Interested Article - IRF1

seraphina
  • 2020-12-01
  • 1

Регуляторный фактор интерферон 1 — белок , который у человека кодируется геном IRF1 .

Функция

Регуляторный фактор Интерферон 1 первым из членов семейства регуляторных факторов транскрипции (IRF) интерферона был идентифицирован. Сначала был описан, как фактор транскрипции, способный активировать экспрессию цитокинов , но впоследствии было выявлено, что IRF-1 может функционировать в качестве активатора транскрипции или репрессора различных генов-мишеней. IRF-1 регулирует экспрессию генов-мишеней путём связывания с интерфероном стимулирующих элементов ответа (ISRE) в своих промоторах . Белок IRF-1 связывается с ISRE через N-терминальные спираль-поворот-спираль ДНК-связывающие домены, , которые высоко консервативны среди всех белков IRF.

Также было выявлено, что помимо своей функции в качестве фактора транскрипции, IRF-1 способен трансактивировать белок-супрессор опухолей посредством его кофактора .

IRF-1, как было выявлено, играет роль в иммунных откликах , регулирующих апоптоз , повреждения ДНК и подавление опухолей .

Регуляция

Было выявлено, что экстремальное IRF-1 регулирует способность активировать транскрипцию, , направленные в эту область (MF1) способны увеличивать активность IRF-1.

Модельные организмы

Модельные организмы были использованы при исследовании функций IRF1. Условная линия нокаутных мышей , называемая Irf1 tm1a(EUCOMM)Wtsi , была создана в рамках международной программы - большой мутагенезный проект для создания и распространения модельных животных для изучения болезней заинтересованными учёными - в институте Сенгера .

Самцы и самки животных прошли стандартное , чтобы определить влияние удаления. Двадцать пять испытаний были проведены и два фенотипических параметра оказались аномальными. мутантные животные имели патологию , в частности, уменьшение числа CD8 -положительных Т-клеток и NK клеток и увеличение CD4 -положительных Т-клеток. Мыши также имели аномалии фенотипа кожного покрова , определённого изучением хвостового эпидермиса .

Взаимодействия

IRF1 было показано, взаимодействуют с:

