Interested Article - Е-бокс

Е-бокс (Enhancer Box) — ДНК-последовательность, найденная в некоторых промоторных областях у эукариот , которые действует в качестве связывающего сайта белка и, как было установлено, регулируют экспрессию генов в нейронах , мышцах и других тканях. Спецификация такой ДНК-последовательности — CANNTG (где N может быть любой нуклеотид ), с палиндромной . CACGTG распознаётся и связывается факторами транскрипции для инициации транскрипции генов . После того, как факторы транскрипции связываются с промоторами через E-бокс, другие ферменты могут связываться с промотором и облегчать транскрипцию мРНК из ДНК .

Открытие

E-бокс был обнаружен в сотрудничестве между Сусуму Тонегава ( англ. Susumu Tonegawa ) и Уолтером Гилбертом ( англ. Walter Gilbert ) лабораториями в 1985 году в качестве элемента управления иммуноглобулином тяжелой цепью усилителей. Они обнаружили, что область 140 спаренных оснований в тканеспецифической транскрипции усилительного элемента было достаточно для повышения различных уровней транскрипции в различных тканях и последовательностях. Они предположили, что белки , созданные определенными тканями, участвуют в этих усилителях, чтобы активировать наборы генов при дифференцировке клеток.

В 1989 году лаборатория Дэвида Балтимора обнаружили первые два связанных Е-боксом белка, E12 и E47. Эти усилители иммуноглобулинов можно связать, как гетеродимеры белков через bHLH домены. В 1990 году на примере другого E-белка, ITF-2A (позднее переименованный в E2-2Alt) было обнаружено, что можно привязать иммуноглобулин к легкой цепи усилителей. Два года спустя, третий E-бокс, связывающий белок, HEB, был обнаружен при обследовании кДНК библиотеки из HeLa клеток. Вариант сплайсинга E2-2 был обнаружен в 1997 г. и была обнаружена ингибиция промотора мышечноспециализированными генами .

С тех пор, исследователи установили, что E-бокс влияет на транскрипцию генов у некоторых эукариот и нашел связывающие факторы Е-бокса, которые идентифицируют E-Box. В частности, несколько экспериментов показали, что E-бокс неотъемлемая часть транскрипционно-трансляционной, петли обратной связи, которая содержит циркадные часы .

Связывание с помощью Е-бокса

Связывающие белки E-боксов играют важную роль в регуляции транскрипционной активности. Эти белки обычно содержат основной спираль-петля-спираль ( англ. Basic helix-loop-helix ) структурный мотив белка , который позволяет им связываться как димеры . Этот мотив состоит из двух амфипатических α-спиралей , разделенных небольшой последовательностью аминокислот , образующих один или более β-поворотов. В гидрофобных взаимодействиях между этими α-спиралями стабилизируется димеризация. Кроме того, каждый мономер bHLH имеет основную область, которая помогает взаимному опознаванию между мономером bHLH и E-боксом (основная область взаимодействует с большим желобком ДНК ). В зависимости от мотива ДНК («CAGCTG» или «CACGTG») белок bHLH имеет различный набор основных остатков.

Относительное положение CTRR и E-Box

Связывание Е-боксом модулируется у мышей посредством Zn 2+ . CT-Rich регионы (CTRR), расположенные на примерно 23 нуклеотида выше Е-бокса, имеют важное значение для связывания E-боксом, трансактивации (увеличение скорости генетической экспрессии), и транскрипции циркадных генов / и BMAL1/ комплексов.

Специфичность связывания различных Е-боксов отражается на их функции. E-боксы с различными функциями имеют различное количество и тип факторов связывания.

Консенсуальная последовательность E-бокса, как правило, — CANNTG; Однако, существуют другие Е-боксы со сходными последовательностями, называемые неканонические E-боксами. Они включают, но не ограничиваются ими:

  • CACGTT последовательность 20 bp выше гена и регулирует свою экспрессию
  • CAGCTT последовательность использует как основной усилитель
  • CACCTCGTGAC последовательность в проксимальной промоторной области человеческого и крысиного APOE , являющегося белковым компонентом липопротеинов .

