Interested Article - Белки группы polycomb

aoibhe
  • 2020-08-19
  • 1

Запрос « » перенаправляется сюда. На эту тему нужно создать отдельную статью .
Запрос « » перенаправляется сюда. На эту тему нужно создать отдельную статью .

Белки группы polycomb ( англ. Polycomb-group proteins , PcG ) — это семейство белков , которые способны ремоделировать хроматин . Эти белки-регуляторы были впервые описаны у дрозофил , где они подавляют гомеозисные гены , контролирующие индивидуальные отличия сегментов развивающегося эмбриона .

Белки группы поликомб (PcG) представляют собой семейство эпигенетических регуляторов, которые, модифицируя гистоны , подавляют активность множества генов, отвечающих за клеточную дифференциацию . Садясь на хроматин, чтобы вызвать локальные и глобальные изменения в хромосомной конформации, белки группы polycomb регулируют организацию их генов-мишеней в трёхмерном пространстве ядра. Влияя на 3D-архитектуру генома, они участвуют в регуляции процессов дифференциации клеток и поддержания клеточной памяти . Они так видоизменяют структуру хроматина , что транскрипционные факторы не могут связываться с промоторными последовательностями ДНК .

Классификация

В организмах животных (дрозофилы, млекопитающих) и растений выявлено по меньшей мере пять типов комплексов, содержащих белки поликомб:

  • ингибиторный комплекс 1 (polycomb repressive complex 1, PRC1 ) ;
  • ингибиторный комплекс 2 ( PRC2 ) ;
  • ингибиторный комплекс Pho (PhoRC), содержащий ДНК-связывающие белки Pho (Pleiohomeotic) и dSfmbt (Scm-like with four mbt domains), а также, по некоторым данным, гистондеацетилазу Rpd3, шаперон гистонов NAP1, негистоновый белок HP1b, связывающий хроматин и неохарактеризованный белок CG3363 ;
  • комплекс dRing (Drosophila Ring) связанных факторов (dRAF), который состоит из белков dRing/Sce (Sex combs extra), Psc (Posterior sex combs), и dKdm2 (лизин-деметилаза гистонов дрозофилы)
  • репрессорный комплекс де убиквитиназ ( PR-DUB ) .

PcG млекопитающих

У млекопитающих найдены две основные группы, содержащие комплексы белков группы polycomb — это ингибиторные комплексы 1 и 2 (PRC1 и PRC2), гены PRC1 млекопитающих значительно схожи с соответствующими генами дрозофилы. Показано, что экспрессия генов группы polycomb имеет большое значение развитии зародыша; мыши, нокаутные по обеим копиям генов PRC2, погибают на стадии зародыша, в то время как нокауты по генам PRC1 являются гомеозисными мутантами и погибают после рождения . Повышение уровня экспрессии белков группы polycomb повышает инвазивность и коррелирует с более тяжелым развитием раковых опухолей .

Комплекс PRC1

Эта статья — о  белковом комплексе, участвующем в эпигенетической регуляции. О митотическом сшивающем белке-регуляторе цитокинеза PRC1 см. .

Комплекс PRC1 состоит из нескольких субъединиц :

  • и (polyhomeotic) — точная функция пока не ясна.
Метилирование лизина (К)
  • Семейство субъединиц , которые участвуют в механизмах поддержания баланса между самообновлением и дифференцировкой стволовых клеток: (субъединицы CBX2, CBX4 и CBX8 — связываются с гистоном К27me3, ингибируют экспрессию гена , необходимого для поддержания плюрипотентного состояния клетки и таким образом способствуют дифференцировке клеток, в свою очередь CBX7 ингибирует синтез субъединиц CBX2, CBX4 и CBX8, необходимых для дифференцировки, и таким образом поддерживает плюрипотентное состояние клетки). Белок CBX7 (а через него и весь комплекс PRC1) связывается с гистоном нуклеосомы с помощью своего хромодомена. Разработаны малые молекулы, содержащие триметиллизин, способные предотвратить образование комплекса CBX7-H3K27me3. Обнаружено что субъединица CBX7 необходима для сохранения мышц и поддержания жизни в организме во время диапаузы .
  • (B lymphoma Mo‑MLV insertion region 1 homolog) — необходима для пролиферации стволовых клеток . Это связано с тем, что она подавляет экспрессию белков p16Ink4a и p19Arf (оба эти белка кодируются альтернативными рамками считывания локуса Ink4a/Arf, известного также как Cdkn2a), препятствующих перепрограммированию в индуцированные плюрипотентные стволовые клетки ( ИПСК ). Кроме того Bmi1 может замещать транскрипционные факторы Sox2, Klf4 и c- Myc при перепрограммировании фибробластов в ИПСК. Предполагается, что Bmi1 контролирует работу митохондрий и образование в них реактивных форм кислорода, способных вызвать повреждения ДНК. Количество Bmi1 в клетке регулируется микроРНК-141, которая, подавляет его синтез, связываясь с его мРНК в 3'-нетранслируемой области. В регуляции уровня Bmi1 в клетке участвуют факторы транскрипции семейств Myc , , , , E2F1 и . Поскольку Bmi1 является привлекательной терапевтической мишенью для лечения различных раковых заболеваний человека и перепрограммирования клеток сердечной мышцы , была найдена малая молекула PTC-209 специфически ингибирующая Bmi1 .
  • (Polycomb group RING finger protein 1). В PRC1-подобном комплексе PCGF1-PRC1 субъединица PCGF1 необходима для инициации репрессии гена, опосредованной группой Polycomb, во время дифференцировки поскольку регулирует активность убиквитинлигазы RING1B, которая катализирует убиквитинирование Lys119 на гистоне H2A, что необходимо для привлечения PRC2 на . Отсутствие PCGF1-PRC1 приводит к аберрантной экспрессии генов-мишеней .
  • (Polycomb group RING finger protein 2) ортолог Bmi1. Функционально не отличается от Bmi1 .
  • был найден в комплексах PRC1, которые имеют H3K9-метилтрансферазу и тех, которые имеют активность H3K4-деметилаз . Pcgf6 необходим для поддержания идентичности эмбриональных стволовых клеток (ЭСК). В отличие от канонической PRC1, комплексы с Pcgf6 действуют как позитивный регулятор транскрипции и связываются преимущественно с промоторами, несущими активные метки хроматина. Уровень синтеза Pcgf6 в ЭСК обычно высок и необходим для того чтобы препятствовать дифференциации, так как Pcgf6 необходим для поддержания синтеза транскипционных факторов Oct-4 , и Nanog .
  • или его гомолог YAF2-субъединица альтернативного комплекса RYBP-PRC1, который содержит RYBP, RING1B, и PCGF2/ Bmi1 и не содержит субъединиц CBX, PHC, SCM. Для активации RYBP требуется подавить "созревание" микроРНК -125b, которая ингибирует RYBP. Активация RYBP приводит к RYBP-зависимому убиквитинированию H2AK119 и подавлению генов, необходимых для дифференцировки. Кроме того, RYBP требуется для посадки на промотор (ген гистондеметилазы), что необходимо для успешной активации эндогенных генов плюрипотентности при перепрограммировании клеток в ИПСК .
  • — субъединица комплекса PRC1, которая осуществляет моноубиквитинирование гистона H2A с образованием H2A K119ub. Удаление гена Ring1B приводит к потере сразу нескольких белков PRC1, в том числе RYBP, Cbx4, PCGF2 и Bmi1 .
  • ( ) — этот ядерный белок во время митоза перемещается к центромерам. Он играет важную роль в организации хроматина, разделении хромосом и в механизмах митоза, функционируя как метилтрансфераза, метилирующая лизин-9 с образованием Н3К9me3 — метки репрессии .
  • — член атипичного комплекса PRC1. Он имеет важное значение для раннего эмбрионального развития. Способствует пролиферации клеток и подавляет дифференциацию. Взаимодействует с факторами плюрипотентности и аналогом PRC1 содержащим G9A, Hdac1 и Ring1b.

Комплекс PRC1 ингибирует экспрессию генов и переводит хроматин в компактную форму — гетерохроматин . С помощью субъединицы CBX он связывает «метку репрессии» — гистон Н3К27me3 в составе нуклеосомы. Кроме того, с помощью субъединицы Bmi1 комплекс связывает нуклеосомы через комплекс транскрипционных факторов Runx1/CBFβ независимо от метки Н3К27me3. С помощью субъединицы RING1, стимулируемой субъединицей Bmi1 или RYBP, PRC1 осуществляет моноубиквитинирование гистона H2A с образованием H2A K119ub, что приводит к компактизации хроматина. Кроме того с помощью субъединицы CBX7 он способствует связыванию длинных некодирующих РНК (lncRNA) c промоторными областями, что приводит к ингибированию соответствующих генов. CBX7 в этом случае играет роль «кепирующей» шапочки, предотвращающей деградацию lncRNA с последующей «незапланированной» активацией гена.

