Внутренняя терминация , также ρ-независимая терминация , ро-независимая терминация ( англ. Rho-independent termination ), — механизм остановки транскрипции гена у прокариот . Суть этого механизма такова: мРНК содержит гуанин-цитозин-обогащённую последовательность, которая может образовывать структуры типа шпилька в 7—20 пар оснований в длину. Гуанин и цитозин образуют друг с другом три водородные связи и поэтому связаны довольно прочно . Сразу после шпильки располагается участок, обогащённый урацилом . Связи между урацилом и аденином очень слабы. Белок, связанный с РНК-полимеразой ( nusA ), настолько прочно связывается со шпилькой, что это вызывает временную остановку полимеразы и прекращение транскрипции . В этот момент полимераза располагается на полиурациловом участке последовательности. Слабые аденин-урациловые связи снижают энергию дестабилизации дуплекса РНК-ДНК, что позволяет им ослабить напряжение полинуклеотидной цепи и диссоциировать от РНК-полимеразы .

Ро-элементы, которые не содержат полиурациловой последовательности, способны приостановить РНК-полимеразу, но она, как правило, продолжает транскрипцию спустя некоторое время, поскольку дуплекс слишком стабилен, чтобы вызвать диссоциацию РНК-полимеразы и последующую терминацию.

Ро-независимая терминация транскрипции — это частый случай механизма, лежащего в основе активности цис -регуляторных элементов РНК , таких как рибопереключатели .

Примечания