Роль в циркадных часах

Связь между генным регулированием Е-боксов и циркадными часами была обнаружена в 1997 году, когда Хао, Аллен, и Хардин (Биологический факультет в Техасском университете A&M) проанализировали ритмичность периода осцилляций гена в Drosophila melanogaster . Они нашли циркадный усилитель транскрипции гена в 69 bp фрагмента ДНК . В зависимости от уровней белков, усилитель повышает уровни транскрипции мРНК как в условиях LD (свет-темнота), так и DD (постоянная темнота). Усилитель был необходим для повышения уровня экспрессии гена, но не для циркадной ритмичности. Он также работает независимо как цель / комплекса.

E-бокс играет важную роль в циркадных генах ; до сих пор, девять управляемых циркадных генов были идентифицированы: , , , , CRY1 , , , и . Так как E-бокс подключен к нескольким циркадным генам, возможно, что гены и белки , связанные с ним «важные и уязвимые точки в циркадной системе».

E-бокс является одним из пяти крупнейших семей транскрипционных факторов, связанных с циркадной фазой и находится в большинстве тканей. Всего 320 E-боксов, управляющих генами, находятся в SCN ( супрахиазматическое ядро ), печени , аорты , надпочечников , WAT ( белой жировой ткани ), головного мозга , предсердия , желудочка , префронтальной коры , скелетных мышц , ВАТ ( бурой жировой ткани ) и кости свода черепа.

E-бокс, подобно -зависимым элементам (EL-box; GGCACGAGGC) также важен в поддержании циркадной ритмичности в clock-управляющих генах . Аналогично обычному E-боксу, E-бокс, подобный clock-управляющим элементам, может также вызвать транскрипцию /CLOCK, которая затем может привести к экспрессии в других EL-box, содержащих гены (Ank, DBP, Nr1d1). Тем не менее, есть различия между EL-box и регулярным E-боксом. Подавление и имеет сильное влияние на E-бокс, чем на EL-box. Кроме того, Hes1, который может связываться с другой консенсуальной последовательностью (CACNAG, известной как N-box), показывает эффект подавления в EL-box, но не в E-боксе.

Оба неканонические E-бокс и подобная E-бокс последовательность, имеют решающее значение для циркадного колебания. Последние исследования в этой области формирует гипотезу, что каждый канонический или неканоническими E-бокс, следующий за подобной Е-бокс последовательностью, с интервалом 6 спаренных оснований между ними, — необходимое сочетание для циркадной транскрипции. Силикоанализ также показывает, что интервал существовал и у других известных clock-управляющих генов.

Роль белков в связывании E-боксов

Есть несколько белков, которые связываются с E-боксом и влияют на транскрипцию генов .

Комплекс CLOCK-BMAL1

Этот комплекс является неотъемлемой частью циркадного цикла млекопитающих и имеет жизненно важное значение в поддержании циркадной ритмичности.

Зная, что связывание активирует транскрипцию гена в промоторной области, исследователи обнаружили в 2002 году, что в DEC1 и DEC2 (транскрипционные факторы bHLH) репрессируют комплекс CLOCK-BMAL1 посредством прямого взаимодействия на BMAL1 и/или конкуренции для элементов Е-бокса. Они пришли к выводу, что DEC1 и DEC2 были регуляторами молекулярных часов млекопитающих.

В 2006 году Риппергер и Шиблер обнаружили, что связывание этого комплекса E-боксом ускоряет циркадную транскрипцию и переходы хроматина (изменение от хроматина до факультативного гетерохроматина ). Был сделан вывод, что CLOCK регулирует экспрессию DBP путём связывания с E-боксом мотивов усиливающих областей, расположенных в первом и втором интронах .

C-Myc (онкоген)

C-Myc , ген , кодирующий транскрипционный фактор Myc , играет важную роль в регулировании клеточной пролиферации и апоптоза млекопитающих.