Комплекс PRC2

Комплекс PRC2 вызывает репрессию транскрипции путём метилирования гистонов и негистоновых белков. Для его посадки на ген-мишень необходима метка активного хроматина Н3К4me3 (в образовании которой важную роль играют белки группы Trithorax ) и специальная некодирующая РНК, связывающая субъединицу SUZ12. Существуют две различные формы PRC2, которые помимо сердцевины состоящей из EZH1/2, SUZ12, EED, а также ( RBBP4 /7) , содержат кофакторы , это: PRC2.1 (содержащий один из поликомподобных белков PALI1/2) и PRC2.2 (содержащий AEBP2 и JARID2). Комплекс PRC2 имеет сложную молекулярную архитектуру и состоит из нескольких субъединиц:

  • Ezh1 помогает удерживать PRC2 на хроматине покоящихся клеток, в которых не идет синтез Jarid2 .
  • (Enhancer of Zester Homolog 2) — метилтрансфераза гистонов и негистоновых белков. Ezh2 обычно присутствует в клетках, которые слабо дифференцированы и активно делятся . EZH2 необходим для восстановления тканей, способствует регенеративной пролиферации прогениторных клеток. Потеря EZH2 приводит к нарушению регенерации, тогда как избыточный синтез метилтрансферазы EZH2 приводит к неопластической трансформации клетки, а мутации в её каталитическом домене приводят к лимфоме . Помочь борьбе с этими заболеваниями может GSK126, которая с высокой избирательностью ингибирует EZH2, конкурируя при этом с S-аденозил-метионином (SAM), в результате чего снижается уровень метилированных H3K27 и активируются гены-мишени, подавляемые PRC2. Гистон H3 имеет несколько изоформ, одна из которых — гистон H3.3 (содержащая в позиции 31 аминокислотной последовательности треонин) присутствует только в тех местах, где гены активны, тогда как изоформа H3.1 (содержащая в позиции 31 аланин) встречается главным образом в частях генома, где нет активных генов. Это объясняется тем, что метилттрансфераза ATXR5 (Arabidopsis Trithorax-related protein 5), метилирующая лизин-27 гистона H3 (H3K27), имеет домен, который, «прочитав» треонин-31 (вместо аланина-31) в гистоне H3, ингибирует метилттрансферазную активность ATXR5. Поэтому изоформа H3.3 не может быть модифицирована меткой H3K27me1. Таким образом, участки генов, содержащих большое количество гистонов H3.3, защищены от гетерохроматизации и подавления активности во время репликации ДНК
  • EED ( англ. embryonic ectoderm development ) — субъединица комплекса PRC2, функция которой пока не вполне понятна. Предполагается что она обладает способностью связывать как с белки комплекса PRC2, так и белки комплекса PRC1. Таким образом, EED консолидирует белки комплекса PRC2 и помогает последующей посадке комплекса PRC1 на трижды метилированый локус H3K27 гена-мишени, а также повышает убиквитинлигазную активность PRC1
  • ( англ. Suppressor of Zeste 12 ) — субъединица, связывающая короткие некодирующие РНК длиной 50-200 нуклеотидов, экспрессируемые с 5'-конца генов-мишеней polycomb в первичных T-лимфоцитах и зародышевых стволовых клетках
  • (Adipocyte Enhancer-Binding Protein) - этот белок является RBBP4 /7-связывающим кофактором PRC2.2 , регулируется промотором, расположенным на ретротранспозоне , который имеет необычный характер метилирования ДНК . Предполагается, что именно благодаря регуляции субъединицей AEBP2 PRC2 предпочтительно связывает метилированную ДНК при подавлении транскрипции на хроматине . Эта субъединица понижает активность метилирования и соответственно уровень гистона H3K27me3
  • ( англ. jumonji, AT rich interactive domain 2 ) — деметилаза гистонов, один из ключевых эпигенетических регуляторов процессов развития. Jarid2, также как и Ezh2 обычно присутствует в клетках, которые слабо дифференцированы и активно делятся , функционирует как транскрипционный репрессор генов-мишеней. Предполагается что JARID2 взаимодействует с некодирующими РНК (lncRNA) и комплексом PRC2 и таким образом регулирует связывание PRC2 с хроматином . Синтез Jarid2 значительно повышен в ЭСК по сравнению с дифференцированными клетками. Нокдаун этой субъединицы приводит к активации генов, связанных с дифференцировкой клетки и существенно снижает возможность перепрограммирования фибробластов в ИПСК.
  • Mtf2 ( англ. metal response element binding transcription factor 2 ) известен также как PCL2 ( англ. polycomb-like 2 ). Нокдаун гена этой субъединицы приводит к активации генов, связанных с дифференцировкой клетки, и существенно снижает возможность перепрограммирования фибробластов в ИПСК
  • esPRC2p48 — экспрессируется в эмбриональных стволовых клетках мыши на более высоком уровне, чем в дифференцированных клетках. Коэкспрессия генов JARID2, MTF2, и esPRC2p48 усиливает Oct4/Sox2/Klf4-опосредованное репрограммирование эмбриональных фибробластов мыши в индуцированные плюрипотентные стволовые клетки.
  • ( англ. Mouse double minute 2 homolog ), физически связываясь с EZH2 на хроматине, поддерживает Polycomb-опосредованную репрессию ряда генов, способствуя повышению триметилирования гистона 3 по лизину 27 и убиквитинирования гистона 2А на лизине 119 (H2AK119). Удаление или инактивация MDM2 одновременно с H2AK119 E3 лигазой Ring1B / останавливает пролиферацию клеток, независимо от р53 Митогенная роль MDM2 необходима для заживления ран при повреждении тканей. Вместе с тем MDM2 способствует воспалению тканей .
  • PALI1 и PALI2 соответственно именуемые ( англ. PRC2 associated 1) и ( англ. PRC2 associated 2), белки которые присутствуют только у позвоночных животных и не встречается у беспозвоночных животных или растений. Они также отсутствуют в PRC2 комплексах содержащих AEBP2. Повышают активность метилирования и уровень гистона H3K27me3
  • ( англ. Addition of sex combs-like 1 ), физически взаимодействует с членами PRC2 и необходим для его посадки на ДНК хроматина. Потеря или мутация ASXL1 в гемопоэтических клетках связана с глобальной потерей H3K27me3 по всему геному и в частности на локусе HOXA , что приводит к , а также способствует трансформации в миелоидные клетки .

Длинные и короткие некодирующие РНК (lncRNA и miRNA)

Длинные некодирующие РНК ( ) взаимодействуют с хроматином и ингибируют транскрипцию соответствующих генов, помогают комплексам PRC2 и PRC1 выбрать ген-мишень . Обнаружено, что для lncRNA гораздо больше выражена тканевая специфичность по сравнению с кодирующими РНК, что делает их привлекательными диагностическими маркерами .

  • — взаимодействует с PRC2 и PRC1, ингибирует кластер Kcnq1.
  • Xist — взаимодействует с PRC2, участвует в модификации гистонов Х-хромосомы В ходе инактивации Х-хромосомы продукт Xist распределяется по эухроматиновым участкам на вблизи теломер Х-хромосомы согласно их трехмерной структуре, но не нуклеотидной последовательности . Для того чтобы Xist взаимодействовала с PRC2 и посадила его на Х-хромосому необходимы белки SHARP (SMRT and HDAC associated repressor protein), который взаимодействует с корепрессором и Гистондеацетилаза 3 .
  • — взаимодействует с PRC2 и ингибирует локус НОХ .
  • (Antisense Non-coding RNA in the INK4 Locus) — взаимодействует с PRC1 и PRC2. Вызывает ингибирование комплексом PRC1 локуса INK4b/ARF/INK4a, ответственного за подавление опухолевого роста путём активации старения клетки Обнаружено, что ANRIL ускоряет развитие атеросклероза и поэтому является биомаркером и фактором риска ишемической болезни сердца .
  • Gtl2 ( ) является lncRNA, регулирующей импринтинг в локусе . Она непосредственно связывается с PRC2. Нокдаун Gtl2 в эмбриональных стволовых клетках мыши приводит к снижению содержания Ezh2 на промоторе Dlk1 и активации экспрессии Dlk1 . ИПСК , у которых синтез Gtl2 подавлен, не способны к нормальной дифференцировке, о чём свидетельствует их неспособность дать начало химерным мышам и мышам, состоящим только из ИПСК
  • Fendrr играет важную роль в регуляторных сетях, контролирующих образование мезодермы . Она участвует в эпигенетической модификации генных промоторов . Связываясь с комплексм PRC2, она действует как модулятор хроматина, изменяющий активность соответствующих генов. В эмбрионах, у которых не хватает Fendrr, нарушается развитие стенок сердца, которое связано с резким сокращением числа PRC2 и уменьшением триметилирования H3K27 на промоторных участках.
  • Pint (p53-индуцированный некодирующий транскрипт) — длинная межгенная некодирующая РНК ( ), регулируемая p53 . Pint способствует пролиферации и выживанию клеток путём регуляции экспрессии генов путей TGF-бета , и р53. Pint является ядерной lincRNA, которая непосредственно взаимодействует с PRC2 и требуется для адресной доставки PRC2 на конкретные гены для три-метилирования H3K27, вызывающего их репрессию. Pint участвует в механизме негативной ауторегуляции p53, где lincRNA соединяет активацию р53 с эпигенетической репрессией, вызванной PRC2 .
  • lncRNA способна активировать пролиферацию клеток, подавляя синтез транскрипционного фактора RUNX1 , а также связываясь с промотором поликомб белка EZH2 . Кроме того она, связывает как молекулярная губка микроРНК , которая играет важную роль в синтезе EZH2 и, взаимодействуя с белком (methyl-CpG-binding domain protein 1), участвует в поддержании репрессивных -гистоновых меток, необходимых для подавления сети импринтинга генов , что в свою очередь необходимо для контроля за уровнем экспрессии факторов роста у эмбрионов. H19 в изобилии синтезируется в эмбриональных тканях, но строго подавляется после рождения. Существенная транскрипция её сохраняется только в скелетных мышцах, где она необходима для дифференцировки сателлитных клеток в зрелые мышечные клетки и регенерации .
  • lncRNA FAL1 (focally amplified on chromosome 1) — онкогенная РНК, регулирующая стабильность Bmi1, что приводит к изменению транскрипции ряда генов, в том числе к ингибированию CDKN1A/p21 . Репрессия синтеза FAL1 препятствует росту опухолей, но активирует старение
  • lncRNA MIR31HG взаимодействует с белками группы Polycomb и вместе с ними участвует в репрессии локуса INK4A в механизме, активирующем старение при онкогенезе - важном механизме подавления роста опухолей .
  • - взаимодействует с SUZ12 комплекса PRC2 для установления и поддержания хроматина теломер в виде гетерохроматина . Предполагается что опосредованная TERRA посадка поликомб комплекса на гены плюрипотентности и дифференцировки регулируется компонентом комплекса шелтерин

