Interested Article - CHD3

CHD3 (от англ. C hromodomain- H elicase- D NA-binding protein 3) — фермент , кодируемый у человека геном CHD3 .

Этот ген кодирует члена CHD семейства белков, которые характеризуются наличием хромодоменов (организация модификатора хроматина) и SNF2-связанных хеликазных/АТФазных доменов. Этот белок является одним из компонентов комплекса гистондеацетилаз , называемого Mi-2/NuRD комплексом, который участвует в ремоделировании хроматина при деацетилировании гистонов. Ремоделирование хроматина имеет важное значение для многих процессов, включая транскрипцию . Аутоантитела против этого белка содержатся в подгруппе пациентов с дерматомиозитом . Существуют три альтернативных варианта транскриптов сплайсинга , кодирующих различные изоформы.

Взаимодействия

CHD3, как было выявлено, взаимодействует с HDAC1 , гистондезацетилаза 2 и SERBP1 .

Примечания

  1. Woodage T., Basrai M.A., Baxevanis A.D., Hieter P., Collins F.S. Characterization of the CHD family of proteins (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1997. — November ( vol. 94 , no. 21 ). — P. 11472—11477 . — doi : . — . — PMC .
  2. Ge Q., Nilasena D.S., O'Brien C.A., Frank M.B., Targoff I.N. Molecular analysis of a major antigenic region of the 240-kD protein of Mi-2 autoantigen (англ.) // (англ.) : journal. — 1995. — November ( vol. 96 , no. 4 ). — P. 1730—1737 . — doi : . — . — PMC .
  3. .
  4. Tong, J K; Hassig C A; Schnitzler G R; Kingston R E; Schreiber S L. Chromatin deacetylation by an ATP-dependent nucleosome remodelling complex (англ.) // Nature : journal. — ENGLAND, 1998. — October ( vol. 395 , no. 6705 ). — P. 917—921 . — ISSN . — doi : . — .
  5. Kuzmichev, A; Zhang Y; Erdjument-Bromage H; Tempst P; Reinberg D. Role of the Sin3-Histone Deacetylase Complex in Growth Regulation by the Candidate Tumor Suppressor p33ING1 (англ.) // (англ.) : journal. — United States, 2002. — February ( vol. 22 , no. 3 ). — P. 835—848 . — ISSN . — doi : . — . — PMC .
  6. Hakimi, Mohamed-Ali; Dong Yuanshu; Lane William S; Speicher David W; Shiekhattar Ramin. A candidate X-linked mental retardation gene is a component of a new family of histone deacetylase-containing complexes (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — United States, 2003. — February ( vol. 278 , no. 9 ). — P. 7234—7239 . — ISSN . — doi : . — .
  7. Hakimi, Mohamed-Ali; Bochar Daniel A; Schmiesing John A; Dong Yuanshu; Barak Orr G; Speicher David W; Yokomori Kyoko; Shiekhattar Ramin. A chromatin remodelling complex that loads cohesin onto human chromosomes (англ.) // Nature : journal. — England, 2002. — August ( vol. 418 , no. 6901 ). — P. 994—998 . — ISSN . — doi : . — .
  8. Lemos, Taíla A; Passos Dario O; Nery Flávia C; Kobarg Jörg. Characterization of a new family of proteins that interact with the C-terminal region of the chromatin-remodeling factor CHD-3 (англ.) // (англ.) : journal. — Netherlands, 2003. — January ( vol. 533 , no. 1—3 ). — P. 14—20 . — ISSN . — doi : . — .
  9. Stelzl, Ulrich; Worm Uwe, Lalowski Maciej, Haenig Christian, Brembeck Felix H., Goehler Heike, Stroedicke Martin, Zenkner Martina, Schoenherr Anke, Koeppen Susanne, Timm Jan, Mintzlaff Sascha, Abraham Claudia, Bock Nicole, Kietzmann Silvia, Goedde Astrid, Toksöz Engin, Droege Anja, Krobitsch Sylvia, Korn Bernhard, Birchmeier Walter, Lehrach Hans, Wanker Erich E. A human protein-protein interaction network: a resource for annotating the proteome (англ.) // Cell : journal. — United States: Cell Press , 2005. — September ( vol. 122 , no. 6 ). — P. 957—968 . — ISSN . — doi : . — .

