , Sandelin A. , Lenhard B. , Katayama S. , Shimokawa K. , Ponjavic J. , Semple C. A. , Taylor M. S. , Engström P. G. , Frith M. C. , Forrest A. R. , Alkema W. B. , Tan S. L. , Plessy C. , Kodzius R. , Ravasi T. , Kasukawa T. , Fukuda S. , Kanamori-Katayama M. , Kitazume Y. , Kawaji H. , Kai C. , Nakamura M. , Konno H. , Nakano K. , Mottagui-Tabar S. , Arner P. , Chesi A. , Gustincich S. , Persichetti F. , Suzuki H. , Grimmond S. M. , Wells C. A. , Orlando V. , Wahlestedt C. , Liu E. T. , Harbers M. , Kawai J. , Bajic V. B. , Hume D. A. , Hayashizaki Y. (англ.) // Nature genetics. — 2006. — Vol. 38, no. 6 . — P. 626—635. — doi : . — . [ ]
  10. Suzuki Y. , Tsunoda T. , Sese J. , Taira H. , Mizushima-Sugano J. , Hata H. , Ota T. , Isogai T. , Tanaka T. , Nakamura Y. , Suyama A. , Sakaki Y. , Morishita S. , Okubo K. , Sugano S. (англ.) // Genome research. — 2001. — Vol. 11, no. 5 . — P. 677—684. — doi : . — . [ ]

Литература

  • Lucy W. Barrett, Sue Fletcher, Steve D. Wilton. . — SpringerBriefs in Biochemistry and Molecular Biology, 2013. — 57 p. — ISBN 978-3-0348-0679-4 .
  • Коничев А. С., Севастьянова Г. А. Молекулярная биология. — Издательский центр «Академия», 2012. — 400 с. — ISBN 978-5-7695-9147-1 .


Источник —

ashanti
  • 2021-07-06
  • 1
  • Tags:

Same as ТАТА-бокс

The title for the last searches