Смотри также обзор

Факторы транскрипции

  • Транскрипционный фактор , известный также как NRSF (neuron-restrictive silencer factor) — ингибирует связывание PRC1 и PRC2 с участками вблизи промотора и, связываясь с субъединицей CBX, способствует независимой от метки Н3К27me3 посадке PRC1 на участки, отдаленные от промотора . REST сильно коррелирует с увеличением продолжительности жизни. Уровни REST были самыми высокими в мозгах людей, которые дожили до 90 — 100 лет и при этом не заболели деменцией .
  • / (runt-related transcription factor 1/Core-binding factor subunit beta) - может взаимодействовать с SUV39H1 и с субъединицей Bmi1 комплекса PRC1. Runx1 является фактором транскрипции, регулирующим дифференциацию гемопоэтических стволовых клеток в зрелые клетки крови. Белки Runx образуют гетеродимерный комплекс с CBFβ , что увеличивает стабильность его связи с ДНК.
  • Транскрипционный фактор (Yin and Yang 1) — совместно с подавляет синтез белка , предотвращая таким образом клеточное старение. Он необходим для посадки RYBP-PRC1 на промотор.

Схема эпигенетической регуляции комплексами PRC2 и PRC1

Схема эпигенетической регуляции комплексами PRC2 и PRC1. Сокращения: лизин (К), серин (S), фосфат (p), ацетат (ac), метил (me).

Для того чтобы комплекс PRC2 точно попал на необходимый участок гена-мишени, он должен связаться с короткой некодирующей РНК, которая транскрибируется с 5′-конца гена-мишени, подлежащего репрессии. Помогает посадке комплекса PRC2 на сайты, подлежащие репрессии, очевидно также РНК-связывающий белок , поскольку его инактивация приводит к дерепрессии генов . Транскрипцию этой РНК осуществляет РНК-полимераза II- S5p с промотора гена, активированного меткой H3K4me3. Только после того как PRC2 свяжется с этой РНК с помощью его субьединицы SUZ12, он становится способен метилировать лизин 27 гистона Н3 в составе нуклеосомы, контролирующей ген-мишень. Однако для этого лизин 27 предварительно должен быть деацетилирован комплексом . После того как PRC2 с помощью своей субьединицы EZH2 осуществляет тройное метилирование гистона Н3 с образованием H3K27me3, в действие вступает PRC1, который связывается с нуклеосомой либо через «метку репрессии» — H3K27me3, которую узнает его субъединица CBX, либо через один из транскрипционных факторов (REST, YY1 или Runx1/CBFβ). Далее PRC1 закрепляет ингибирование гена, проводя посадку убиквитина на лизин 119 гистона H2A (H2A K119ub).

Тот факт, что установка меток H3K27me3 обычно происходит в промежуток клеточного цикла, предшествующий репликации ДНК, позволяет предположить, что модификации гистонов белками Поликомб играют важную роль в сохранении эпигенетической памяти во время деления клетки

Показано, что сами по себе изменения в транскрипционной активности могут регулировать модификацию H3K27me3 гистонов. Отмены транскрипции, вызванной удалением сайта начала транскрипции, достаточно, чтобы вызвать накопление H3K27me3. С другой стороны, принудительной активации транскрипции с помощью искусственного d Cas9 -активатора достаточно, чтобы удалить метку H3K27me3 .

Опосредованное комплексом PRC2 триметилирование лизина 27 в гистоне H3 и связанное с ним ингибирование ряда генов являются необходимым условием перепрограммирования соматических клеток в ИПСК

Помимо триметилирования H3K27 для подавления транскрипции и ацетилирования H3K27 для активации транскрипции, есть еще кротонилирование H3K27, которое подавляет транскрипцию под воздействием ферментного комплекса, активируемого протоонкогенным фактором транскрипции Myc .

Бивалентные участки хроматина

Внимание многих исследователей привлекают гены, называемые , потому что они имеют как маркеры репрессии (H3K27me3), так и маркеры активации (H3K4me3) , выполняющие роль аллостерических регуляторов . Ферментом, который катализирует H3K4-триметилирование на бивалентных промоторах генов, регулирующих развитие, таких как гены Hox из эмбриональных стволовых клеток, является член семейства COMPASS , называемый (KMT2b) . Маркер H3K4me3 нужен для транскрипционной активности РНК-полимеразы II — S5p, синтезирующей короткую некодирующую РНК, необходимую при посадке PRC2, тогда как H3K27me3 необходим для связывания CBX-белков комплекса PRC1. Бивалентные участки хроматина присутствуют у эмбрионов начиная со стадии 8 клеток вплоть до стадии бластоцисты, при которой клетки подразделяются на две популяции: внутренние клетки, из которых образуются эмбриональные стволовые клетки и поверхностный слой эмбриона ( трофобласт ). Набор генов клеток поверхностного слоя все ещё содержит бивалентные гены, однако на этих участках уже нет PRC1, хотя все ещё есть PRC2. Ключевую роль в этих клетках уже выполняют , которая катализирует в бивалентных генах триметилирование лизина 9 в гистоне H3 (H3K9me3) и комплекс G9a/GLP, который выполняет ту же функцию но с участием комплекса PRC2 . Метка H3K9me3 препятствует перепрограммированию соматических клеток в индуцированные стволовые клетки , так как мешает посадке белковых репрограммирующих факторов плюрипотенции (Oct4, Sox2, Klf4, и c-Myc) на гены мишени. Инактивация ферментов, которые вызывают эту метку, значительно увеличивает темпы перепрограммирования . Обнаружено, что два типа маркеров репрессии — модификации H3K9me2 и H3K27me3 — являются взаимоисключающими . В процессе дифференцировки эмбриональных стволовых клеток бивалентные гены исчезают , оставаясь только в менее дифференцированных клетках, таких как взрослые стволовые клетки, кроветворные (гемопоэтические) клетки и сателитные (прогениторные) клетки организма. Однако они возникают при пролиферации клеток вследствие регенерации или опухолевого роста . При перепрограммировании соматических клеток в ИПСК локус Ink4a/Arf эпигенетически преобразуется в «молчащую» бивалентную форму с маркерами H3K27me3 и H3K4me3, что приводит к репрессии локуса Ink4a/Arf, который кодирует такие ингибиторы киназы клеточного цикла (CDK) как p16INK4A и p19Arf . Прямо противоположный процесс наблюдается при индуцированном онкогеном RAF1 старении, когда киназа MSK1 (mitogen- and stress-activated kinase 1) осуществляет фосфорилирование серина 28 в гистоне H3K27me3, что вызывает удаление репрессорных комплексов PRC1/2 и активирует экспрессию локуса Ink4ab/Arf, приводящую к старению клетки .

Роль в импринтинге

Геномный импринтинг - это эпигенетический феномен, при котором гены у потомства экспрессируются моноаллельно в зависимости от того кому из родителей (отцу или матери) они принадлежали до оплодотворения. Метка H3K27me3 проставляемая комплексом PRC2 как выяснилось играет важную роль в механизмах импринтинга В частности, потеря H3K27me3-опосредованного импринтинга понижает эффективность клонирования животных и способствует дефектам развития, наблюдаемым у клонированных эмбрионов . Поэтому исправление H3K27me3-опосредованного импринтинга может значительно повысить эффективность клонирования .

Роль поликомб репрессорных комплексов в развитии и старении

На сайтах-мишенях белков SUZ12 и EED (входящих в состав репрессирующего комплекса PRC2) и на доменах бивалентного хроматина, которые контролируют экспрессию таких гомеозисных генов как HOX и PAX и другие онтогенетические гены позвоночных, как оказалось, расположены гены содержащие гиперметилированные возрастные . Поэтому, и модификация H3K27me3 в нуклеосомах , и регуляция метилирования генов на промоторах, участвующих в развитии и старении могут представлять собой единый ключевой механизм роста и старения , отображаемый формулами универсальных эпигенетических часов для вычисления биологического возраста . В частности данные ChIP-seq , полученные по семи меткам гистонов (трех, , и связаных с эухроматином ; еще двух, H3K9me3 и H3K27me3 связаных с гетерохроматином ; одной, , связаной с элонгацией транскрипции и гетерохроматином; а также ещё одной, , связанной с энхансерами ), могут быть использованы в качестве основы для разработки высокоточных предикторов возраста.

