Interested Article - DDX5

Предполагаемая АТФ-зависимая РНК-геликаза DDX5 , известная также как белок бокса DEAD 5 или РНК геликаза p68 фермент , кодируемый у человека геном DDX5 .

Функция

Белки , характеризующиеся консервативным мотивом Asp-Glu-Ala-Asp (DEAD), и предположительно являются РНК геликазами . Они участвуют во многих клеточных процессах, таких как изменения вторичной структуры РНК, инициация трансляции, ядерный и митохондриальный сплайсинг , сборки рибосом и сплайсосом . Основываясь на характере их распространения, некоторые члены этого семейства, как полагается, участвует в эмбриогенезе , сперматогенезе а также клеточном росте и делении. Этот ген кодирует белок DEAD бокса, являющийся РНК-зависимой АТФазой , а также связанным с пролиферацией ядерным антигеном, специфически реагирующим на опухолевый антиген обезьяньего вируса 40. Этот ген состоит из 13 экзонов , есть несколько вариантов сплайсинга , содержащие последовательности интронов , но изоформы, кодируемые этими транскриптами, обнаружены не были .

Взаимодействия

DDX5, как было выявлено, взаимодействует с:

Примечания

  1. .
  2. Akileswaran L., Taraska J.W., Sayer J.A., Gettemy J.M., Coghlan V.M. A-kinase-anchoring protein AKAP95 is targeted to the nuclear matrix and associates with p68 RNA helicase (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2001. — May ( vol. 276 , no. 20 ). — P. 17448—17454 . — doi : . — .
  3. Ogilvie V.C., Wilson B.J., Nicol S.M., Morrice N.A., Saunders L.R., Barber G.N., Fuller-Pace F.V. The highly related DEAD box RNA helicases p68 and p72 exist as heterodimers in cells (англ.) // (англ.) : journal. — 2003. — March ( vol. 31 , no. 5 ). — P. 1470—1480 . — doi : . — . — PMC .
  4. Wilson B.J., Giguère V. Identification of novel pathway partners of p68 and p72 RNA helicases through Oncomine meta-analysis (англ.) // (англ.) : journal. — 2007. — Vol. 8 . — P. 419 . — doi : . — .
  5. Endoh H., Maruyama K., Masuhiro Y., Kobayashi Y., Goto M., Tai H., Yanagisawa J., Metzger D., Hashimoto S., Kato S. Purification and Identification of p68 RNA Helicase Acting as a Transcriptional Coactivator Specific for the Activation Function 1 of Human Estrogen Receptor α (англ.) // (англ.) : journal. — 1999. — August ( vol. 19 , no. 8 ). — P. 5363—5372 . — . — PMC .
  6. Rossow K.L., Janknecht R. Synergism between p68 RNA helicase and the transcriptional coactivators CBP and p300 (англ.) // (англ.) : journal. — 2003. — January ( vol. 22 , no. 1 ). — P. 151—156 . — doi : . — .
  7. Nicol S.M., Causevic M., Prescott A.R., Fuller-Pace F.V. The nuclear DEAD box RNA helicase p68 interacts with the nucleolar protein fibrillarin and colocalizes specifically in nascent nucleoli during telophase (англ.) // (англ.) : journal. — 2000. — June ( vol. 257 , no. 2 ). — P. 272—280 . — doi : . — .
  8. Wilson B.J., Bates G.J., Nicol S.M., Gregory D.J., Perkins N.D., Fuller-Pace F.V. The p68 and p72 DEAD box RNA helicases interact with HDAC1 and repress transcription in a promoter-specific manner (англ.) // BMC Mol. Biol. : journal. — 2004. — August ( vol. 5 ). — P. 11 . — doi : . — . — PMC .
  9. Watanabe M., Yanagisawa J., Kitagawa H., Takeyama K., Ogawa S., Arao Y., Suzawa M., Kobayashi Y., Yano T., Yoshikawa H., Masuhiro Y., Kato S. A subfamily of RNA-binding DEAD-box proteins acts as an estrogen receptor α coactivator through the N-terminal activation domain (AF-1) with an RNA coactivator, SRA (англ.) // (англ.) : journal. — 2001. — March ( vol. 20 , no. 6 ). — P. 1341—1352 . — doi : . — . — PMC .
  10. Bates G.J., Nicol S.M., Wilson B.J., Jacobs A.M., Bourdon J.C., Wardrop J., Gregory D.J., Lane D.P., Perkins N.D., Fuller-Pace F.V. The DEAD box protein p68: a novel transcriptional coactivator of the p53 tumour suppressor (англ.) // (англ.) : journal. — 2005. — February ( vol. 24 , no. 3 ). — P. 543—553 . — doi : . — . — PMC .
  11. Yao H., Brick K., Evrard Y., Xiao T., Camerini-Otero R.D., Felsenfeld G. Mediation of CTCF transcriptional insulation by DEAD-box RNA-binding protein p68 and steroid receptor RNA activator SRA (англ.) // Genes Dev : journal. — 2010. — Vol. 24 , no. 22 . — P. 2543—2555 . — doi : . — . — PMC .

