Ионафа́н ( ивр. יונתן ‎, Йоната́н — буквально «Госпо́дь дал») — распространённое библейско-историческое имя, в Библии упоминается несколько человек с таким именем.

• Ионафан — старший сын царя Саула , друг Давида .
• — сын первосвященника Авиафара (Авиатара), стоявший на стороне Давида во время его скитальческой жизни;
• Ионатан Хасмоней , сын священника Маттафии (Матитьяху), родоначальника Маккавеев , бывший вождем восставшего народа после смерти своего брата Иуды Маккавея (Иехуды ха-Маккаби).
• Ионафан (Дмитриев) ( в миру Иван ; 1816—1891) — игумен ставропигиального Валаамского Спасо-Преображенского мужского монастыря РПЦ.
• Ионафан (Елецких) (род. 1949) — митрополит Тульчинский и Брацлавский Украинской православной церкви Московского патриархата.
• Ионафан (Кополович) (1912—1990) — архиепископ Кишинёвский и Молдавский Русской православной церкви (с 1972).
• Ионафан (Руднев) (1816—1906) — архиепископ Ярославский и Ростовский Русской православной церкви (с 1883).
• Ионафан (Цветков) (род. 1962) — архиепископ Абаканский и Кызылский Русской православной церкви.