Примечания

  1. ↑ Lanzuolo C. , Orlando V. (англ.) // Annual review of genetics. — 2012. — Vol. 46. — P. 561—589. — doi : . — . [ ]
  2. Mallo M. , Alonso C. R. (англ.) // Development (Cambridge, England). — 2013. — Vol. 140, no. 19 . — P. 3951—3963. — doi : . — . [ ]
  3. Lewis E. B. (англ.) // Nature. — 1978. — Vol. 276, no. 5688 . — P. 565—570. — . [ ]
  4. Pirrotta V. (англ.) // Cell. — 1998. — Vol. 93, no. 3 . — P. 333—336. — . [ ]
  5. Huang C. , Xu M. , Zhu B. (англ.) // Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences. — 2013. — Vol. 368, no. 1609 . — P. 20110332. — doi : . — . [ ]
  6. ↑ Fragola G. , Germain P. L. , Laise P. , Cuomo A. , Blasimme A. , Gross F. , Signaroldi E. , Bucci G. , Sommer C. , Pruneri G. , Mazzarol G. , Bonaldi T. , Mostoslavsky G. , Casola S. , Testa G. (англ.) // PLoS genetics. — 2013. — Vol. 9, no. 2 . — P. e1003292. — doi : . — . [ ]
  7. Aloia L. , Di Stefano B. , Di Croce L. (англ.) // Development (Cambridge, England). — 2013. — Vol. 140, no. 12 . — P. 2525—2534. — doi : . — . [ ]
  8. Entrevan M. , Schuettengruber B. , Cavalli G. (англ.) // Trends in cell biology. — 2016. — doi : . — . [ ]
  9. Kirmizis A. , Bartley S. M. , Kuzmichev A. , Margueron R. , Reinberg D. , Green R. , Farnham P. J. (англ.) // Genes & development. — 2004. — Vol. 18, no. 13 . — P. 1592—1605. — doi : . — . [ ]
  10. Portoso M and Cavalli G. // RNA and the Regulation of Gene Expression: A Hidden Layer of Complexity (англ.) . — (англ.) ( , 2008.
  11. Molitor A. , Shen W. H. (англ.) // Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao. — 2013. — Vol. 40, no. 5 . — P. 231—238. — doi : . — . [ ]
  12. ↑ Margueron R. , Reinberg D. (англ.) // Nature. — 2011. — Vol. 469, no. 7330 . — P. 343—349. — doi : . — . [ ]
  13. Grimm C. , Matos R. , Ly-Hartig N. , Steuerwald U. , Lindner D. , Rybin V. , Müller J. , Müller C. W. (англ.) // The EMBO journal. — 2009. — Vol. 28, no. 13 . — P. 1965—1977. — doi : . — . [ ]
  14. Lagarou A. , Mohd-Sarip A. , Moshkin Y. M. , Chalkley G. E. , Bezstarosti K. , Demmers J. A. , Verrijzer C. P. (англ.) // Genes & development. — 2008. — Vol. 22, no. 20 . — P. 2799—2810. — doi : . — . [ ]
  15. ↑ Tzatsos A. , Paskaleva P. , Lymperi S. , Contino G. , Stoykova S. , Chen Z. , Wong K. K. , Bardeesy N. (англ.) // The Journal of biological chemistry. — 2011. — Vol. 286, no. 38 . — P. 33061—33069. — doi : . — . [ ]
  16. Scheuermann J. C. , de Ayala Alonso A. G. , Oktaba K. , Ly-Hartig N. , McGinty R. K. , Fraterman S. , Wilm M. , Muir T. W. , Müller J. (англ.) // Nature. — 2010. — Vol. 465, no. 7295 . — P. 243—247. — doi : . — . [ ]
  17. Piunti A. , Shilatifard A. (англ.) // Nature Reviews. Molecular Cell Biology. — 2021. — May ( vol. 22 , no. 5 ). — P. 326—345 . — doi : . — . [ ]
  18. Gil J. , O'Loghlen A. (англ.) // Trends in cell biology. — 2014. — Vol. 24, no. 11 . — P. 632—641. — doi : . — . [ ]
  19. ↑ Morey L. , Aloia L. , Cozzuto L. , Benitah S. A. , Di Croce L. (англ.) // Cell reports. — 2013. — Vol. 3, no. 1 . — P. 60—69. — doi : . — . [ ]
  20. Turner S. A. , Bracken A. P. (англ.) // Cell stem cell. — 2013. — Vol. 12, no. 2 . — P. 145—146. — doi : . — . [ ]
  21. Camahort R. , Cowan C. A. (англ.) // Cell stem cell. — 2012. — Vol. 10, no. 1 . — P. 4—6. — doi : . — . [ ]
  22. Morey L. , Pascual G. , Cozzuto L. , Roma G. , Wutz A. , Benitah S. A. , Di Croce L. (англ.) // Cell stem cell. — 2012. — Vol. 10, no. 1 . — P. 47—62. — doi : . — . [ ]
  23. O'Loghlen A. , Muñoz-Cabello A. M. , Gaspar-Maia A. , Wu H. A. , Banito A. , Kunowska N. , Racek T. , Pemberton H. N. , Beolchi P. , Lavial F. , Masui O. , Vermeulen M. , Carroll T. , Graumann J. , Heard E. , Dillon N. , Azuara V. , Snijders A. P. , Peters G. , Bernstein E. , Gil J. (англ.) // Cell stem cell. — 2012. — Vol. 10, no. 1 . — P. 33—46. — doi : . — . [ ]
  24. Simhadri C. , Daze K. D. , Douglas S. F. , Quon T. T. , Dev A. , Gignac M. C. , Peng F. , Heller M. , Boulanger M. J. , Wulff J. E. , Hof F. (англ.) // Journal of medicinal chemistry. — 2014. — Vol. 57, no. 7 . — P. 2874—2883. — doi : . — . [ ]
  25. Hu C. K. , Wang W. , Brind'Amour J. , Singh P. P. , Reeves G. A. , Lorincz M. C. , Alvarado A. S. , Brunet A. (англ.) // Science (New York, N.Y.). — 2020. — 21 February ( vol. 367 , no. 6480 ). — P. 870—874 . — doi : . — . [ ]
  26. George Wendt, Shunsuke Nakamura, Atsushi Iwama. Crucial Role of the Polycomb Group Gene Product BMI-1 in the Maintenance of Self-Renewing Hematopoietic Stem Cells // Stem Cells and Cancer Stem Cells. — 2013. — Т. 9. — С. 143—153. — doi : .
  27. Molofsky A. V. , Pardal R. , Iwashita T. , Park I. K. , Clarke M. F. , Morrison S. J. (англ.) // Nature. — 2003. — Vol. 425, no. 6961 . — P. 962—967. — doi : . — . [ ]
  28. Wang Y. , Zang X. , Wang Y. , Chen P. (англ.) // Molecular vision. — 2012. — Vol. 18. — P. 803—815. — . [ ]
  29. Moon J. H. , Heo J. S. , Kim J. S. , Jun E. K. , Lee J. H. , Kim A. , Kim J. , Whang K. Y. , Kang Y. K. , Yeo S. , Lim H. J. , Han D. W. , Kim D. W. , Oh S. , Yoon B. S. , Schöler H. R. , You S. (англ.) // Cell research. — 2011. — Vol. 21, no. 9 . — P. 1305—1315. — doi : . — . [ ]
  30. Liu J. , Cao L. , Chen J. , Song S. , Lee I. H. , Quijano C. , Liu H. , Keyvanfar K. , Chen H. , Cao L. Y. , Ahn B. H. , Kumar N. G. , Rovira I. I. , Xu X. L. , van Lohuizen M. , Motoyama N. , Deng C. X. , Finkel T. (англ.) // Nature. — 2009. — Vol. 459, no. 7245 . — P. 387—392. — doi : . — . [ ]
  31. Dimri M. , Carroll J. D. , Cho J. H. , Dimri G. P. (англ.) // Cell cycle (Georgetown, Tex.). — 2013. — Vol. 12, no. 22 . — P. 3537—3546. — doi : . — . [ ]
  32. ↑ Zhou M. , Xu Q. , Huang D. , Luo L. (англ.) // Biomedical Reports. — 2021. — June ( vol. 14 , no. 6 ). — P. 52—52 . — doi : . — . [ ]
  33. Yang D. , Liu H. Q. , Yang Z. , Fan D. , Tang Q. Z. (англ.) // EBioMedicine. — 2021. — January ( vol. 63 ). — P. 103193—103193 . — doi : . — . [ ]
  34. Testa G. , Russo M. , Di Benedetto G. , Barbato M. , Parisi S. , Pirozzi F. , Tocchetti C. G. , Abete P. , Bonaduce D. , Russo T. , Passaro F. (англ.) // Scientific Reports. — 2020. — 28 April ( vol. 10 , no. 1 ). — P. 7129—7129 . — doi : . — . [ ]
  35. Riising E. M. , Comet I. , Leblanc B. , Wu X. , Johansen J. V. , Helin K. (англ.) // Molecular Cell. — 2014. — 7 August ( vol. 55 , no. 3 ). — P. 347—360 . — doi : . — . [ ]
  36. Sugishita H, Kondo T, Ito S, et al. (2021). . Nat Commun . 12 (5341). doi : .
  37. Ishida A. , Asano H. , Hasegawa M. , Koseki H. , Ono T. , Yoshida M. C. , Taniguchi M. , Kanno M. (англ.) // Gene. — 1993. — Vol. 129, no. 2 . — P. 249—255. — . [ ]
  38. Gao Z. , Zhang J. , Bonasio R. , Strino F. , Sawai A. , Parisi F. , Kluger Y. , Reinberg D. (англ.) // Molecular cell. — 2012. — Vol. 45, no. 3 . — P. 344—356. — doi : . — . [ ]
  39. Yang C. S. , Chang K. Y. , Dang J. , Rana T. M. (англ.) // Scientific reports. — 2016. — Vol. 6. — P. 26899. — doi : . — . [ ]
  40. Gao Z. , Zhang J. , Bonasio R. , Strino F. , Sawai A. , Parisi F. , Kluger Y. , Reinberg D. (англ.) // Molecular cell. — 2012. — Vol. 45, no. 3 . — P. 344—356. — doi : . — . [ ]
  41. Li H. , Lai P. , Jia J. , Song Y. , Xia Q. , Huang K. , He N. , Ping W. , Chen J. , Yang Z. , Li J. , Yao M. , Dong X. , Zhao J. , Hou C. , Esteban M. A. , Gao S. , Pei D. , Hutchins A. P. , Yao H. (англ.) // Cell Stem Cell. — 2017. — 6 April ( vol. 20 , no. 4 ). — P. 462—477 . — doi : . — . [ ]
