Вирус гепатита дельта
- 1 year ago
- 0
- 0
Вирус гепатита С ( лат. Hepacivirus C , HCV) — вирус -возбудитель гепатита С у человека и шимпанзе . РНК -содержащий вирус, относящийся к семейству Flaviviridae (род ; в этот же род входят вирусы, вызывающие заболевания, похожие на гепатит С, у собак и лошадей ). Открыт в 1989 г. методом клонирования ДНК-копии вируса, вызывавшего парентеральный гепатит «ни А ни В» у инфицированных шимпанзе. Это первый вирус, идентифицированный на основании расшифровки последовательности нуклеотидов задолго до его электронно-микроскопической визуализации . Согласно классификации вирусов по Балтимору относится к классу IV. К настоящему времени этим вирусом инфицировано не менее 3 % населения Земли .
В 2020 г. Нобелевская премия по медицине была присуждена американским вирусологам Харви Олтеру , Чарльзу Райсу и британцу Майклу Хаутону за открытие вируса гепатита С .
Первые работы, в итоге успешно закончившиеся идентификацией вируса и установлением его патологической роли в заболеваниях печени , были начаты ещё в начале 1970-х годов Харви Алтером . Алтер, работая в системе Национальных институтов здравоохранения США , пытался выяснить причины заражения гепатитом при переливаниях крови (в то время вероятность заражения гепатитом в результате гемотрансфузий доходила до 30 %), исследуя образцы крови, переливание которых впоследствии вызывало гепатит у здоровых реципиентов. К 1975 г. он установил, что, вероятно, за часть случаев гепатита отвечает ещё не открытый вирус. В конце 1970-х годов Алтер экспериментально доказал предположение об инфекционной природе нового заболевания путём переливания сыворотки крови шимпанзе от доноров, чья кровь вызывала заболевания гепатитом .
Длительное время не удавалось определить, что же именно вызывает гепатит С. В 1982 г. Майкл Хаутон начал лабораторные исследования по идентификации возбудителя гепатита С. К концу 1980-х годов ему удалось добиться успеха, применив новый подход — молекулярное клонирование фрагментов генома вирусов в бактериях . Благодаря работам Хаутона и руководимой им группы исследователей удалось не только идентифицировать возбудитель, но и внедрить в повсеместное использование скрининговые тесты (их начали применять с 1990 г.), что позволило резко снизить частоту гемотрансфузионных заражений.
Чарльз Райс явился основоположником работ по изучению вируса гепатита С в лабораторных условиях с использованием модельных животных и клеточных культур . Изначально шимпанзе были единственным видом животных, которых был способен инфицировать вирус гепатита С. Но исследования на человекообразных обезьянах очень дороги и сложны и, что самое главное, на них накладываются очень строгие этические ограничения. Эти обстоятельства очень затрудняют получение новых актуальных данных. В 2000 г. возглавляемая Райсом команда исследователей сообщила об успешном опыте культивирования вируса гепатита С в клеточной линии рака печени человека. Кроме того, они достигли успеха и в создании химерной линии мышей с отключённым иммунитетом, у которых печень состоит из человеческих гепатоцитов , что делает их восприимчивыми к человеческому вирусу (отсутствие иммунитета предотвращает отторжение чужеродных клеток). Благодаря работам Райса и его группы удалось детально изучить биологию вируса и начать поиск эффективных лекарств (первые подобные работы были начаты именно в его лаборатории).
В 2020 г. Алтер, Хаутон и Райс были удостоены Нобелевской премии по физиологии и медицине за открытие вируса гепатита С и установление его роли в развитии заболеваний печени у человека. Все трое лауреатов принимали ранее и принимают сейчас активное участие в работах по созданию вакцины против вируса гепатита С .