См. также

Примечания

  1. Maruyama M., Fujita T., Taniguchi T. Sequence of a cDNA coding for human IRF-1 (англ.) // (англ.) ( : journal. — 1989. — June ( vol. 17 , no. 8 ). — P. 3292 . — doi : . — . — PMC .
  2. Itoh S., Harada H., Nakamura Y., White R., Taniguchi T. Assignment of the human interferon regulatory factor-1 (IRF1) gene to chromosome 5q23-q31 (англ.) // Genomics : journal. — Academic Press , 1991. — November ( vol. 10 , no. 4 ). — P. 1097—1099 . — doi : . — .
  3. Miyamoto M., Fujita T., Kimura Y., Maruyama M., Harada H., Sudo Y., Miyata T., Taniguchi T. Regulated expression of a gene encoding a nuclear factor, IRF-1, that specifically binds to IFN-beta gene regulatory elements (англ.) // Cell : journal. — Cell Press , 1988. — September ( vol. 54 , no. 6 ). — P. 903—913 . — doi : . — .
  4. Escalante C.R., Yie J., Thanos D., Aggarwal A.K. Structure of IRF-1 with bound DNA reveals determinants of interferon regulation (англ.) // Nature : journal. — 1998. — January ( vol. 391 , no. 6662 ). — P. 103—106 . — doi : . — .
  5. Dornan D., Eckert M., Wallace M., Shimizu H., Ramsay E., Hupp T.R., Ball K.L. Interferon regulatory factor 1 binding to p300 stimulates DNA-dependent acetylation of p53 (англ.) // (англ.) ( : journal. — 2004. — November ( vol. 24 , no. 22 ). — P. 10083—10098 . — doi : . — . — PMC .
  6. . 8 марта 2010 года.
  7. Möller A., Pion E., Narayan V., Ball K.L. Intracellular activation of interferon regulatory factor-1 by nanobodies to the multifunctional (Mf1) domain (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2010. — December ( vol. 285 , no. 49 ). — P. 38348—38361 . — doi : . — . — PMC .
  8. . Wellcome Trust Sanger Institute. Дата обращения: 19 марта 2015. 3 апреля 2015 года.
  9. ↑ Gerdin A.K. The Sanger Mouse Genetics Programme: High throughput characterisation of knockout mice (англ.) // (англ.) ( : journal. — Wiley-Liss , 2010. — Vol. 88 , no. S248 . — doi : .
  10. от 24 декабря 2011 на Wayback Machine , Wellcome Trust Sanger Institute.
  11. . Дата обращения: 19 марта 2015. Архивировано из 20 марта 2012 года.
  12. . Дата обращения: 19 марта 2015. 9 января 2015 года.
  13. Skarnes W.C., Rosen B., West A.P., Koutsourakis M., Bushell W., Iyer V., Mujica A.O., Thomas M., Harrow J., Cox T., Jackson D., Severin J., Biggs P., Fu J., Nefedov M., de Jong P.J., Stewart A.F., Bradley A. A conditional knockout resource for the genome-wide study of mouse gene function (англ.) // Nature : journal. — 2011. — Vol. 474 , no. 7351 . — P. 337—342 . — doi : . — . — PMC .
  14. Dolgin E. Mouse library set to be knockout (англ.) // Nature. — 2011. — June ( vol. 474 , no. 7351 ). — P. 262—263 . — doi : . — .
  15. Collins F.S., Rossant J., Wurst W. A mouse for all reasons (англ.) // Cell . — Cell Press , 2007. — January ( vol. 128 , no. 1 ). — P. 9—13 . — doi : . — .
  16. van der Weyden L., White J.K., Adams D.J., Logan D.W. The mouse genetics toolkit: revealing function and mechanism. (англ.) // (англ.) ( : journal. — 2011. — Vol. 12 , no. 6 . — P. 224 . — doi : . — . — PMC .
  17. Narayan V., Pion E., Landré V., Müller P., Ball K.L. Docking dependent ubiquitination of the interferon regulatory factor-1 tumour suppressor protein by the ubiquitin ligase CHIP (англ.) // J Biol Chem. : journal. — 2010. — October ( vol. 286 , no. 1 ). — P. 607—619 . — doi : . — . — PMC .