  42. Hanson I. M. , Poustka A. , Trowsdale J. (англ.) // Genomics. — 1991. — Vol. 10, no. 2 . — P. 417—424. — . [ ]
  43. Aagaard L. , Laible G. , Selenko P. , Schmid M. , Dorn R. , Schotta G. , Kuhfittig S. , Wolf A. , Lebersorger A. , Singh P. B. , Reuter G. , Jenuwein T. (англ.) // The EMBO journal. — 1999. — Vol. 18, no. 7 . — P. 1923—1938. — doi : . — . [ ]
  44. Qin J. , Whyte W. A. , Anderssen E. , Apostolou E. , Chen H. H. , Akbarian S. , Bronson R. T. , Hochedlinger K. , Ramaswamy S. , Young R. A. , Hock H. (англ.) // Cell stem cell. — 2012. — Vol. 11, no. 3 . — P. 319—332. — doi : . — . [ ]
  45. Luis N. M. , Morey L. , Di Croce L. , Benitah S. A. (англ.) // Cell stem cell. — 2012. — Vol. 11, no. 1 . — P. 16—21. — doi : . — . [ ]
  46. Nakama M. , Kawakami K. , Kajitani T. , Urano T. , Murakami Y. (англ.) // Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms. — 2012. — Vol. 17, no. 3 . — P. 218—233. — doi : . — . [ ]
  47. Saxena A. , Carninci P. (англ.) // BioEssays : news and reviews in molecular, cellular and developmental biology. — 2011. — Vol. 33, no. 11 . — P. 830—839. — doi : . — . [ ]
  48. Kasinath V. , Faini M. , Poepsel S. , Reif D. , Feng X. A. , Stjepanovic G. , Aebersold R. , Nogales E. (англ.) // Science (New York, N.Y.). — 2018. — 23 February ( vol. 359 , no. 6378 ). — P. 940—944 . — doi : . — . [ ]
  49. Moritz L. E. , Trievel R. C. (англ.) // The Journal Of Biological Chemistry. — 2018. — 7 September ( vol. 293 , no. 36 ). — P. 13805—13814 . — doi : . — . [ ]
  50. Ciferri C. , Lander G. C. , Maiolica A. , Herzog F. , Aebersold R. , Nogales E. (англ.) // eLife. — 2012. — Vol. 1. — P. e00005. — doi : . — . [ ]
  51. ↑ Son J. , Shen S. S. , Margueron R. , Reinberg D. (англ.) // Genes & development. — 2013. — Vol. 27, no. 24 . — P. 2663—2677. — doi : . — . [ ]
  52. McCabe M. T. , Ott H. M. , Ganji G. , Korenchuk S. , Thompson C. , Van Aller G. S. , Liu Y. , Graves A. P. , Della Pietra A. 3rd , Diaz E. , LaFrance L. V. , Mellinger M. , Duquenne C. , Tian X. , Kruger R. G. , McHugh C. F. , Brandt M. , Miller W. H. , Dhanak D. , Verma S. K. , Tummino P. J. , Creasy C. L. (англ.) // Nature. — 2012. — Vol. 492, no. 7427 . — P. 108—112. — doi : . — . [ ]
  53. Cavalli G. (англ.) // Science (New York, N.Y.). — 2012. — Vol. 338, no. 6113 . — P. 1430—1431. — doi : . — . [ ]
  54. Melnick A. (англ.) // Cancer cell. — 2012. — Vol. 22, no. 5 . — P. 569—570. — doi : . — . [ ]
  55. Jacob Y. , Bergamin E. , Donoghue M. T. , Mongeon V. , LeBlanc C. , Voigt P. , Underwood C. J. , Brunzelle J. S. , Michaels S. D. , Reinberg D. , Couture J. F. , Martienssen R. A. (англ.) // Science (New York, N.Y.). — 2014. — Vol. 343, no. 6176 . — P. 1249—1253. — doi : . — . [ ]
  56. Cao Q. , Wang X. , Zhao M. , Yang R. , Malik R. , Qiao Y. , Poliakov A. , Yocum A. K. , Li Y. , Chen W. , Cao X. , Jiang X. , Dahiya A. , Harris C. , Feng F. Y. , Kalantry S. , Qin Z. S. , Dhanasekaran S. M. , Chinnaiyan A. M. (англ.) // Nature communications. — 2014. — Vol. 5. — P. 3127. — doi : . — . [ ]
  57. Kanhere A. , Viiri K. , Araújo C. C. , Rasaiyaah J. , Bouwman R. D. , Whyte W. A. , Pereira C. F. , Brookes E. , Walker K. , Bell G. W. , Pombo A. , Fisher A. G. , Young R. A. , Jenner R. G. (англ.) // Molecular cell. — 2010. — Vol. 38, no. 5 . — P. 675—688. — doi : . — . [ ]
  58. Sun A. , Li F. , Liu Z. , Jiang Y. , Zhang J. , Wu J. , Shi Y. (англ.) // Protein & Cell. — 2018. — August ( vol. 9 , no. 8 ). — P. 738—742 . — doi : . — . [ ]
  59. Kim H. , Bakshi A. , Kim J. (англ.) // PloS One. — 2015. — Vol. 10 , no. 4 . — P. e0126966—0126966 . — doi : . — . [ ]
  60. Wang X. , Paucek R. D. , Gooding A. R. , Brown Z. Z. , Ge E. J. , Muir T. W. , Cech T. R. (англ.) // Nature Structural & Molecular Biology. — 2017. — December ( vol. 24 , no. 12 ). — P. 1028—1038 . — doi : . — . [ ]
  61. ↑ Conway E. , Jerman E. , Healy E. , Ito S. , Holoch D. , Oliviero G. , Deevy O. , Glancy E. , Fitzpatrick D. J. , Mucha M. , Watson A. , Rice A. M. , Chammas P. , Huang C. , Pratt-Kelly I. , Koseki Y. , Nakayama M. , Ishikura T. , Streubel G. , Wynne K. , Hokamp K. , McLysaght A. , Ciferri C. , Di Croce L. , Cagney G. , Margueron R. , Koseki H. , Bracken A. P. (англ.) // Molecular Cell. — 2018. — 3 May ( vol. 70 , no. 3 ). — P. 408—421 . — doi : . — . [ ]
  62. Kaneko S. , Bonasio R. , Saldaña-Meyer R. , Yoshida T. , Son J. , Nishino K. , Umezawa A. , Reinberg D. (англ.) // Molecular cell. — 2014. — Vol. 53, no. 2 . — P. 290—300. — doi : . — . [ ]
  63. Sanulli S. , Justin N. , Teissandier A. , Ancelin K. , Portoso M. , Caron M. , Michaud A. , Lombard B. , da Rocha S. T. , Offer J. , Loew D. , Servant N. , Wassef M. , Burlina F. , Gamblin S. J. , Heard E. , Margueron R. (англ.) // Molecular cell. — 2015. — Vol. 57, no. 5 . — P. 769—783. — doi : . — . [ ]
  64. Zhang Z. , Jones A. , Sun C. W. , Li C. , Chang C. W. , Joo H. Y. , Dai Q. , Mysliwiec M. R. , Wu L. C. , Guo Y. , Yang W. , Liu K. , Pawlik K. M. , Erdjument-Bromage H. , Tempst P. , Lee Y. , Min J. , Townes T. M. , Wang H. (англ.) // Stem cells (Dayton, Ohio). — 2011. — Vol. 29, no. 2 . — P. 229—240. — doi : . — . [ ]
  65. Jones A. , Wang H. (англ.) // Protein & cell. — 2010. — Vol. 1, no. 12 . — P. 1056—1062. — doi : . — . [ ]
  66. Wienken Magdalena , Dickmanns Antje , Nemajerova Alice , Kramer Daniela , Najafova Zeynab , Weiss Miriam , Karpiuk Oleksandra , Kassem Moustapha , Zhang Yanping , Lozano Guillermina , Johnsen Steven A. , Moll Ute M. , Zhang Xin , Dobbelstein Matthias. // Molecular Cell. — 2016. — Январь ( т. 61 , № 1 ). — С. 68—83 . — ISSN . — doi : . [ ]
  67. Ebrahim M. , Mulay S. R. , Anders H. J. , Thomasova D. (англ.) // Histology and histopathology. — 2015. — Vol. 30, no. 11 . — P. 1271—1282. — doi : . — . [ ]
  68. Abdel-Wahab O. , Adli M. , LaFave L. M. , Gao J. , Hricik T. , Shih A. H. , Pandey S. , Patel J. P. , Chung Y. R. , Koche R. , Perna F. , Zhao X. , Taylor J. E. , Park C. Y. , Carroll M. , Melnick A. , Nimer S. D. , Jaffe J. D. , Aifantis I. , Bernstein B. E. , Levine R. L. (англ.) // Cancer Cell. — 2012. — 14 August ( vol. 22 , no. 2 ). — P. 180—193 . — doi : . — . [ ]
  69. Fujino T. , Goyama S. , Sugiura Y. , Inoue D. , Asada S. , Yamasaki S. , Matsumoto A. , Yamaguchi K. , Isobe Y. , Tsuchiya A. , Shikata S. , Sato N. , Morinaga H. , Fukuyama T. , Tanaka Y. , Fukushima T. , Takeda R. , Yamamoto K. , Honda H. , Nishimura E. K. , Furukawa Y. , Shibata T. , Abdel-Wahab O. , Suematsu M. , Kitamura T. (англ.) // Nature Communications. — 2021. — 23 March ( vol. 12 , no. 1 ). — P. 1826—1826 . — doi : . — . [ ]
  70. Quinodoz Sofia , Guttman Mitchell. // Trends in Cell Biology. — 2014. — Ноябрь ( т. 24 , № 11 ). — С. 651—663 . — ISSN . — doi : . [ ]
  71. Lee J. T. (англ.) // Science (New York, N.Y.). — 2012. — Vol. 338, no. 6113 . — P. 1435—1439. — doi : . — . [ ]
  72. Kornienko A. E. , Guenzl P. M. , Barlow D. P. , Pauler F. M. (англ.) // BMC biology. — 2013. — Vol. 11. — P. 59. — doi : . — . [ ]
  73. Long Y. , Hwang T. , Gooding A. R. , Goodrich K. J. , Rinn J. L. , Cech T. R. (англ.) // Nature Genetics. — 2020. — September ( vol. 52 , no. 9 ). — P. 931—938 . — doi : . — . [ ]
  74. Reis E. M. , Verjovski-Almeida S. (англ.) // Frontiers in genetics. — 2012. — Vol. 3. — P. 32. — doi : . — . [ ]