В 1991 году исследователи протестировали, может ли с-Мус связываться с ДНК путём димеризации его с E12. Димеры химерного белка с E6 , способны связываться с элементом E-бокса (GGCCACGTGACC), который был опознаваем другими белками HLH. Экспрессия E6 подавила функцию с-Мус, которая определяла связь между ними обоими.

В 1996 году было обнаружено, что Мус гетеродимеризуется с и что этот гетеродимерный комплекс может связываться с CAC (G/A)TG последовательностью Е-бокса и активировать транскрипцию.

В 1998 году был сделан вывод, что функция с- Мус зависит от активации транскрипции определенных генов через элементы E-бокса.

MyoD

MyoD происходит от семьи Mrf bHLH и его основная роль заключается в миогенезе, формировании мышечной ткани. Другие члены этого семейства включают миогенин, , , и NEX-1.

Когда MyoD связывается с мотивом CANNTG E-бокса, инициируется мышечная дифференцировка и экспрессия мышечно-специфических белков. Исследователи удаляли различные части рекомбинантной MyoD и пришли к выводу, что MyoD использует включённые элементы, чтобы связать E-бокс и тетраплексную структуру промоторной последовательности мышечно-специфического гена интегрина α7 и саркомерного sMtCK .

MyoD регулирует HB-EGF ( ), член семьи EGF ( Эпидермальный фактор роста ), стимулирует рост и пролиферацию клеток. Он играет важную роль в развитии гепатоцеллюлярной карциномы , рака предстательной железы , рака молочной железы , рака пищевода , и рака желудка .

MyoD может также связываться с неканоническими E-боксами MyoG и регулировать свою экспрессию.

MyoG

MyoG принадлежит семейству факторов транскрипции MyoD. Связывающий MyoG Е-бокс является необходимым для формирования нервно-мышечного синапса в качестве сигнального пути HDAC-Dach2-миогенина в экспрессии генов скелетных мышц. У пациентов с симптомом атрофии мышц была выявлена пониженная экспрессией MyoG.

MyoG и MyoD, как также было выявлено, обладают дифференциацией миобластов . Они действуют путём трансактивации катепсином B промоторной активности и вызывают его экспрессию в мРНК .

E47

E47 производится путём альтернативного сплайсинга Е2А в E47 специфически кодированных bHLH экзонов . Его роль заключается в регулировании специфической экспрессии гена в ткани и дифференциации. Многие киназы были связаны с Е47 в том числе 3PK и MK2. Эти два белка образуют комплекс с Е47 и уменьшают его транскрипционную активность. CKII и PKA, как также было выявлено in vitro , фосфорилируют E47.

Как и в других E-боксах, связывающих белки, E47 также связывается с последовательностью CANNTG в E-боксе. У гомозиготных нокаутных мышей E2A, развитие В-клеток останавливается до стадии размещения DJ и В-клетки не могут созревать. E47, как было выявлено, связывается как гетеродимер (с E12) или как гомодимер (но слабее).

Последние исследования

Хотя структурная основа взаимодействия BMAL1/CLOCK с E-боксом неизвестна, недавние исследования показали, что мотивы bHLH белковых доменов BMAL1/CLOCK очень похожи на bHLH других содержащих его белков, например, Myc /Max, кристаллизованных E-боксами. Это предполагает, что необходимы специфические основания , для поддержки этого высокого сродства связывания. Кроме того, ограничения последовательности в области вокруг циркадного E-бокса полностью не изучены: это, как полагают, необходимо, но не достаточно; E-боксы должны быть случайным образом разнесены друг от друга в генетической последовательности для того, чтобы происходила циркадная транскрипция . Последние исследования E-боксов были направлены на то, чтобы найти больше связываемых белков, а также открыть больше механизмов для ингибирования связывания.