Литература

  • Bowen N.J., Fujita N., Kajita M., Wade P.A. Mi-2/NuRD: multiple complexes for many purposes (англ.) // (англ.) : journal. — 2004. — Vol. 1677 , no. 1—3 . — P. 52—7 . — doi : . — .
  • Gieser L., Swaroop A. Expressed sequence tags and chromosomal localization of cDNA clones from a subtracted retinal pigment epithelium library (англ.) // Genomics : journal. — Academic Press , 1992. — Vol. 13 , no. 3 . — P. 873—876 . — doi : . — .
  • Seelig H.P., Moosbrugger I., Ehrfeld H., et al. The major dermatomyositis-specific Mi-2 autoantigen is a presumed helicase involved in transcriptional activation (англ.) // (англ.) : journal. — 1995. — Vol. 38 , no. 10 . — P. 1389—1399 . — doi : . — .
  • Seelig H.P., Renz M., Targoff I.N., et al. Two forms of the major antigenic protein of the dermatomyositis-specific Mi-2 autoantigen (англ.) // (англ.) : journal. — 1996. — Vol. 39 , no. 10 . — P. 1769—1771 . — doi : . — .
  • Bonaldo M.F., Lennon G., Soares M.B. Normalization and subtraction: two approaches to facilitate gene discovery (англ.) // (англ.) : journal. — 1997. — Vol. 6 , no. 9 . — P. 791—806 . — doi : . — .
  • Aubry F., Mattéi M.G., Galibert F. Identification of a human 17p-located cDNA encoding a protein of the Snf2-like helicase family (англ.) // (англ.) : journal. — 1998. — Vol. 254 , no. 3 . — P. 558—564 . — doi : . — .
  • Tong J.K., Hassig C.A., Schnitzler G.R., et al. Chromatin deacetylation by an ATP-dependent nucleosome remodelling complex (англ.) // Nature : journal. — 1998. — Vol. 395 , no. 6705 . — P. 917—921 . — doi : . — .
  • Kleiderlein J.J., Nisson P.E., Jessee J., et al. CCG repeats in cDNAs from human brain (англ.) // Hum. Genet. : journal. — 1999. — Vol. 103 , no. 6 . — P. 666—673 . — doi : . — .
  • Kim J., Sif S., Jones B., et al. Ikaros DNA-binding proteins direct formation of chromatin remodeling complexes in lymphocytes (англ.) // Immunity : journal. — Cell Press , 1999. — Vol. 10 , no. 3 . — P. 345—355 . — doi : . — .
  • Wade P.A., Gegonne A., Jones P.L., et al. Mi-2 complex couples DNA methylation to chromatin remodelling and histone deacetylation (англ.) // Nat. Genet. : journal. — 1999. — Vol. 23 , no. 1 . — P. 62—6 . — doi : . — .
  • Cousin P., Billotte J., Chaubert P., Shaw P. Physical map of 17p13 and the genes adjacent to p53 (англ.) // Genomics : journal. — Academic Press , 2000. — Vol. 63 , no. 1 . — P. 60—8 . — doi : . — .
  • Minty A., Dumont X., Kaghad M., Caput D. Covalent modification of p73alpha by SUMO-1. Two-hybrid screening with p73 identifies novel SUMO-1-interacting proteins and a SUMO-1 interaction motif (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2000. — Vol. 275 , no. 46 . — P. 36316—36323 . — doi : . — .
  • Schultz D.C., Friedman J.R., Rauscher F.J. Targeting histone deacetylase complexes via KRAB-zinc finger proteins: the PHD and bromodomains of KAP-1 form a cooperative unit that recruits a novel isoform of the Mi-2α subunit of NuRD (англ.) // Genes Dev. : journal. — 2001. — Vol. 15 , no. 4 . — P. 428—443 . — doi : . — . — PMC .
  • Yasui D., Miyano M., Cai S., et al. SATB1 targets chromatin remodelling to regulate genes over long distances (англ.) // Nature : journal. — 2002. — Vol. 419 , no. 6907 . — P. 641—645 . — doi : . — .
  • Strausberg R.L., Feingold E.A., Grouse L.H., et al. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99 , no. 26 . — P. 16899—16903 . — doi : . — . — PMC .
  • Lemos T.A., Passos D.O., Nery F.C., Kobarg J. Characterization of a new family of proteins that interact with the C-terminal region of the chromatin-remodeling factor CHD-3 (англ.) // (англ.) : journal. — 2003. — Vol. 533 , no. 1—3 . — P. 14—20 . — doi : . — .
  • Fujita N., Jaye D.L., Kajita M., et al. MTA3, a Mi-2/NuRD complex subunit, regulates an invasive growth pathway in breast cancer (англ.) // Cell : journal. — Cell Press , 2003. — Vol. 113 , no. 2 . — P. 207—219 . — doi : . — .
  • Lee B.H., Yoshimatsu K., Maeda A., et al. Association of the nucleocapsid protein of the Seoul and Hantaan hantaviruses with small ubiquitin-like modifier-1-related molecules (англ.) // Virus Res. : journal. — 2004. — Vol. 98 , no. 1 . — P. 83—91 . — doi : . — .
Источник —

Same as CHD3