  18. Kular R.K., Yehiely F., Kotlo K.U., Cilensek Z.M., Bedi R., Deiss L.P. GAGE, an antiapoptotic protein binds and modulates the expression of nucleophosmin/B23 and interferon regulatory factor 1 (англ.) // J. Interferon Cytokine Res. : journal. — 2009. — October ( vol. 29 , no. 10 ). — P. 645—655 . — doi : . — .
  19. Narayan V., Eckert M., Zylicz A., Zylicz M., Ball K.L. Cooperative regulation of the interferon regulatory factor-1 tumor suppressor protein by core components of the molecular chaperone machinery (англ.) // J Biol Chem. : journal. — 2009. — September ( vol. 284 , no. 38 ). — P. 25889—25899 . — doi : . — . — PMC .
  20. Schaper F., Kirchhoff S., Posern G., Köster M., Oumard A., Sharf R., Levi B.Z., Hauser H. Functional domains of interferon regulatory factor I (IRF-1) (англ.) // (англ.) ( : journal. — 1998. — October ( vol. 335 , no. 1 ). — P. 147—157 . — . — PMC .
  21. Sharf R., Azriel A., Lejbkowicz F., Winograd S.S., Ehrlich R., Levi B.Z. Functional domain analysis of interferon consensus sequence binding protein (ICSBP) and its association with interferon regulatory factors (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1995. — June ( vol. 270 , no. 22 ). — P. 13063—13069 . — doi : . — .
  22. Umegaki N., Tamai K., Nakano H., Moritsugu R., Yamazaki T., Hanada K., Katayama I., Kaneda Y. Differential regulation of karyopherin alpha 2 expression by TGF-beta1 and IFN-gamma in normal human epidermal keratinocytes: evident contribution of KPNA2 for nuclear translocation of IRF-1 (англ.) // (англ.) ( : journal. — 2007. — June ( vol. 127 , no. 6 ). — P. 1456—1464 . — doi : . — .
  23. Negishi H., Fujita Y., Yanai H., Sakaguchi S., Ouyang X., Shinohara M., Takayanagi H., Ohba Y., Taniguchi T., Honda K. Evidence for licensing of IFN-gamma-induced IFN regulatory factor 1 transcription factor by MyD88 in Toll-like receptor-dependent gene induction program (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2006. — October ( vol. 103 , no. 41 ). — P. 15136—15141 . — doi : . — . — PMC .
  24. Masumi A., Wang I.M., Lefebvre B., Yang X.J., Nakatani Y., Ozato K. The histone acetylase PCAF is a phorbol-ester-inducible coactivator of the IRF family that confers enhanced interferon responsiveness (англ.) // (англ.) ( : journal. — 1999. — March ( vol. 19 , no. 3 ). — P. 1810—1820 . — . — PMC .
  25. Chatterjee-Kishore M., van Den Akker F., Stark G.R. Adenovirus E1A down-regulates LMP2 transcription by interfering with the binding of stat1 to IRF1 (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2000. — July ( vol. 275 , no. 27 ). — P. 20406—20411 . — doi : . — .
  26. Sgarbanti M., Borsetti A., Moscufo N., Bellocchi M.C., Ridolfi B., Nappi F., Marsili G., Marziali G., Coccia E.M., Ensoli B., Battistini A. Modulation of human immunodeficiency virus 1 replication by interferon regulatory factors (англ.) // (англ.) ( : journal. — (англ.) ( , 2002. — May ( vol. 195 , no. 10 ). — P. 1359—1370 . — doi : . — . — PMC .
  27. Lee J.H., Chun T., Park S.Y., Rho S.B. Interferon regulatory factor-1 (IRF-1) regulates VEGF-induced angiogenesis in HUVECs (англ.) // (англ.) ( : journal. — 2008. — September ( vol. 1783 , no. 9 ). — P. 1654—1662 . — doi : . — .