Недавнее исследование Университета Упсалы в Швеции связывает комплекс AST2-Rack1 с ингибицией связывания комплекса BMAL1-CLOCK с Е-боксом. Исследователи изучили роль Astakine-2 в индуцированном мелатонином циркадном регулировании у ракообразных и обнаружили, что AST2 необходим для ингибирования связывания комплекса BMAL1-CLOCK с E-боксом. Кроме того, они обнаружили, что секреция мелатонина отвечает за регулирование экспрессии AST2 и предположили, что ингибирование связывания E-бокса влияет на CLOCK у любого животного с молекулами AST2.

Исследователи из Медицинской школы университета Нанкин обнаружили, что амплитуда FBXL3 (F-бокс/богатых лейцином повторов белка) экспрессируется через E-бокс. Они изучали мышей с дефицитом FBXL3 и обнаружили, что он регулирует петлю обратной связи в циркадных ритмах , влияя на циркадный период.

Исследование, опубликованное 4 апреля 2013 исследователями Гарвардской медицинской школы обнаружило, что нуклеотиды по обе стороны от E-бокса влияют на то, какие транскрипционные факторы могут связываться с самим E-боксом. Эти нуклеотиды определяют 3-D пространственное расположение нити в ДНК и ограничивают размер связывания факторов транскрипции. Исследование также показало различия в связывании матриц между естественными условиями и в пробирке ( in vivo и in vitro ).

