Interested Article - Протокадгерины

Протокадгерины ( Pcdhs ) являются крупнейшей подгруппой кадгеринов -- надсемейства гомофильных белков клеточной адгезии . Были обнаружены группой Синтаро Судзуки. Фрагменты ПЦР ( англ. PCR ), соответствующие протокадгеринам, были обнаружены как у позвоночных, так и беспозвоночных . Эта распространенность у широкого круга видов предполагает, что фрагменты были частью древнего кадгерина и поэтому были названы «протокадгеринами». Из примерно 70 генов Pcdh, идентифицированных в геномах млекопитающих, более 50 расположены в тесно связанных генных кластерах на одной и той же хромосоме . До недавнего времени предполагалось, что такая организация может быть обнаружена только у позвоночных , однако при изучении генома калифорнийских двупятнистых осьминогов , обнаружилось неожиданное обилие генов группы протокадгеринов .

Классификация

У млекопитающих определены два типа генов Pcdh: некластеризованные Pcdh, распределенные по всему геному; и сгруппированные Pcdhs, организованные в три кластера генов, обозначенных α, β, γ, которые в геноме мыши включают 14, 22 и 22, соответственно, больших вариабельных экзонов, расположенных тандемно. Каждый экзон транскрибируется со своего промотора-хозяина и кодирует: весь внеклеточный домен, трансмембранный домен и короткий и вариабельный внутриклеточный домен соответствующего белка Pcdh, который отличается от внутриклеточного домена кадгерина отсутствием прикрепления к цитоскелету через катенин .

Более того, эти сгруппированные гены Pcdh преимущественно проявляются в развивающейся нервной системе и, поскольку различные субнаборы генов Pcdhs по-разному проявляются в отдельных нейронах, в результате этой комбинаторной экспрессии может возникать огромное разнообразие клеточной поверхности . Это привело к предположениям, а затем и к теории о том, что Pcdhs могут предоставлять синаптический адресный код для соединения нейронов, или одноклеточный штрих-код аналогичный тому, который приписывается белкам DSCAM беспозвоночных. Хотя DSCAM позвоночных не обладают таким разнообразием, как их аналоги беспозвоночных, селективная транскрипция отдельных изоформ Pcdh может быть достигнута путём выбора промотора с последующим альтернативным цис-сплайсингом пре-мРНК, что увеличивает количество возможных комбинаций.

Функции

Гомофильные взаимодействия и внутриклеточная передача сигналов

Сгруппированные белки Pcdhs обнаруживаются по всей соме нейронов, дендритам и аксонам и наблюдаются в синапсах и конусах роста . Подобно классическим кадгеринам, члены семейства Pcdhs, как было показано, также опосредуют межклеточную адгезию в клеточных анализах и большинство из них участвуют в гомофильных транс-взаимодействиях . Schreiner и Weiner показали, что белки Pcdha и γ могут образовывать мультимерные комплексы. Если бы все три класса Pcdhs могли участвовать в мультимеризации стохастически экспрессируемых изоформ Pcdhs, тогда нейроны могли бы продуцировать большое количество различных гомофильных взаимодействующих единиц, значительно увеличивая разнообразие клеточной поверхности больше, чем то, которое обеспечивается только стохастической экспрессией генов .

Что касается цитоплазматического домена, то все три класса кластеризованных белков Pcdhs различны, хотя они строго консервативны в эволюции позвоночных, указывая на консервативную клеточную функцию . Это подтверждается большим количеством других взаимодействующих белков, включая фосфатазы, киназы, молекулы адгезии и синаптические белки . Цитоплазматический домен также обеспечивает внутриклеточное удержание, свойство, которое отличает сгруппированные протокадгерины от родственных классических кадгеринов . Кроме того, было показано, что Pcdhs протеолитически процессируются комплексом γ-секретазы, , который высвобождает в цитоплазму растворимые внутриклеточные фрагменты, которые могут иметь широкий спектр функций, действующих локально в цитоплазме и/или даже регулирующих гены. Экспрессия аналогична другим белкам клеточной поверхности, таким как Notch и N-кадгерин . Поскольку эти молекулы участвуют во многих процессах развития, таких как направление аксонов и разветвление дендритов , мутации в генах Pcdhs и их экспрессия могут играть роль в синдроме Дауна , Ретта , а также в синдроме ломкой Х-хромосомы , шизофрении и нейродегенеративных заболеваниях .

