Эрнандес начал свою карьеру в клубе «
Платенсе
». В 2007 году Эдди дебютировал в
чемпионате Гондураса
. Он быстро завоевал место в основе команды, благодаря отличным бомбардирским навыкам. В 2012 году Эдди на правах аренды перешёл в
шведский
«
Хеккен
»
, но не сыграв ни одного матча уже через месяц вернулся на родину
. Его новым клубом стал «
Мотагуа
». 17 августа 2012 года в поединке против «
Вида
» он дебютировал за команду
. 14 октября в матче против «Вида» Эрнандес сделал «дубль», забив свои первые голы за «Мотагуа»
.
В начале 2014 года Эдди перешёл в «Вида». 19 января в матче против «
Олимпии
» он дебютировал за новый клуб
. 26 января в поединке против «
» Эрнандес забил свой первый гол за новую команду
. В начале 2015 года Эрнандес присоединился к
мексиканскому
«
Коррекаминос
». 17 января в матче против «
» он дебютировал в
Лиге Ассенсо
. В поединке против «
» Эдди забил свой первый гол за «Коррекаминос». После окончания аренды он вернулся в «Мотагуа».
В 2011 году Эдди был включен в заявку сборной на участие в
Золотом кубке КОНКАКАФ
. На турнире он был запасным и на поле так и не вышел.
Летом 2012 года Эрнандес был включен в заявку национальной команды на поездку в
Лондон
на
Олимпийские игры
. На турнире он принял участие в матче против команды Марокко
.