Примечания

  1. Massari, M. E.; Murre, C. Helix-loop-helix proteins: regulators of transcription in eucaryotic organisms (англ.) // (англ.) : journal. — 2000. — Vol. 20 , no. 2 . — P. 429—440 . — doi : . — . — PMC .
  2. Chaudhary, J; Skinner, M K. Basic helix-loop-helix proteins can act at the E-box within the serum response element of the c-fos promoter to influence hormone-induced promoter activation in Sertoli cells (англ.) // (англ.) : journal. — 1999. — May ( vol. 13 , no. 5 ). — P. 774—786 . — doi : . — .
  3. Ephrussi, A; Church, GM; Tonegawa, S; Gilbert, W. B lineage-specific interactions of an immunoglobulin enhancer with cellular factors in vivo (англ.) // Science : journal. — 1985. — Vol. 227 , no. 4683 . — P. 134—140 . — doi : . — .
  4. Church, GM; Ephrussi, A; Gilbert, W; Tonegawa, S. Cell-type-specific contacts to immunoglobulin enhancers in nuclei (англ.) // Nature : journal. — 1985. — Vol. 313 , no. 6005 . — P. 798—801 . — doi : . — Bibcode : . — .
  5. Murre, C; Mc Caw, P S; Vaessin, H; Caudy, M; Jan, L Y; Cabrera, C V; Buskin, J N; Hauschka, S D; Lassar, A B ; and others; Weintraub, Harold; Baltimore, David et al. Interactions between heterologous helix-loop-helix proteins generate complexes that bind specifically to a common DNA sequence (англ.) // Cell : journal. — Cell Press , 1989. — August ( vol. 58 , no. 3 ). — P. 537—544 . — doi : . — .
  6. Henthorn, P; Kiledjian, M; Kadesch, T. Two distinct transcription factors that bind the immunoglobulin enhancer microE5/kappa 2 motif (англ.) // Science : journal. — 1990. — Vol. 247 , no. 4941 . — P. 467—470 . — doi : . — Bibcode : . — .
  7. Hu S-J, Olson E N; Kingston, R E. HEB (англ.) // (англ.) : journal. — 1992. — Vol. 12 , no. 3 . — P. 1031—1042 . — . — PMC .
  8. Chen, B; Lim, R W. Physical and functional interactions between the transcriptional inhibitors Id3 and ITF-2b. Evidence toward a novel mechanism regulating muscle-specific gene expression (англ.) // J Biol Chem : journal. — 1997. — January ( vol. 272 , no. 4 ). — P. 2459—2463 . — doi : . — .
  9. Mädge B.: E-Box. In: Schwab M. (Ed.) Encyclopedia of Cancer: SpringerReference (www.springerreference.com). Springer-Verlag Berlin Heidelberg, 2009. doi :
  10. Ellenberger, T; Fass, D; Arnaud, M; Harrison, S C. Crystal structure of transcription factor E47: E-box recognition by a basic region helix-loop-helix dimer (англ.) // Genes Dev : journal. — 1994. — April ( vol. 8 , no. 8 ). — P. 970—980 . — doi : . — .
  11. Muñoz; Michelle Brewer; Ruben Baler. Modulation of BMAL/CLOCK/E-Box complex activity by a CT-rich cis-acting element (англ.) // (англ.) : journal. — 2006. — Vol. 252 , no. 1—2 . — P. 74—81 . — doi : . — .
  12. Bose; Boockfor F. R. Episodes of prolactin gene expression in GH3 cells are dependent on selective promoter binding of multiple circadian elements (англ.) // Endocrinology : journal. — 2010. — Vol. 151 , no. 5 . — P. 2287—2296 . — doi : . — . — PMC .
  13. Yoo, S.H.; Ko, C.H.; Lowrey, P.L.; Buhr, E.D.; Song, E.J.; Chang, S.; Yoo, O.J.; Yamazaki, S.; Lee, C. ; and others et al. A noncanonical E-box enhancer drives mouse Period2 circadian oscillations in vivo (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2005. — Vol. 102 , no. 7 . — P. 2608—2613 . — doi : . — . — PMC .
  14. Zhang, X.; Patel, S. P.; McCarthy, J. J.; Rabchevsky, A. G.; Goldhamer, D. J.; Esser, K. A. A non-canonical E-box within the MyoD core enhancer is necessary for circadian expression in skeletal muscle (англ.) // (англ.) : journal. — 2012. — Vol. 40 , no. 8 . — P. 3419—3430 . — doi : . — .
  15. Enrique, Salero; Cecilio, Giménez; Francisco, Zafra. {{{заглавие}}} (англ.) // (англ.) : journal. — 2003. — March ( vol. 370 , no. 3 ). — P. 979—986 .