Геном вируса представлен однонитевой линейной (+)РНК размером около 9400 нуклеотидов , которая способна выполнять функцию как мРНК , так и служить матрицей для синтеза дочерних копий вирусного генома. В геноме содержится всего один ген , который кодирует 9 различных белков . Изначально РНК вируса гепатита С транслируется с образованием полипептида длиной около 3000 аминокислот . В геноме вируса содержится два некодирующих региона и одна большая открытая рамка считывания , кодирующая структурные и неструктурные белки. Гены, кодирующие структурные белки, расположены в области 5'-конца цепочки РНК, а неструктурные — в области 3'-конца. К структурным белкам относятся core, Е1 и Е2 белки. Сore-белок является белком нуклеокапсида, он обладает РНК-связывающей активностью, модулирует транскрипцию и трансляцию некоторых клеточных генов и обладает онкогенным потенциалом. Именно с core-белком связывают выраженность прямого цитопатического эффекта вируса гепатита С. Е1 и Е2 белки — гликопротеины внешней оболочки вируса высоковариабельны, а их С-концевые части гидрофобны и могут принимать участие во взаимодействии с клеточной мембраной. В структурной зоне кодируется также пептид р7, играющий важную роль в высвобождении вириона из инфицированной клетки. Неструктурная область вирусного генома кодирует 6 белков — NS2 , NS3 , NS4A , NS4B , NS5A и NS5B . Функции NS2 и NS4 предположительно связывают с клеточной мембраной. Кроме того, белок NS2 является вирусной цинк-зависимой протеиназой и вместе с клеточными пептидазами участвует в аутокаталитическом нарезании самого себя из вирусного полипротеина. Белок NS3 — это вирусная протеиназа , играющая важную роль в процессинге вирусных белков. Белок NS4A действует как эффектор или кофактор для NS3, он регулирует фосфорилирование белка NS5A, который обладает функцией репликазы. Имеется ряд доказательств, что от NS5A зависит резистентность к IFN-α , так как в нём выделен регион, участвующий в ингибировании индуцируемой IFN-α протеинкиназы. Белок NS5B является вирусной РНК-зависимой РНК-полимеразой . Согласно современным представлениям, в инфицированной клетке белки NS4A, NS4B, NS5A и NS5B вместе с белком NS3 ассоциируются в некую структуру, которая играет важную роль в вирусной репликации. Высокая консервативность 5′- и 3′- некодирующих регионов и их важная роль в репликации вируса делают их перспективными мишенями для разработки средств лечения и профилактики вирусного гепатита С.
Одной из важнейших особенностей генома HCV является его выраженная геномная гетерогенность, обусловленная высоким уровнем репродукции и частотой возникновения ошибок при репликации (по этой причине HCV, фактически, существует как квазивид , состоящий из нескольких генотипов и множества подтипов, способных к генетической рекомбинации ; что, впрочем, характерно для многих РНК-вирусов). Скорость продукции вирусных частиц достигает 10 11 −10 12 в сутки с периодом полужизни вирусных частиц от 2,2 до 7,2 ч. (в среднем около 3 ч.). Оценочно каждый заражённый гепатоцит ежесуточно продуцирует около 50 вирионов. Подверженность мутациям отдельных участков генома различна (наиболее вариабельными являются области, кодирующие гликопротеины внешней оболочки Е2 и Е1). Подобная мультивариантность HCV приводит к постоянному состязанию между образованием новых антигенных вариантов и продукцией нейтрализующих антител , что обеспечивает «ускользание» из-под иммунологического надзора, а также формирование резистентности к противовирусным препаратам и длительную многолетнюю хроническую персистенцию HCV в организме.
Считается, что генетический материал HCV не способен интегрироваться в геном инфицированных клеток .
Размер вирионов составляет 30—50 нм.
В крови около 75 % вирусных частиц ассоциированы с липопротеинами низкой и очень низкой плотности. Синтез липопротеинов происходит в эндоплазматическом ретикулюме (ЭПР) гепатоцитов, где они, предположительно, взаимодействуют с белковолипидной оболочкой HCV, образуя комплекс (т. н. липовирусные частицы). В составе такого комплекса вирусные частицы защищены от воздействия антител и, за счёт взаимодействия с рецепторами ЛПН , проникают в клетки (в первую очередь в гепатоциты). Также в механизмах проникновения липовирусных частиц вируса гепатита С в клетки участвует рецептор (рецептор липопротеинов высокой плотности ).
Частицы вируса имеют белково-липидную оболочку, сформированную липидами инфицированных клеток и поверхностными белками вируса. Под оболочкой располагается нуклеокапсид икосаэдрической формы, который сформирован сердцевинным (core) белком и содержит вирусную РНК. Размеры нуклеокапсида составляют 33—40 нм.