Литература

  • Iggo R.D., Jamieson D.J., MacNeill S.A., et al. p68 RNA helicase: identification of a nucleolar form and cloning of related genes containing a conserved intron in yeasts (англ.) // (англ.) : journal. — 1991. — Vol. 11 , no. 3 . — P. 1326—1333 . — . — PMC .
  • Hloch P., Schiedner G., Stahl H. Complete cDNA sequence of the human p68 protein (англ.) // (англ.) : journal. — 1990. — Vol. 18 , no. 10 . — P. 3045 . — doi : . — . — PMC .
  • Ford M.J., Anton I.A., Lane D.P. Nuclear protein with sequence homology to translation initiation factor eIF-4A (англ.) // Nature : journal. — 1988. — Vol. 332 , no. 6166 . — P. 736—738 . — doi : . — .
  • Iggo R., Gough A., Xu W., et al. Chromosome mapping of the human gene encoding the 68-kDa nuclear antigen (p68) by using the polymerase chain reaction (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1989. — Vol. 86 , no. 16 . — P. 6211—6214 . — doi : . — . — PMC .
  • Buelt M.K., Glidden B.J., Storm D.R. Regulation of p68 RNA helicase by calmodulin and protein kinase C (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1994. — Vol. 269 , no. 47 . — P. 29367—29370 . — .
  • Brody L.C., Abel K.J., Castilla L.H., et al. Construction of a transcription map surrounding the BRCA1 locus of human chromosome 17 (англ.) // Genomics : journal. — Academic Press , 1995. — Vol. 25 , no. 1 . — P. 238—247 . — doi : . — .
  • Endoh H., Maruyama K., Masuhiro Y., et al. Purification and Identification of p68 RNA Helicase Acting as a Transcriptional Coactivator Specific for the Activation Function 1 of Human Estrogen Receptor α (англ.) // (англ.) : journal. — 1999. — Vol. 19 , no. 8 . — P. 5363—5372 . — . — PMC .
  • Rössler O.G., Hloch P., Schütz N., et al. Structure and expression of the human p68 RNA helicase gene (англ.) // (англ.) : journal. — 2000. — Vol. 28 , no. 4 . — P. 932—939 . — doi : . — . — PMC .
  • Nicol S.M., Causevic M., Prescott A.R., Fuller-Pace F.V. The nuclear DEAD box RNA helicase p68 interacts with the nucleolar protein fibrillarin and colocalizes specifically in nascent nucleoli during telophase (англ.) // (англ.) : journal. — 2000. — Vol. 257 , no. 2 . — P. 272—280 . — doi : . — .
  • Watanabe M., Yanagisawa J., Kitagawa H., et al. A subfamily of RNA-binding DEAD-box proteins acts as an estrogen receptor α coactivator through the N-terminal activation domain (AF-1) with an RNA coactivator, SRA (англ.) // (англ.) : journal. — 2001. — Vol. 20 , no. 6 . — P. 1341—1352 . — doi : . — . — PMC .
  • Akileswaran L., Taraska J.W., Sayer J.A., et al. A-kinase-anchoring protein AKAP95 is targeted to the nuclear matrix and associates with p68 RNA helicase (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2001. — Vol. 276 , no. 20 . — P. 17448—17454 . — doi : . — .
  • Andersen J.S., Lyon C.E., Fox A.H., et al. Directed proteomic analysis of the human nucleolus (англ.) // Curr. Biol. : journal. — 2002. — Vol. 12 , no. 1 . — P. 1—11 . — doi : . — .
  • Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.R., et al. Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis (англ.) // RNA : journal. — 2002. — Vol. 8 , no. 4 . — P. 426—439 . — doi : . — . — PMC .
  • Liu Z.R. p68 RNA Helicase Is an Essential Human Splicing Factor That Acts at the U1 snRNA-5′ Splice Site Duplex (англ.) // (англ.) : journal. — 2002. — Vol. 22 , no. 15 . — P. 5443—5450 . — doi : . — . — PMC .
  • Strausberg R.L., Feingold E.A., Grouse L.H., et al. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99 , no. 26 . — P. 16899—16903 . — doi : . — . — PMC .
  • Rossow K.L., Janknecht R. Synergism between p68 RNA helicase and the transcriptional coactivators CBP and p300 (англ.) // (англ.) : journal. — 2003. — Vol. 22 , no. 1 . — P. 151—156 . — doi : . — .
  • Guil S., Gattoni R., Carrascal M., et al. Roles of hnRNP A1, SR Proteins, and p68 Helicase in c-H-ras Alternative Splicing Regulation (англ.) // (англ.) : journal. — 2003. — Vol. 23 , no. 8 . — P. 2927—2941 . — doi : . — . — PMC .
  • Fujita T., Kobayashi Y., Wada O., et al. Full activation of estrogen receptor alpha activation function-1 induces proliferation of breast cancer cells (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2003. — Vol. 278 , no. 29 . — P. 26704—26714 . — doi : . — .
  • Ota T., Suzuki Y., Nishikawa T., et al. Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs (англ.) // Nat. Genet. : journal. — 2004. — Vol. 36 , no. 1 . — P. 40—5 . — doi : . — .
Источник —

Same as DDX5