  75. Kanduri C. (англ.) // Seminars in cell & developmental biology. — 2011. — Vol. 22, no. 4 . — P. 343—350. — doi : . — . [ ]
  76. Wang X. Q. , Crutchley J. L. , Dostie J. (англ.) // Current genomics. — 2011. — Vol. 12, no. 5 . — P. 307—321. — doi : . — . [ ]
  77. Sado T. , Brockdorff N. (англ.) // Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences. — 2013. — Vol. 368, no. 1609 . — P. 20110325. — doi : . — . [ ]
  78. Engreitz J. M. , Pandya-Jones A. , McDonel P. , Shishkin A. , Sirokman K. , Surka C. , Kadri S. , Xing J. , Goren A. , Lander E. S. , Plath K. , Guttman M. (англ.) // Science (New York, N.Y.). — 2013. — Vol. 341, no. 6147 . — P. 1237973. — doi : . — . [ ]
  79. . Дата обращения: 22 февраля 2020. 22 февраля 2020 года.
  80. Кочанова Наталья (2013). 19 октября 2014 года.
  81. Shi Y. , Downes M. , Xie W. , Kao H. Y. , Ordentlich P. , Tsai C. C. , Hon M. , Evans R. M. (англ.) // Genes & development. — 2001. — Vol. 15, no. 9 . — P. 1140—1151. — doi : . — . [ ]
  82. McHugh C. A. , Chen C. K. , Chow A. , Surka C. F. , Tran C. , McDonel P. , Pandya-Jones A. , Blanco M. , Burghard C. , Moradian A. , Sweredoski M. J. , Shishkin A. A. , Su J. , Lander E. S. , Hess S. , Plath K. , Guttman M. (англ.) // Nature. — 2015. — Vol. 521, no. 7551 . — P. 232—236. — doi : . — . [ ]
  83. от 29 апреля 2015 на Wayback Machine . ScienceDaily, 27 April 2015
  84. Wutz A. (англ.) // Progress in molecular biology and translational science. — 2011. — Vol. 101. — P. 351—376. — doi : . — . [ ]
  85. Woo C. J. , Kingston R. E. (англ.) // Cell. — 2007. — Vol. 129, no. 7 . — P. 1257—1259. — doi : . — . [ ]
  86. Yap K. L. , Li S. , Muñoz-Cabello A. M. , Raguz S. , Zeng L. , Mujtaba S. , Gil J. , Walsh M. J. , Zhou M. M. (англ.) // Molecular cell. — 2010. — Vol. 38, no. 5 . — P. 662—674. — doi : . — . [ ]
  87. Chen, L., Qu, H., Guo, M., Zhang, Y., Cui, Y., Yang, Q., ... & Shi, D. (2020). от 14 июня 2021 на Wayback Machine . Journal of clinical pharmacy and therapeutics, 45(2), 240-248. PMID doi :
  88. Hung Ko-Hsuan , Wang Yang , Zhao Jing. // Biomolecules. — 2013. — 4 февраля ( т. 3 , № 4 ). — С. 124—142 . — ISSN . — doi : . [ ]
  89. Zhao J. , Ohsumi T. K. , Kung J. T. , Ogawa Y. , Grau D. J. , Sarma K. , Song J. J. , Kingston R. E. , Borowsky M. , Lee J. T. (англ.) // Molecular cell. — 2010. — Vol. 40, no. 6 . — P. 939—953. — doi : . — . [ ]
  90. Stadtfeld M. , Apostolou E. , Akutsu H. , Fukuda A. , Follett P. , Natesan S. , Kono T. , Shioda T. , Hochedlinger K. (англ.) // Nature. — 2010. — Vol. 465, no. 7295 . — P. 175—181. — doi : . — . [ ]
  91. Grote P. , Wittler L. , Hendrix D. , Koch F. , Währisch S. , Beisaw A. , Macura K. , Bläss G. , Kellis M. , Werber M. , Herrmann B. G. (англ.) // Developmental cell. — 2013. — Vol. 24, no. 2 . — P. 206—214. — doi : . — . [ ]
  92. Marín-Béjar O. , Marchese F. P. , Athie A. , Sánchez Y. , González J. , Segura V. , Huang L. , Moreno I. , Navarro A. , Monzó M. , García-Foncillas J. , Rinn J. L. , Guo S. , Huarte M. (англ.) // Genome biology. — 2013. — Vol. 14, no. 9 . — P. 104. — doi : . — . [ ]
  93. Zhuang M. , Gao W. , Xu J. , Wang P. , Shu Y. (англ.) // Biochemical and biophysical research communications. — 2014. — Vol. 448, no. 3 . — P. 315—322. — doi : . — . [ ]
  94. Luo M. , Li Z. , Wang W. , Zeng Y. , Liu Z. , Qiu J. (англ.) // Cancer letters. — 2013. — Vol. 333, no. 2 . — P. 213—221. — doi : . — . [ ]
  95. Kallen A. N. , Zhou X. B. , Xu J. , Qiao C. , Ma J. , Yan L. , Lu L. , Liu C. , Yi J. S. , Zhang H. , Min W. , Bennett A. M. , Gregory R. I. , Ding Y. , Huang Y. (англ.) // Molecular cell. — 2013. — Vol. 52, no. 1 . — P. 101—112. — doi : . — . [ ]
  96. Monnier P. , Martinet C. , Pontis J. , Stancheva I. , Ait-Si-Ali S. , Dandolo L. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. — 2013. — Vol. 110, no. 51 . — P. 20693—20698. — doi : . — . [ ]
  97. Dey B. K. , Pfeifer K. , Dutta A. (англ.) // Genes & development. — 2014. — Vol. 28, no. 5 . — P. 491—501. — doi : . — . [ ]
  98. Hu X. , Feng Y. , Zhang D. , Zhao S. D. , Hu Z. , Greshock J. , Zhang Y. , Yang L. , Zhong X. , Wang L. P. , Jean S. , Li C. , Huang Q. , Katsaros D. , Montone K. T. , Tanyi J. L. , Lu Y. , Boyd J. , Nathanson K. L. , Li H. , Mills G. B. , Zhang L. (англ.) // Cancer cell. — 2014. — Vol. 26, no. 3 . — P. 344—357. — doi : . — . [ ]
  99. Montes Marta , Nielsen Morten M. , Maglieri Giulia , Jacobsen Anders , Højfeldt Jonas , Agrawal-Singh Shuchi , Hansen Klaus , Helin Kristian , van de Werken Harmen J. G. , Pedersen Jakob S. , Lund Anders H. // Nature Communications. — 2015. — 24 апреля ( т. 6 , № 1 ). — ISSN . — doi : . [ ]
  100. Montero J. J. , López-Silanes I. , Megías D. , F Fraga M. , Blasco M. A. (англ.) // Nature Communications. — 2018. — 18 April ( vol. 9 , no. 1 ). — P. 1548—1548 . — doi : . — . [ ]
  101. Bettin N. , Oss Pegorar C. , Cusanelli E. (англ.) // Cells. — 2019. — 15 March ( vol. 8 , no. 3 ). — doi : . — . [ ]
  102. Marión R. M. , Montero J. J. , López de Silanes I. , Graña-Castro O. , Martínez P. , Schoeftner S. , Palacios-Fábrega J. A. , Blasco M. A. (англ.) // ELife. — 2019. — 20 August ( vol. 8 ). — doi : . — . [ ]
  103. Almeida M. , Bowness J. S. , Brockdorff N. (англ.) // Current Opinion In Genetics & Development. — 2020. — April ( vol. 61 ). — P. 53—61 . — doi : . — . [ ]
  104. Ren X. , Kerppola T. K. (англ.) // Molecular and cellular biology. — 2011. — Vol. 31, no. 10 . — P. 2100—2110. — doi : . — . [ ]
  105. Lu T. , Aron L. , Zullo J. , Pan Y. , Kim H. , Chen Y. , Yang T. H. , Kim H. M. , Drake D. , Liu X. S. , Bennett D. A. , Colaiácovo M. P. , Yankner B. A. (англ.) // Nature. — 2014. — Vol. 507, no. 7493 . — P. 448—454. — doi : . — . [ ]
  106. Yu M. , Mazor T. , Huang H. , Huang H. T. , Kathrein K. L. , Woo A. J. , Chouinard C. R. , Labadorf A. , Akie T. E. , Moran T. B. , Xie H. , Zacharek S. , Taniuchi I. , Roeder R. G. , Kim C. F. , Zon L. I. , Fraenkel E. , Cantor A. B. (англ.) // Molecular cell. — 2012. — Vol. 45, no. 3 . — P. 330—343. — doi : . — . [ ]
  107. Berk A. J. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. — 2012. — Vol. 109, no. 48 . — P. 19519—19520. — doi : . — . [ ]
  108. Rayess H. , Wang M. B. , Srivatsan E. S. (англ.) // International journal of cancer. — 2012. — Vol. 130, no. 8 . — P. 1715—1725. — doi : . — . [ ]
  109. Wei C. , Xiao R. , Chen L. , Cui H. , Zhou Y. , Xue Y. , Hu J. , Zhou B. , Tsutsui T. , Qiu J. , Li H. , Tang L. , Fu X. D. (англ.) // Molecular cell. — 2016. — Vol. 62, no. 6 . — P. 875—889. — doi : . — . [ ]
  110. Hu G. , Wade P. A. (англ.) // Cell stem cell. — 2012. — Vol. 10, no. 5 . — P. 497—503. — doi : . — . [ ]
  111. Reynolds N., Salmon-Divon M., Dvinge H., Hynes-Allen A., Balasooriya G., Leaford D., Behrens A., Bertone P., Hendrich B. (англ.) // The EMBO journal. — 2012. — Vol. 31, no. 3 . — P. 593—605. — doi : . — . [ ]
  112. Arnold P. , Schöler A. , Pachkov M. , Balwierz P. J. , Jørgensen H. , Stadler M. B. , van Nimwegen E. , Schübeler D. (англ.) // Genome research. — 2013. — Vol. 23, no. 1 . — P. 60—73. — doi : . — . [ ]
  113. Lanzuolo C. , Lo Sardo F. , Diamantini A. , Orlando V. (англ.) // PLoS genetics. — 2011. — Vol. 7, no. 11 . — P. e1002370. — doi : . — . [ ]
