В детстве училась в художественном училище. В старших классах победила на городской олимпиаде по литературе и получила направление в
Литературный институт имени Горького
. Но ни художницей, ни писательницей Маргарита Шубина не стала. По её собственным словам, она «росла сорвиголовой и хулиганкой» и из-за неусидчивости не смогла долго сидеть за мольбертом или писать романы
.
Во время обучения на четвёртом курсе
ГИТИСа
на курсе у
О. Я. Ремеза
Маргарите Шубиной поступило предложение от
А. А. Гончарова
сыграть в
Театре им. Маяковского
. Благодаря её великолепной актёрской игре после окончания Маргаритой Шубиной РАТИ в 1987 году к ней поступили приглашения почти от всех театров столицы, но актриса предпочла другим
Театр имени Моссовета
, в котором служит и сейчас
.
Считается, что дебютной картиной Маргариты Шубиной был фильм
Вадима Зобина
«
Воскресенье, половина седьмого
», снятый в 1988 году. Однако на самом деле актриса дебютировала в кино в 1984 году, снявшись в картине
Михаила Туманишвили
«
Полоса препятствий
»
. С тех пор она снялась в нескольких незаметных ролях в кино. Большую известность Маргарите Шубиной подарила роль фельдшера Орловой в телесериале «
Неотложка
» режиссёров
Анатолия Артамонова
и Геннадия Каюмова. С тех пор Маргарита Шубина стала активно сниматься в кино. Сейчас на её счету около 40 ролей, а ещё на данный момент снимается картина «Люди жили и не знали» — дебют Маргариты Шубиной в качестве режиссёра. Очень часто она играет несчастных в личной жизни женщин — капитан Махова в телесериале «
», Раечка в телесериале «
», Тоня в фильме «
», Любка в телесериале «
Сваты
»
.
Муж актрисы — её бывший однокурсник Владислав, в прошлом актёр театра, а ныне бизнесмен. У супругов двое сыновей — Максим и Серафим. Крёстным отцом Максима был
Андрей Ильин
, а крёстными родителями Серафима —
Александр Самойленко
и
.