Interested Article - LINEs

LINEs ( англ. Long interspersed nuclear element , Длинные Диспергированные Повторы ) — длинные (несколько тысяч пар оснований ) последовательности ДНК в геноме эукариот , представляющие собой ретротранспозоны , не содержащие длинных концевых повторов .

Первое описание LINE-последовательности, длиной около 6 400 пар оснований, было опубликовано в 1980 году.

Строение

На 3'-конце LINEs содержат либо поли( A )-хвост, либо аденин богатую последовательность, либо тандемно-повторяющиеся последовательности. LINEs содержат одну или две открытые рамки считывания .

Выделяют 5 суперсемейств LINEs :

R2 . Содержат одну открытую рамку считывания, которая кодирует обратную транскриптазу и эндонуклеазу . Считается, что это наиболее древнее семейство ретропозонов не содержащих длинных концевых повторов .
RTE . Также содержат одну открытую рамку считывания, кодирующую апуриновую-апуримидиновую эндонуклеазу и обратную транскриптазу.

Три других суперсемейства содержат две открытые рамки считывания. Продукт первой (ORF1) из которых, кодирует белок по свойствам похожий на продукт гена gag ретровирусов.

Jockey . Вторая открытая рамка считывания (ORF2) кодирует апуриновую-апуримидиновую эндонуклеазу и обратную транскриптазу.
L1 . ORF2 кодирует те же элементы, что и у суперсемейства Jockey . LINEs этого суперсемейства являются наиболее изученными и наиболее распространенными в геноме млекопитающих. Так в геноме человека содержится более 500 тыс. копий ретропозонов , что составляет около 17 % генома.
I . ORF2 кроме апуриновой-апуримидиновой эндонуклеазы и обратной транскриптазы кодирует также и РНКазу H .

См. также

Примечания

Singer M. F. (англ.) // Cell. — 1982. — Vol. 28, no. 3 . — P. 433—434. — . [ ]
Антонио Лима-де-Фариа. Похвала «глупости» хромосомы: исповедь непокорной молекулы. — Москва: Бином. Лаборатория знаний, 2012. — С. 275. — 312 с. — ISBN 978-5-9963-0974-0 .
Adams, J. W. , Kaufman, R. E. , Kretschmer, P. J. , Harrison, M. , Nienhuis, A. W. A family of long reiterated DNA sequences, one copy of which is next to the human beta globin gene // Nucleic Acids Research : журнал. — 1980. — Т. 8 , № 24 . — С. 6113 . — doi : .
↑ López-Flores I., Garrido-Ramos M. A. The repetitive DNA content of eukaryotic genomes // Garrido-Ramos M.A. Genome Dynamics. — 2012. — Т. 7 . — С. 1-28 . — ISBN 978-3-318-02149-3 . — doi : .