Детальное строение вируса гепатита С до сих пор не выяснено, что обусловлено низким содержанием вируса в крови инфицированных людей и животных (в клеточных культурах вирус не размножается) и способностью вирусных частиц образовывать комплексы с антителами и липопротеинами крови .
РНК вируса, составляющая материальную основу его генома, может выступать в качестве мРНК , целиком транслирующейся на рибосомах ЭПР инфицированных клеток. В результате такой полной трансляции образуется полипротеин, содержащий в себе все вирусные белки. Полипротеин расщепляется на функциональные белки с помощью клеточных и вирусных протеаз (образуется 3 структурных белка, затем входящих в состав зрелого вируса, и 7 неструктурных белков, обеспечивающих репликацию HCV) . Процессы фолдинга и пострансляционых модификаций белков Е1 и Е2 целиком проходят в пространстве ЭПР.
На геномной РНК вируса, выступающей в качестве матрицы для воспроизведения, происходит и синтез дочерних копий вирусного генома при участии специфической вирусной РНК-полимеразы , образующейся в результате расщепления полипротеина. Благодаря этому геномная РНК вируса гепатита С обладает самостоятельной инфицирующей способностью (она способна инфицировать клетки даже попадая в них в «голом виде», то есть не в составе зрелых вирионов), что впрочем, характерно для всех вирусов класса IV классификации Балтимора . Дочерние копии вирусного генома, в свою очередь, могут выступать как в роли мРНК , так и входить в состав новых вирионов , продуцируемых инфицированными клетками .
Сборка частиц ВГС осуществляется в мембранах эндоплазматического ретикулума, вакуолях аппарата Гольджи и цитоплазме . Сердцевинный белок остается на цитоплазматической поверхности ЭПР и в липидных вакуолях цитоплазмы, а оболочечные белки частично проникают во внутреннюю полость ЭПР. В эндоплазматической сети белки Е1 и Е2 формируют комплекс и подвергаются процессингу , который, вероятно, заканчивается в секреторных вакуолях аппарата Гольджи. Нуклеокапсид после упаковки РНК покрывается оболочкой, и вирус выпочковывается в цистерны ЭПР. Сформировавшиеся вирусные частицы покидают клетку в составе секреторных вакуолей. Скорость образования вирионов у пациентов с хронической ВГС-инфекцией может достигать 10 12 частиц в сутки.
Помимо рецептора ЛПН, в механизмах проникновения вируса в клетки участвует рецептор CD81 (экспонированный на поверхности большинства клеток). Считается, что посредством связывания с этим рецептором в клетки проникают вирусные частицы, не ассоциированные с липопротеинами.
HCV обладает тропизмом не только к печени, но и к некоторым другим тканям и органам. Он способен, в частности, реплицироваться в клетках иммунной системы, включая моноциты / макрофаги и В-клетки , в дендритных клетках , гематопоэтических клетках-предшественниках, микроглии , кардиомиоцитах , кишечном эпителии, остеобластах и В-клеточных фолликулах лимфатических узлов . Показано, что инфицированные лимфоидные клетки могут быть причиной заражения здоровой печени при её трансплантации. Внепечёночный резервуар инфекции может служить источником реактивации болезни после прекращения интерферонотерапии, а также играть роль в развитии таких патологических процессов иммунной системы, как лимфома В-клеток и смешанная криоглобулинемия .
Известно 8 основных генотипов HCV, которые, на основании различий в первичной структуре РНК, подразделяются более чем на 100 подтипов. Типы вируса гепатита С обозначаются арабскими цифрами (1-8), а подтипы — латинскими буквами (1a, 1b, 2a и т. д.). Каждый из вирусных генотипов обладает своими особенностями патогенеза и путей передачи, что обуславливает важность правильной и точной диагностики и существенные различия в применяемой антивирусной терапии. 1b-генотип чаще приводит к развитию цирроза и гепатоцеллюлярной карциномы печени . Подтипы 1a и 3b передаются, преимущественно, «шприцевым» методом, в силу чего наиболее распространены у лиц, принимающих внутривенные наркотики . 1b подтип чаще всего передаётся при переливаниях крови .