Цитоплазматический домен Pcdh-альфа можно разделить на два специфических типа. Оба они усиливают гомофильные взаимодействия. Они связаны с нейрофилламентом [ уточнить ] М и фасцином соответственно .

Примечания

Комментарии
  1. По мере секвенирования геномов других головоногих, в том числе сепиолид и гигантских кальмаров, у всех обнаружились большие количества протокадгеринов. В таком количестве они не встречались ни у каких других животных кроме позвоночных .
Источники
  1. "Molecular evolution of the cadherin superfamily". The International Journal of Biochemistry & Cell Biology . 41 (2): 349—69. February 2009. doi : . PMID .
  2. . The EMBO Journal . 12 (6): 2249—56. June 1993. doi : . PMID .
  3. "Functional significance of isoform diversification in the protocadherin gamma gene cluster". Neuron . 75 (3): 402—9. August 2012. doi : . PMID .
  4. , с. 41.
  5. "Clustered protocadherins". Development . 140 (16): 3297—302. August 2013. doi : . PMID .
  6. "Diversity revealed by a novel family of cadherins expressed in neurons at a synaptic complex". Neuron . 20 (6): 1137—51. June 1998. doi : . PMID .
  7. "Gamma protocadherins are required for survival of spinal interneurons". Neuron . 36 (5): 843—54. December 2002. doi : . PMID .
  8. "Changes in subcellular distribution of protocadherin gamma proteins accompany maturation of spinal neurons". Journal of Neuroscience Research . 72 (5): 549—56. June 2003. doi : . PMID .
  9. "Gamma-protocadherins are targeted to subsets of synapses and intracellular organelles in neurons". The Journal of Neuroscience . 23 (12): 5096—104. June 2003. doi : . PMID .
  10. "Postsynaptic and differential localization to neuronal subtypes of protocadherin beta16 in the mammalian central nervous system". The European Journal of Neuroscience . 27 (3): 559—71. February 2008. doi : . PMID .
  11. "Protocadherin Pcdh2 shows properties similar to, but distinct from, those of classical cadherins". Journal of Cell Science . 108 ( Pt 12) (12): 3765—73. December 1995. doi : . PMID .
  12. "Differential expression of individual gamma-protocadherins during mouse brain development". Molecular and Cellular Neurosciences . 29 (4): 603—16. August 2005. doi : . PMID .
  13. "Regulated ADAM10-dependent ectodomain shedding of gamma-protocadherin C3 modulates cell-cell adhesion". The Journal of Biological Chemistry . 281 (31): 21735—44. August 2006. doi : . PMID .
  14. "Combinatorial homophilic interaction between gamma-protocadherin multimers greatly expands the molecular diversity of cell adhesion". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 107 (33): 14893—8. August 2010. Bibcode : . doi : . PMID .
  15. "Phosphorylation of protocadherin proteins by the receptor tyrosine kinase Ret". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 107 (31): 13894—9. August 2010. doi : . PMID .
  16. "Gamma-protocadherin homophilic interaction and intracellular trafficking is controlled by the cytoplasmic domain in neurons". Molecular and Cellular Neurosciences . 40 (3): 344—53. March 2009. doi : . PMID .
  17. . Molecular and Cellular Biology . 27 (11): 4121—32. June 2007. doi : . PMID .
  18. "Proteolytic processing of protocadherin proteins requires endocytosis". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 107 (41): 17774—9. October 2010. Bibcode : . doi : . PMID .
  19. "Dendritic anomalies in disorders associated with mental retardation". Cerebral Cortex . 10 (10): 981—91. October 2000. doi : . PMID .
  20. "Evidence for positive selection on Protocadherin Y gene in Homo sapiens: implications for schizophrenia". Schizophrenia Research . 108 (1—3): 299—300. March 2009. doi : . PMID .
  21. "Dendritic changes in Alzheimer's disease and factors that may underlie these changes". Progress in Neurobiology . 55 (6): 595—609. August 1998. doi : . PMID .
  22. "Cytoplasmic domain of protocadherin-alpha enhances homophilic interactions and recognizes cytoskeletal elements". Journal of Neurobiology . 66 (4): 393—407. March 2006. doi : . PMID .

Литература

  • Данна Стоф. Осьминоги, каракатицы, адские вампиры. 500 миллионов лет истории головоногих моллюсков = Danna Staaf. Monarchs of the Sea: The Extraordinary 500-Million-Year History of Cephalopods.. — М. : Альпина нон-фикшн, 2023. — 278 с. — ISBN 978-5-00139-867-7 .
Источник —

Same as Протокадгерины