  114. Petruk S. , Sedkov Y. , Johnston D. M. , Hodgson J. W. , Black K. L. , Kovermann S. K. , Beck S. , Canaani E. , Brock H. W. , Mazo A. (англ.) // Cell. — 2012. — Vol. 150, no. 5 . — P. 922—933. — doi : . — . [ ]
  115. Abmayr S. M. , Workman J. L. (англ.) // Cell. — 2012. — Vol. 150, no. 5 . — P. 875—877. — doi : . — . [ ]
  116. Hosogane M. , Funayama R. , Shirota M. , Nakayama K. (англ.) // Cell reports. — 2016. — doi : . — . [ ]
  117. Luo M., Ling T., Xie W., Sun H., Zhou Y., Zhu Q., Shen M., Zong L., Lyu G., Zhao Y., Ye T., Gu J., Tao W., Lu Z., Grummt I. (англ.) // Stem cells (Dayton, Ohio). — 2013. — Vol. 31, no. 7 . — P. 1278—1286. — doi : . — . [ ]
  118. Rais Y., Zviran A., Geula S., Gafni O., Chomsky E., Viukov S., Mansour A. A., Caspi I., Krupalnik V., Zerbib M., Maza I., Mor N., Baran D., Weinberger L., Jaitin D. A., Lara-Astiaso D., Blecher-Gonen R., Shipony Z., Mukamel Z., Hagai T., Gilad S., Amann-Zalcenstein D., Tanay A., Amit I., Novershtern N., Hanna J. H. (англ.) // Nature. — 2013. — Vol. 502, no. 7469 . — P. 65—70. — doi : . — . [ ]
  119. Liu, N., Konuma, T., Sharma, R., Wang, D., Zhao, N., Cao, L., ... & Zhou, M. M. (2023). Histone H3 lysine 27 crotonylation mediates gene transcriptional repression in chromatin. Molecular Cell. 83(13), P2206-2221.E11, PMID doi :
  120. Voigt P. , Tee W. W. , Reinberg D. (англ.) // Genes & development. — 2013. — Vol. 27, no. 12 . — P. 1318—1338. — doi : . — . [ ]
  121. De Gobbi M. , Garrick D. , Lynch M. , Vernimmen D. , Hughes J. R. , Goardon N. , Luc S. , Lower K. M. , Sloane-Stanley J. A. , Pina C. , Soneji S. , Renella R. , Enver T. , Taylor S. , Jacobsen S. E. , Vyas P. , Gibbons R. J. , Higgs D. R. (англ.) // Epigenetics & chromatin. — 2011. — Vol. 4, no. 1 . — P. 9. — doi : . — . [ ]
  122. Lu C. , Ward A. , Bettridge J. , Liu Y. , Desiderio S. (англ.) // Cell reports. — 2015. — Vol. 10, no. 1 . — P. 29—38. — doi : . — . [ ]
  123. Hu D. , Garruss A. S. , Gao X. , Morgan M. A. , Cook M. , Smith E. R. , Shilatifard A. (англ.) // Nature structural & molecular biology. — 2013. — Vol. 20, no. 9 . — P. 1093—1097. — doi : . — . [ ]
  124. Alder O. , Lavial F. , Helness A. , Brookes E. , Pinho S. , Chandrashekran A. , Arnaud P. , Pombo A. , O'Neill L. , Azuara V. (англ.) // Development (Cambridge, England). — 2010. — Vol. 137, no. 15 . — P. 2483—2492. — doi : . — . [ ]
  125. Mozzetta C. , Pontis J. , Fritsch L. , Robin P. , Portoso M. , Proux C. , Margueron R. , Ait-Si-Ali S. (англ.) // Molecular cell. — 2014. — Vol. 53, no. 2 . — P. 277—289. — doi : . — . [ ]
  126. Soufi A. , Donahue G. , Zaret K. S. (англ.) // Cell. — 2012. — Vol. 151, no. 5 . — P. 994—1004. — doi : . — . [ ]
  127. Lienert F. , Mohn F. , Tiwari V. K. , Baubec T. , Roloff T. C. , Gaidatzis D. , Stadler M. B. , Schübeler D. (англ.) // PLoS genetics. — 2011. — Vol. 7, no. 6 . — P. e1002090. — doi : . — . [ ]
  128. Aldiri I. , Vetter M. L. (англ.) // Developmental biology. — 2012. — Vol. 367, no. 2 . — P. 91—99. — doi : . — . [ ]
  129. Mallen-St Clair J. , Soydaner-Azeloglu R. , Lee K. E. , Taylor L. , Livanos A. , Pylayeva-Gupta Y. , Miller G. , Margueron R. , Reinberg D. , Bar-Sagi D. (англ.) // Genes & development. — 2012. — Vol. 26, no. 5 . — P. 439—444. — doi : . — . [ ]
  130. Richly H , Aloia L , Di Croce L. // Cell Death & Disease. — 2011. — Сентябрь ( т. 2 , № 9 ). — С. e204—e204 . — ISSN . — doi : . [ ]
  131. Zheng Y. , He L. , Wan Y. , Song J. (англ.) // Stem cells and development. — 2013. — Vol. 22, no. 2 . — P. 256—267. — doi : . — . [ ]
  132. Ding X. , Wang X. , Sontag S. , Qin J. , Wanek P. , Lin Q. , Zenke M. (англ.) // Stem cells and development. — 2014. — Vol. 23, no. 9 . — P. 931—940. — doi : . — . [ ]
  133. Culerrier R. , Carraz M. , Mann C. , Djabali M. (англ.) // Molecular biology of the cell. — 2016. — Vol. 27, no. 17 . — P. 2726—2734. — doi : . — . [ ]
  134. Chen Z. , Yin Q. , Inoue A. , Zhang C. , Zhang Y. (англ.) // Science Advances. — 2019. — December ( vol. 5 , no. 12 ). — P. e7246—7246 . — doi : . — . [ ]
  135. ↑ Chen Z. , Zhang Y. (англ.) // Nature Reviews. Genetics. — 2020. — September ( vol. 21 , no. 9 ). — P. 555—571 . — doi : . — . [ ]
  136. Matoba S. , Wang H. , Jiang L. , Lu F. , Iwabuchi K. A. , Wu X. , Inoue K. , Yang L. , Press W. , Lee J. T. , Ogura A. , Shen L. , Zhang Y. (англ.) // Cell Stem Cell. — 2018. — 6 September ( vol. 23 , no. 3 ). — P. 343—354 . — doi : . — . [ ]
  137. . Дата обращения: 20 июня 2020. 20 июня 2020 года.
  138. Das P. , Taube J. H. (англ.) // Cancers. — 2020. — 29 September ( vol. 12 , no. 10 ). — doi : . — . [ ]
  139. Lu A.T. , Fei Z. , Haghani A. , Robeck T.R. , Zoller J.A. , Li C.Z. , Lowe R. , Yan Q. , Zhang J. , Vu H. , Ablaeva J. , Acosta-Rodriguez V.A. , Adams D.M. , Almunia J. , Aloysius A. , Ardehali R. , Arneson A. , Baker C.S. , Banks G. , Belov K. , Bennett N.C. , Black P. , Blumstein D.T. , Bors E.K. , Breeze C.E. , Brooke R.T. , Brown J.L. , Carter G. , Caulton A. , Cavin J.M. , Chakrabarti L. , Chatzistamou I. , Chen H. , Cheng K. , Chiavellini P. , Choi O.W. , Clarke S. , Cooper L.N. , Cossette M.L. , Day J. , DeYoung J. , DiRocco S. , Dold C. , Ehmke E.E. , Emmons C.K. , Emmrich S. , Erbay E. , Erlacher-Reid C. , Faulkes C.G. , Ferguson S.H. , Finno C.J. , Flower J.E. , Gaillard J.M. , Garde E. , Gerber L. , Gladyshev V.N. , Gorbunova V. , Goya R.G. , Grant M.J. , Green C.B. , Hales E.N. , Hanson M.B. , Hart D.W. , Haulena M. , Herrick K. , Hogan A.N. , Hogg C.J. , Hore T.A. , Huang T. , Izpisua Belmonte J.C. , Jasinska A.J. , Jones G. , Jourdain E. , Kashpur O. , Katcher H. , Katsumata E. , Kaza V. , Kiaris H. , Kobor M.S. , Kordowitzki P. , Koski W.R. , Kruetzen M. , Kwon S.B. , Larison B. , Lee S.G. , Lehmann M. , Lemaitre J.F. , Levine A.J. , Li C. , Li X. , Lim A.R. , Lin D.T.S. , Lindemann D.M. , Little T.J. , Macoretta N. , Maddox D. , Matkin C.O. , Mattison J.A. , McClure M. , Mergl J. , Meudt J.J. , Montano G.A. , Mozhui K. , Munshi-South J. , Naderi A. , Nagy M. , Narayan P. , Nathanielsz P.W. , Nguyen N.B. , Niehrs C. , O’Brien J.K. , O’Tierney Ginn P. , Odom D.T. , Ophir A.G. , Osborn S. , Ostrander E.A. , Parsons K.M. , Paul K.C. , Pellegrini M. , Peters K.J. , Pedersen A.B. , Petersen J.L. , Pietersen D.W. , Pinho G.M. , Plassais J. , Poganik J.R. , Prado N.A. , Reddy P. , Rey B. , Ritz B.R. , Robbins J. , Rodriguez M. , Russell J. , Rydkina E. , Sailer L.L. , Salmon A.B. , Sanghavi A. , Schachtschneider K.M. , Schmitt D. , Schmitt T. , Schomacher L. , Schook L.B. , Sears K.E. , Seifert A.W. , Seluanov A. , Shafer A.B.A. , Shanmuganayagam D. , Shindyapina A.V. , Simmons M. , Singh K. , Sinha I. , Slone J. , Snell R.G. , Soltanmaohammadi E. , Spangler M.L. , Spriggs M.C. , Staggs L. , Stedman N. , Steinman K.J. , Stewart D.T. , Sugrue V.J. , Szladovits B. , Takahashi J.S. , Takasugi M. , Teeling E.C. , Thompson M.J. , Van Bonn B. , Vernes S.C. , Villar D. , Vinters H.V. , Wallingford M.C. , Wang N. , Wayne R.K. , Wilkinson G.S. , Williams C.K. , Williams R.W. , Yang X.W. , Yao M. , Young B.G. , Zhang B. , Zhang Z. , Zhao P. , Zhao Y. , Zhou W. , Zimmermann J. , Ernst J. , Raj K. , Horvath S. (англ.) . — 2021. — 19 January. — doi : . [ ]
  140. de Lima Camillo, L. P., Asif, M. H., Horvath, S., Larschan, E., & Singh, R. (2023). Histone mark age of human tissues and cells. bioRxiv, 2023-08. doi :

