Interested Article - 5-Гидроксиметилцитозин

5-Гидроксиметилцитозин — это азотистое пиримидиновое основание, формируемое из цитозина добавлением метильной и затем гидроксильной группы по пятому положению. Участвует в эпигенетической регуляции экспрессии генов при клеточной дифференцировке и в эмбриональном развитии. Считается, что 5-гидроксиметилцитозин возникает при активном деметилировании 5-метилцитозина путём его окисления с участием Tet-белков . Впервые 5-гидроксиметилцитозин выявлен у бактериофагов в 1952 году , в 2009 году 5-гидроксиметицитозин обнаружен в клетках мозга и в эмбриональных стволовых клеткаx у мыши и человека .

Локализация

В развитии 5-гидроксиметилцитозин выявляется уже на стадии зиготы . Окисление метилцитозина в гидроксиметилцитозин происходит на стадии зиготы в отцовском пронуклеусе, но не в материнском. Далее, в продолжение нескольких первых делений, родительская «асимметрия» по 5-гидроксиметилцитозину продолжает наблюдаться, что позволяет различать материнские и отцовские хромосомы вплоть до стадии дробления . В дальнейшем эмбриональном развитии высокий уровень 5-гидроксиметилцитозина наблюдается во внутренней клеточной массе бластоцисты , на постимплантационной стадии 5-гидроксиметилцитозин колокализуется с -экспрессирующими клетками .

Предполагается, что в ядре любой клетки млекопитающих можно обнаружить 5-гидроксиметилцитозин, однако его количество значительно варьирует в зависимости от типа клеток. Во взрослом организме самый высокий уровень выявляют в нейрональных клетках центральной нервной системы . Как показано для нейрональных клеток мыши, количество гидроксиметилцитозина в гиппокампе и мозжечке увеличивается с возрастом .

См. также

Примечания

  1. Tahiliani M., Koh K.P., Shen Y., et al. Conversion of 5-methylcytosine to 5-hydroxymethylcytosine in mammalian DNA by MLL partner TET1 (англ.) // Science. — 2009. — May ( vol. 324 , no. 5929 ). — P. 930—935 . — doi : . — . — PMC .
  2. Ito S., D'Alessio A.C., Taranova O.V., Hong K., Sowers L.C., Zhang Y. Role of Tet proteins in 5mC to 5hmC conversion, ES-cell self-renewal and inner cell mass specification (англ.) // Nature : journal. — 2010. — August ( vol. 466 , no. 7310 ). — P. 1129—1133 . — doi : . — .
  3. Warren R.A. Modified bases in bacteriophage DNAs (неопр.) // Annu. Rev. Microbiol. . — 1980. — Т. 34 . — С. 137—158 . — doi : . — .
  4. Wyatt G.R., Cohen S.S. A new pyrimidine base from bacteriophage nucleic acids (англ.) // Nature : journal. — 1952. — December ( vol. 170 , no. 4338 ). — P. 1072—1073 . — doi : . — .
  5. Kriaucionis S., Heintz N. The nuclear DNA base 5-hydroxymethylcytosine is present in Purkinje neurons and the brain (англ.) // Science : journal. — 2009. — May ( vol. 324 , no. 5929 ). — P. 929—930 . — doi : . — . — PMC .
  6. Iqbal K., Jin S.G., Pfeifer G.P., Szabó P.E. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2011. — March ( vol. 108 , no. 9 ). — P. 3642—3647 . — doi : . — . — PMC . 5 ноября 2017 года.
  7. Ruzov A., Tsenkina Y., Serio A., et al. (англ.) // (англ.) : journal. — 2011. — September ( vol. 21 , no. 9 ). — P. 1332—1342 . — doi : . — . — PMC . 4 октября 2011 года.
  8. Münzel M et al. Quantification of the Sixth DNA Base Hydroxymethylcytosine in the Brain (англ.) // Angew. Chem. Int. Ed. : journal. — 2010. — July ( vol. 49 , no. 31 ). — P. 5375—5377 . — doi : .
  9. Szwagierczak A et al. Sensitive Enzymatic Quantification of 5-Hydroxymethylcytosine in Genomic DNA (англ.) // (англ.) : journal. — 2010. — October ( vol. 38 , no. 19 ). — P. e181 . — doi : . — . — PMC .
  10. Globisch D et al. Tissue Distribution of 5-Hydroxymethylcytosine and Search for Active Demethylation Intermediates (англ.) // PLoS ONE : journal / Croft, Anna Kristina. — 2010. — December ( vol. 5 , no. 12 ). — P. e15367 . — doi : . — . — PMC .
  11. Song C-X et al. S elective chemical labeling reveals the genome-wide distribution of 5-hydroxymethylcytosine (англ.) // Nat. Biotech. : journal. — 2010. — December ( vol. 29 , no. 1 ). — P. 68—72 . — doi : .
Источник —

Same as 5-Гидроксиметилцитозин