Бета-вариант коронавируса SARS-CoV-2 , также известный как линия 501.V2, 20C/501Y.V2 или B.1.351 (в прессе также встречаются названия «африканский штамм» или «южноафриканский штамм» ) — вариант вируса SARS-CoV-2 , вызывающего COVID-19 . Впервые обнаружен в округе Бухта Нельсона Манделы Восточно-Капской провинции ЮАР , о чём сообщило министерство здравоохранения ЮАР 18 декабря 2020 года .

Характеристика

Cодержит несколько мутаций, которые позволяют ему легче прикрепляться к клеткам человека из-за трех мутаций в рецептор-связывающем домене (RBD) в спайковом гликопротеине вируса: N501Y (аминокислота аспарагин (N) заменена на аминокислоту тирозин (Y) в позиции 501), K417N и E484K. Две из этих мутаций (E484K и N501Y) находятся в рецептор-связывающем мотиве (RBM) рецептор-связывающего домена (RBD).

Мутация N501Y также была обнаружена в штамме 202012/01 , широко распространившимся в Великобритании. Две другие мутации, обнаруженные в 501.V2 — E484K и K417N, в британском штамме отсутствуют. Кроме того, 501.V2 не имеет мутации 69-70del, обнаруженной в другом штамме.

Обнаружение

Новый штамм был обнаружен путем секвенирования полного генома. Несколько геномных последовательностей из этой линии были отправлены в базу данных генетических последовательностей GISAID, например, последовательность EPI_ISL_678597.

Международное распространение

23 декабря Мэтт Хэнкок объявил, что два человека, которые приехали из Южной Африки в Великобританию, были инфицированы 501.V2. 28 декабря этот штамм был обнаружен у двух человек в Швейцарии и у одного человека в Финляндии. 29 декабря штамм был обнаружен у путешественника, приехавшего из Южной Африки в Японию, и у одного международного путешественника в Квинсленде, Австралия. 30 декабря штамм был обнаружен в Замбии. 31 декабря он был также обнаружен во Франции у пассажира, возвращавшегося из Южной Африки. 2 января 2021 года первый случай заражения этим штаммом был выявлен в Южной Корее. Австрия сообщила о своем первом случае заражения этим штаммом, а также о четырёх случаях заражения британским штаммом 4 января. 8 января 2021 года Ирландия сообщила об обнаружении 3 случаев заболевания этим штаммом, все из которых были связаны с поездками из Южной Африки.

В России данный штамм впервые был выявлен в марте 2021 года .

Нечувствительность к вакцинам

4 января 2021 года газета The Telegraph сообщила, что оксфордский иммунолог сэр Джон Белл считает, что новый южноафриканский штамм вызывает «большой вопрос», поскольку он может быть устойчивым к вакцинам, тем самым разрушая надежды и заменяя их страхом . В тот же день профессор вакцинологии Шабир Мадхи заявил CBS News, что нет уверенности в том, что новый штамм 501.V2 сможет «обойти» защиту вакциной, но он полагает, что она «может быть менее эффективна» . Дополнительные мутации в белке-шипе в штамме 501.V2 были названы доцентом кафедры клеточной микробиологии Университета Рединга Саймоном Кларком как вызывающий беспокойство фактор, поскольку они «могут сделать вирус менее восприимчивым к иммунному ответу, вызванному вакциной». Лоуренс Янг, вирусолог из Уорикского университета, также отметил, что множественные спайковые мутации этого штамма «могут привести к некоторому уходу от иммунной защиты» .

Некоторые исследования показывают ускользание этого штамма от нейтрализующего многоклонального антитела, нацеленного на спайк-белок SARS-CoV-2 .

Угур Сахин, исполнительный директор BioNTech , заявил, что необходимы дальнейшие исследования, чтобы убедиться, что нынешняя вакцина производства этой компании работает против штамма 501.V2, однако, если вакцину будет необходимо скорректировать, компания может сделать это примерно за 6 недель .

8 января Guardian сообщила, что вакцина Pfizer и BioNTech от COVID-19 показала в тестах, включающих 20 анализов крови, что она способна обеспечивать защиту от штамма 501.V2. Необходимы дальнейшие исследования, чтобы установить точную степень защиты .

Компания Модерна планирует протестировать новую версию своей вакцины , специально модифицированную для защиты от штамма 501.V2 , аналогичные меры предпринимает компания Novavax . По данным клинического исследования вакцины Ad26.COV2.S компании Johnson & Johnson, её эффективность на юге Африки на 15 % ниже, чем в США (57 % и 72 % соответственно); разница, вероятно, связана с распространенностью штамма 501.V2 в ЮАР . Ещё одно исследование вакцины ( NVX-CoV2373 производства Novavax) показало эффективность в 60 % (для ВИЧ-негативных участников) в Южной Африке по сравнению с эффективностью 90 % в Великобритании. По данным Reuters, вакцина Pfizer лишь немного менее эффективна против 501.V2 . Компания AstraZeneca планирует адаптировать свою вакцину к данному штамму, новая вакцина должна быть готова к осени 2021 .

24 февраля 2021 года компания Модерна объявила о начале клинических исследований новой версии своей вакцины. Новая версия разработана специально для борьбы с 501.V2 .

Мутация E484K

Сообщается, что изменение аминокислоты E484K, мутация рецептор-связывающего домена (RBD), «связана с ускользанием от нейтрализующих антител», что может отрицательно повлиять на эффективность вакцин против COVID, нацеленных на спайк-белок . Спайковая мутация E484K была связана со случаем повторного заражения штаммом 501.V2 SARS-CoV-2 в Бразилии, что, по мнению исследователей, было первым подобным случаем повторного заражения штаммом, содержащим данную мутацию .

Статистика

См. также

• Штаммы SARS-CoV-2

Примечания

Ссылки