  16. Hao, H; Allen, D L; Hardin, P E. A circadian enhancer mediates PER-dependent mRNA cycling in Drosophila melanogaster (англ.) // (англ.) : journal. — 1997. — July ( vol. 17 , no. 7 ). — P. 3687—3693 . — . — PMC .
  17. Panda, S; Antoch MP; Miller BH; Su AI; Schook AB; Straume M; Schultz PG; Kay SA; Takahashi JS; Hogenesch J. B. Coordinated transcription of key pathways in the mouse by the circadian clock (англ.) // Cell : journal. — Cell Press , 2002. — May ( vol. 109 , no. 3 ). — P. 307—320 . — doi : . — .
  18. Herzog, Erik. Neurons and networks in daily rhythms (англ.) // Nature Reviews Neuroscience : journal. — 2007. — October ( vol. 8 , no. 10 ). — P. 790—802 . — doi : . — .
  19. Yan, Jun; Haifang Wang; Yuting Liu; Chunxuan Shao. Analysis of Gene Regulatory Networks in the Mammalian Circadian Rhythm (англ.) // PLOS Computational Biology : journal. — 2008. — October ( vol. 4 , no. 10 ). — P. e1000193 . — doi : . — Bibcode : . — . — PMC .
  20. Ueshima, T; Kawamoto T; Honda KK; Noshiro M; Fujimoto K; Nakao S; Ichinose N; Hashimoto S; Gotoh O; Kato Y. Identification of a new clock-related element EL-box involved in circadian regulation by BMAL1/CLOCK and HES1 (англ.) // (англ.) : journal. — Elsevier , 2012. — December ( vol. 510 , no. 2 ). — P. 118—125 . — doi : . — .
  21. Nakahata, Y; Yoshida M; Takano A; Soma H; Yamamoto T; Yasuda A; Nakatsu T; Takumi T. A direct repeat of E-box-like elements is required for cell-autonomous circadian rhythm of clock genes (англ.) // BMC Mol Biol : journal. — 2008. — January ( vol. 9 , no. 1 ). — P. 1 . — doi : . — .
  22. Honma, S; Kawamoto, T; Takagi, Y; Fujimoto, K; Sato, F; Noshiro, M; Kato, Y; Honma, K. Dec1 and Dec2 are regulators of the mammalian molecular clock (англ.) // Nature : journal. — 2002. — Vol. 419 , no. 6909 . — P. 841—844 . — doi : . — Bibcode : . — .
  23. Ripperger, J A.; Schibler, U. Rhythmic CLOCK-BMAL1 binding to multiple E-box motifs drives circadian Dbp transcription and chromatin transitions (англ.) // Nat. Genet : journal. — 2006. — March ( vol. 38 , no. 3 ). — P. 369—374 . — doi : . — .
  24. Prendergast, G C; Ziff, E B. Methylation-sensitive sequence-specific DNA binding by the c-Myc basic region (англ.) // Science : journal. — 1991. — January ( vol. 251 , no. 4990 ). — P. 186—189 . — doi : . — Bibcode : . — .
  25. Desbarats, L; Gaubatz, S; Eilers, M. Discrimination between different E-box-binding proteins at an endogenous target gene of c-myc (англ.) // Genes Dev : journal. — 1996. — February ( vol. 10 , no. 4 ). — P. 447—460 . — doi : . — .
  26. Xiao, Q; Claassen, G; Shi, J; Adachi, S; Seivy, J; Hann, S R. Transactivation-defective c-MycS retains the ability to regulate proliferation and apoptosis (англ.) // Genes Dev : journal. — 1998. — December ( vol. 12 , no. 24 ). — P. 3803—3808 . — doi : . — .
  27. Shklover, J; Etzioni, S; Weisman-Shomer, P; Yafe, A; Bengal, E; Fry, M. MyoD uses overlapping but distinct elements to bind E-box and tetraplex structures of regulatory sequences of muscle-specific genes (англ.) // (англ.) : journal. — 2007. — Vol. 35 , no. 21 . — P. 7087—7095 . — doi : . — .
  28. Bergstrom, D. A.; Penn, B. H.; Strand, A.; Perry, R. L.; Rudnicki, M. A.; Tapscott, S. J. Promoter-specific regulation of MyoD binding and signal transduction cooperate to pattern gene expression (англ.) // (англ.) : journal. — 2002. — Vol. 9 , no. 3 . — P. 587—600 . — doi : . — .
  29. Tang, H; Goldman, D. Activity-dependent gene regulation in skeletal muscle is mediated by a histone deacetylase (HDAC)-Dach2-myogenin signal transduction cascade (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2006. — Vol. 103 , no. 45 . — P. 16977—16982 . — doi : . — Bibcode : . — . — PMC .
  30. Ramamoorthy, S; Donohue, M; Buck, M. Decreased Jun-D and myogenin expression in muscle wasting of human cachexia (англ.) // (англ.) : journal. — 2009. — Vol. 297 , no. 2 . — P. E392—401 . — doi : . — . — PMC .