Генотипы HCV значительно различаются по своей географической распространённости. Так, к примеру, генотип 6 распространён, преимущественно, в Юго-Восточной Азии . Генотип 4 — в Северной и Центральной Африке , 5- в Южной Африке . В Японии преобладает генотип 1b. В США — 1a генотип. В европейской части России преобладают 1b и 3a генотипы .
Инфицирование одним генотипом не даёт иммунитета против инфицирования другим типом, поэтому возможно одновременное заражение двумя и более штаммами. В большинстве из этих случаев один из штаммов доминирует над другим .
HCV способен к генетической рекомбинации между своими генотипами, подтипами генотипов и штаммами одного и того же подтипа .
Все существующие генотипы, по всей видимости, произошли от генотипа 1b. Современные методы молекулярно-эволюционных исследований показывают, что генотипы 2-6 образовались около 300—400 лет назад, а деление их на подтипы началось около 200 лет назад . Окончательно современный спектр подтипов вируса гепатита С сформировался к середине XX века .
Эволюционное происхождение HCV до сих пор остаётся невыясненным, однако общепринятой является точка зрения о его зоонозном происхождении : вероятно, вирус передался человеку от летучих мышей и/или грызунов . Данные эволюционно-филогенетических исследований свидетельствуют о том, что прародиной вируса является Африка . Расцвет работорговли в конце XVII в. положил начало выходу вируса за пределы Африканского континента и повсеместному его распространению среди населения Земли (основным — магистральным — направлением распространения был регион Карибского бассейна ). Но эволюционный анализ вируса генотипа 3 свидетельствует о том, что этот генотип начал распространяться ещё во времена арабской работорговли между Юго-Восточной Африкой, Ближним Востоком и Южной Азией . В эпоху колониализма африканские колонии послужили источником распространения вируса в страны Европы . Но вплоть до начала XX в. темпы распространения HCV в человеческой популяции были низкими, а уровень общей заболеваемости — невысоким. И только в XX столетии произошло по-настоящему глобальное распространение HCV среди населения Земли, сопровождавшееся повсеместным резким подъёмом заболеваемости с формированием отдельных эпидемически неблагополучных регионов. Можно выделить несколько волн распространения ВГС в XX в.: 1. Первая Мировая Война , сопровождавшаяся первыми по-настоящему массовыми миграциями населения между разными регионами Земного шара (в первую очередь между Европой , Юго-Восточной Азией и Северной Америкой ) 2. Вторая Мировая Война , также сопровождавшаяся массовыми миграциями и широким внедрением в медицинскую практику гемотрансфузий и методов внутривенного введения лекарственных препаратов 3. кампании по массовой вакцинации населения Земли от различных инфекционных заболеваний, начатые в 50-е годы XX в. 4. распространение героиновой наркомании начиная с 60-х гг. XX в .
Устойчив к температурам до 50 °С, но инактивируется при более высоких температурах, под действием органических растворителей, УФ-излучения и распространённых дезинфектантов . В целом вирус малоустойчив во внешней среде .
HCV обладает слабой иммуногенностью , в силу чего вызывает лишь мало выраженный и растянутый во времени иммунный ответ (специфические антитела, к тому же обладающие слабым вируснейтрализующим действием, начинают образовываться не ранее чем через 2 недели после попадания вируса в организм). Это же обстоятельство является причиной того, что HCV способен вызывать повторную инфекцию у людей, переболевших в острой форме и выздоровевших. До 60 % людей, перенесших вирусный гепатит С с выздоровлением, не имеют антител к антигенам HCV уже через 3 года (а у тех индивидуумов, в крови которых антитела обнаруживаются более длительный срок, они содержатся в низком титре) .
Попытки создания вакцины , несмотря на активные исследования практически с момента идентификации возбудителя в 1989 г., до сих пор не привели к успеху. Большинство специалистов скептически относится к самой возможности создания классической вакцины против гепатита С. В настоящее время основные усилия в этой области сосредоточены на поиске и разработке средств стимуляции клеточных механизмов противовирусного иммунитета посредством, в частности, ДНК-вакцин .