Литература

  • Harada H., Taniguchi T., Tanaka N. The role of interferon regulatory factors in the interferon system and cell growth control (англ.) // (англ.) ( : journal. — 1999. — Vol. 80 , no. 8—9 . — P. 641—650 . — doi : . — .
  • Pitha P.M., Au W.C., Lowther W., Juang Y.T., Schafer S.L., Burysek L., Hiscott J., Moore P.A. Role of the interferon regulatory factors (IRFs) in virus-mediated signaling and regulation of cell growth (англ.) // (англ.) ( : journal. — 1999. — Vol. 80 , no. 8—9 . — P. 651—658 . — doi : . — .
  • Yu-Lee L. Stimulation of interferon regulatory factor-1 by prolactin (англ.) // Lupus : journal. — 2002. — Vol. 10 , no. 10 . — P. 691—699 . — doi : . — .
  • Pine R. IRF and tuberculosis (неопр.) // J. Interferon Cytokine Res.. — 2002. — Т. 22 , № 1 . — С. 15—25 . — doi : . — .
  • Romeo G., Fiorucci G., Chiantore M.V., Percario Z.A., Vannucchi S., Affabris E. IRF-1 as a negative regulator of cell proliferation (неопр.) // J. Interferon Cytokine Res.. — 2002. — Т. 22 , № 1 . — С. 39—47 . — doi : . — .
  • Cha Y., Sims S.H., Romine M.F., Kaufmann M., Deisseroth A.B. Human interferon regulatory factor 1: intron-exon organization (англ.) // (англ.) ( : journal. — 1992. — Vol. 11 , no. 8 . — P. 605—611 . — doi : . — .
  • Harada H., Fujita T., Miyamoto M., Kimura Y., Maruyama M., Furia A., Miyata T., Taniguchi T. Structurally similar but functionally distinct factors, IRF-1 and IRF-2, bind to the same regulatory elements of IFN and IFN-inducible genes (англ.) // Cell : journal. — Cell Press , 1989. — Vol. 58 , no. 4 . — P. 729—739 . — doi : . — .
  • Miyamoto M., Fujita T., Kimura Y., Maruyama M., Harada H., Sudo Y., Miyata T., Taniguchi T. Regulated expression of a gene encoding a nuclear factor, IRF-1, that specifically binds to IFN-beta gene regulatory elements (англ.) // Cell : journal. — Cell Press , 1988. — Vol. 54 , no. 6 . — P. 903—913 . — doi : . — .
  • Harada H., Takahashi E., Itoh S., Harada K., Hori T.A., Taniguchi T. Structure and regulation of the human interferon regulatory factor 1 (IRF-1) and IRF-2 genes: implications for a gene network in the interferon system (англ.) // (англ.) ( : journal. — 1994. — Vol. 14 , no. 2 . — P. 1500—1509 . — . — PMC .
  • Sharf R., Azriel A., Lejbkowicz F., Winograd S.S., Ehrlich R., Levi B.Z. Functional domain analysis of interferon consensus sequence binding protein (ICSBP) and its association with interferon regulatory factors (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1995. — Vol. 270 , no. 22 . — P. 13063—13069 . — doi : . — .
  • Willman C.L., Sever C.E., Pallavicini M.G., Harada H., Tanaka N., Slovak M.L., Yamamoto H., Harada K., Meeker T.C., List A.F. Deletion of IRF-1, mapping to chromosome 5q31.1, in human leukemia and preleukemic myelodysplasia (англ.) // Science : journal. — 1993. — Vol. 259 , no. 5097 . — P. 968—971 . — doi : . — .
  • Drew P.D., Franzoso G., Becker K.G., Bours V., Carlson L.M., Siebenlist U., Ozato K. NF kappa B and interferon regulatory factor 1 physically interact and synergistically induce major histocompatibility class I gene expression (англ.) // J. Interferon Cytokine Res. : journal. — 1997. — Vol. 15 , no. 12 . — P. 1037—1045 . — doi : . — .
  • Ronco L.V., Karpova A.Y., Vidal M., Howley P.M. Human papillomavirus 16 E6 oncoprotein binds to interferon regulatory factor-3 and inhibits its transcriptional activity (англ.) // Genes Dev. : journal. — 1998. — Vol. 12 , no. 13 . — P. 2061—2072 . — doi : . — . — PMC .
  • Nozawa H., Oda E., Ueda S., Tamura G., Maesawa C., Muto T., Taniguchi T., Tanaka N. Functionally inactivating point mutation in the tumor-suppressor IRF-1 gene identified in human gastric cancer (англ.) // (англ.) ( : journal. — 1998. — Vol. 77 , no. 4 . — P. 522—527 . — doi : . — .
  • Schaper F., Kirchhoff S., Posern G., Köster M., Oumard A., Sharf R., Levi B.Z., Hauser H. Functional domains of interferon regulatory factor I (IRF-1) (англ.) // (англ.) ( : journal. — 1998. — Vol. 335 , no. 1 . — P. 147—157 . — . — PMC .
  • Masumi A., Wang I.M., Lefebvre B., Yang X.J., Nakatani Y., Ozato K. The histone acetylase PCAF is a phorbol-ester-inducible coactivator of the IRF family that confers enhanced interferon responsiveness (англ.) // (англ.) ( : journal. — 1999. — Vol. 19 , no. 3 . — P. 1810—1820 . — . — PMC .
Источник —

seraphina
  • 2020-12-01
  • 1
  • Tags:

Same as IRF1

The title for the last searches