Литература

  • Guido van Mierlo, Gert Jan C. Veenstra, Michiel Vermeulen, Hendrik Marks (2019). The Complexity of PRC2 Subcomplexes. Trends in Cell Biology, DOI:
  • Laugesen A., Højfeldt J. W., Helin K. (2019). . Molecular Cell, 74(1), 8-18, DOI:
  • Vidal, M. (2014). Polycomb Complexes: Chromatin Regulators Required for Cell Diversity and Tissue Homeostasis. In Transcriptional and Epigenetic Mechanisms Regulating Normal and Aberrant Blood Cell Development (pp. 95–139). Springer Berlin Heidelberg. doi : Online ISBN 978-3-642-45198-0
  • Marianne Entrevan, Bernd Schuettengruber, Giacomo Cavalli (2016). . Trends in Cell Biology, 26(7), 511–525 doi :
  • Comet, I., & Helin, K. (2014). . Nature structural & molecular biology, 21(7), 573-575. doi :
  • Schwartz, Y. B., & Pirrotta, V. (2014). . Cell reports, 8(2), 321-325. doi :
  • Nathan R. Rose, Robert J. Klose, (2014). . Biochimica et Biophysica Acta (BBA) — Gene Regulatory Mechanisms doi :
  • Gozani, O., & Shi, Y. (2014). Histone Methylation in Chromatin Signaling. In: Fundamentals of Chromatin (pp. 213–256). Springer New York. doi :
  • Jeffrey A. Simon, Robert E. Kingston (2013) Occupying Chromatin: Polycomb Mechanisms for Getting to Genomic Targets, Stopping Transcriptional Traffic, and Staying Put. Molecular Cell, 49(5), 808—824
  • Bernd Schuettengruber, Henri-Marc Bourbon, Luciano Di Croce, Giacomo Cavalli (2017). . Cell, 171(1), 34–57, DOI:
  • Di Croce, L., & Helin, K. (2013) . Nature structural & molecular biology, 20(10), 1147—1155. doi:10.1038/nsmb.2669
  • Olsen, J. B., Greenblatt, J., & Emili, A. (2014). Histone Methyltransferase Complexes in Transcription, Development, and Cancer. In Systems Analysis of Chromatin-Related Protein Complexes in Cancer (pp. 33–47). Springer New York. doi :
  • Shahram Golbabapour, Nazia Abdul Majid, Pouya Hassandarvish, Maryam Hajrezaie, Mahmood Ameen Abdulla, and A. Hamid A. Hadi. (June 2013). . OMICS: A Journal of Integrative Biology, 17(6): 283—296. doi :
  • Anne Laugesen , Kristian Helin (June 2014). Chromatin Repressive Complexes in Stem Cells, Development, and Cancer. Cell Stem Cell, 14(6), 735—751 doi :
  • Jesús Gi, Ana O’Loghlenemai (2014). doi :
  • John W Whitaker, Zhao Chen & Wei Wang(2014). . Nature Methods doi :
  • Beatrice Bodega, Chiara Lanzuolo (2016). Подробные, легко воспроизводимые лабораторные протоколы, а также советы как избежать известных ошибок.
  • Filippo Ciabrelli, Federico Comoglio, Simon Fellous, Boyan Bonev, Maria Ninova, Quentin Szabo, Anne Xuéreb, Christophe Klopp, Alexei Aravin, Renato Paro, Frédéric Bantignies, Giacomo Cavalli (2017). . Nature Genetics,; doi :
  • Takahiro Ito, Yee Voan Teo, Shane A. Evans, Nicola Neretti, John M. Sedivy (2018). Cell Reports, 22(13), 3480–3492 doi :
  • Skourti-Stathaki, K., Triglia, E. T., Warburton, M., Voigt, P., Bird, A., & Pombo, A. (2019). . Molecular cell. 73(5), 930-945.E4
  • Ren, X., Hu, B., Song, M., Ding, Z., Dang, Y., Liu, Z., ... & Chan, P. (2019). Maintenance of Nucleolar Homeostasis by CBX4 Alleviates Senescence and Osteoarthritis. Cell reports, 26(13), 3643-3656. doi :
  • Zhou, C., Wang, Y., Zhang, J., Su, J., An, Q., Liu, X., ... & Zhang, Y. (2019). H3K27me3 is an epigenetic barrier while KDM6A overexpression improves nuclear reprogramming efficiency. The FASEB Journal, 33(3), 4638-4652. PMID doi :
  • Lee, S., Lee, C., Hwang, C. Y., Kim, D., Han, Y., Hong, S. N., ... & Cho, K. H. (2020). Network inference analysis identifies SETDB1 as a key regulator for reverting colorectal cancer cells into differentiated normal-like cells. Molecular Cancer Research, 18(1), 118-129. PMID doi :
  • Fukuda, K., & Shinkai, Y. (2020). SETDB1-Mediated silencing of retroelements. Viruses, 12(6), 596. PMID PMC doi :
  • Strepkos, D., Markouli, M., Klonou, A., Papavassiliou, A. G., & Piperi, C. (2021). Histone methyltransferase SETDB1: A common denominator of tumorigenesis with therapeutic potential. Cancer Research, 81(3), 525-534. PMID doi :
  • Kalashnikova, D. A., Maksimov, D. A., Romanov, S. E., Laktionov, P. P., & Koryakov, D. E. (2021). SetDB1 and Su (var) 3-9 play non-overlapping roles in somatic cell chromosomes of Drosophila melanogaster. Journal of cell science, 134(2), jcs253096. PMID doi :

Белок эухроматина гистон H3 лизин 9-специфическая метилтрансфераза связывается с хроматином вне доменов, обладающих модификацией H3K27me3, отсутствует на компартментах повторяющихся ДНК и способствует стабильности генома подавляя активность ретроэлементов . SetDB1 присутствует на сайтах начала транскрипции и на 5'-нетранслируемых областях многих экспрессируемых генов. Истощение SETDB1 эффективно превращает стволовые клетки колоректального рака в постмитотические клетки и восстанавливает нормальную морфологию органоидов колоректального рака, полученных от пациентов.

  • Collier, A. J., Bendall, A., Fabian, C., et al., & Rugg-Gunn, P. J. (2022). Genome-wide screening identifies Polycomb repressive complex 1.3 as an essential regulator of human naïve pluripotent cell reprogramming. Science Advances, 8(12), eabk0013. PMID doi :
  • Zhu, Y., Dong, L., Wang, C., Hao, K., Wang, J., Zhao, L., ... & Qin, J. (2022). Functional redundancy among Polycomb complexes in maintaining the pluripotent state of embryonic stem cells. Stem Cell Reports.

См. также

Источник —

aoibhe
  • 2020-08-19
  • 1
  • Tags:

Same as Белки группы polycomb

The title for the last searches