5 февраля 1900 года, 18 декабря 1944 года епархия Уануко передала часть своей территории
апостольской префектуре
Укайали (упразднена) и епархии
Уанкайо
.
15 мая 1958 года епархия Уануко передала часть своей территории территориальным прелатурам Тармы и Уари (сегодня —
Епархия Тармы
и
Епархия Уари
).
30 июня 1966 года епархия Уануко вступила в митрополию Уанкайо.
Ординарии епархии
священник
Manuel Teodoro del Valle (27.03.1865 — 16.10.1888) — апостольский администратор
епископ
Alfonso María de la Cruz Sardinas (31.10.1889 — 26.06.1902)
епископ Pedro Pablo Drinot y Piérola (8.06.1904 — 14.06.1920)
епископ Francisco Rubén Berroa y Bernedo (12.08.1922 — 23.11.1946) — назначен
епископом Ики
епископ Teodosio Moreno Quintana (27.06.1947 — 17.12.1956) — назначен
епископом Уараса
епископ Carlos Alberto Arce Macias (17.12.1956 — 6.02.1959) — назначен
епископом Пьюры
епископ Ignacio Arbulú Pineda (6.02.1959 — 6.04.1979)
епископ Antonio Kühner y Kühner (24.07.1980 — 22.01.1991)
епископ Ermanno Artale Ciancio (21.06.1994 — 17.09.2003)
епископ Jaime Rodríguez Salazar (16.12.2004 — по настоящее время)