  31. Jane, D.T.; Morvay, L.C.; Koblinski, J.; Yan, S.; Saad, F.A.; Sloane, B.F. ; and others et al. Evidence that E-box promoter elements and MyoD transcription factors play a role in the induction of cathepsin B gene expression during human myoblast differentiation (англ.) // (англ.) : journal. — 2002. — Vol. 383 , no. 12 . — P. 1833—1844 . — doi : . — .
  32. Neufeld; B.; ; Hoffmeyer, A.; Jordan, B. W. M.; Chen, P.; Dinev, D.; Ludwig, S.; Rapp, U. R. et al. Serine/Threonine Kinases 3pK and MAPK-activated Protein Kinase 2 Interact with the Basic Helix-Loop-Helix Transcription Factor E47 and Repress Its Transcriptional Activity (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2000. — Vol. 275 , no. 27 . — P. 20239—20242 . — doi : . — .
  33. Johnson; Wang X.; Hardy S.; Taparowsky, E. J.; Konieczny, S. F. Casein kinase II increases the transcriptional activities of MRF4 and MyoD independently of their direct phosphorylation (англ.) // (англ.) : journal. — 1996. — Vol. 16 , no. 4 . — P. 1604—1613 . — . — PMC .
  34. Sloan; Shen C. P.; McCarrick-Walmsley R.; Kadesch T. Phosphorylation of E47 as a potential determinant of B-cell-specific activity (англ.) // (англ.) : journal. — 1996. — Vol. 16 , no. 12 . — P. 6900—6908 . — . — PMC .
  35. Shen; Kadesch T. B-cell-specific DNA binding by an E47 homodimer (англ.) // (англ.) : journal. — 1995. — Vol. 15 , no. 8 . — P. 4518—4524 . — . — PMC .
  36. Bain; ; Izon, D. J.; Amsen, D; Kruisbeek, A. M.; Weintraub, B. C.; Krop, I; Schlissel, M. S.; Feeney, A. J.; Van Roon, M. et al. E2A proteins are required for proper B cell development and initiation of immunoglobulin gene rearrangements (англ.) // Cell : journal. — Cell Press , 1994. — Vol. 79 , no. 5 . — P. 885—892 . — doi : . — .
  37. Lassar; Davis R. L.; Wright W. E.; Kadesch T.; Murre C.; Voronova A.; Baltimore D.; Weintraub H. Functional activity of myogenic HLH proteins requires hetero-oligomerization with E12/E47-like proteins in vivo (англ.) // Cell : journal. — Cell Press , 1991. — Vol. 66 , no. 2 . — P. 305—315. . — doi : . — .
  38. Murre; McCaw P. S., Vaessin H., Caudy M., Jan L. Y., Jan Y. N., Cabrera C. V., Buskin J. N., Hauschka S. D., Lassar A. B., ; Vaessin, H; Caudy, M; Jan, L. Y.; Jan, Y. N.; Cabrera, C. V.; Buskin, J. N.; Hauschka, S. D.; Lassar, A. B. et al. Interactions between heterologous helix-loop-helix proteins generate complexes that bind specifically to a common DNA sequence (англ.) // Cell : journal. — Cell Press , 1989. — Vol. 58 , no. 3 . — P. 537—544 . — doi : . — .
  39. Muñoz, E; Brewer, M; Baler, R. Circadian Transcription: THINKING OUTSIDE THE E-BOX (англ.) // J Biol Chem : journal. — 2002. — September ( vol. 277 , no. 39 ). — P. 36009—36017 . — doi : . — .
  40. Watthanasurorot, A; Saelee, N; Phongdara, A; Roytrakul, S; Jiranavichpaisal, P; Söderhäll, K; Söderhäll, I. Astakine 2—the Dark Knight Linking Melatonin to Circadian Regulation in Crustaceans (англ.) // (англ.) : journal. — 2013. — March ( vol. 3 , no. 3 ). — P. e1003361 . — doi : .
  41. Shi, G; Xing, L; Liu, Z; Qu, Z; Wu, X; Dong, Z; Wang, X; Gao, X; Huang, M ; and others; Yang, L.; Liu, Y.; Ptacek, L. J.; Xu, Y. et al. Dual roles of FBXL3 in the mammalian circadian feedback loops are important for period determination and robustness of the clock (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2013. — Vol. 110 , no. 12 . — P. 4750—4755 . — doi : . — Bibcode : . — . — PMC .
  42. Gordân, R; Shen, N; Dror, I; Zhou, T; Horton, J; Rohs, R; Bulyk, ML. Genomic Regions Flanking E-Box Binding Sites Influence DNA Binding Specificity of bHLH Transcription Factors through DNA Shape (англ.) // (англ.) : journal. — 2013. — April ( vol. 3 , no. 4 ). — P. 1093—1104 . — doi : . — . — PMC .
Источник —

Same as Е-бокс