Interested Article - RBBP4

Связывающий гистоны белок RBBP4 (также известный как RbAp48 или NURF55 ) — белок, кодируемый у человека геном RBBP4 .

Функция

Этот ген кодирует повсеместно экспрессированный ядерный белок, который принадлежит к весьма консервативным подсемействам WD-повторных белков. Он присутствует в белковых комплексах, участвующих в ацетилировании гистонов и сборке хроматина . Это является частью Mi-2/NuRD комплекса, который был причастен к ремоделированию хроматина и репрессии транскрипции, связанных с деацетилированием гистонов. Этот кодируемый белок также является частью корепрессора комплексов, которые являются неотъемлемой частью транскрипционного сайленсинга . Это выявлено среди нескольких клеточных белков, которые связываются непосредственно с белком ретинобластомы для регуляции пролиферации клеток. Этот белок также, кажется, вовлечен в репрессию транскрипции E2F-респонсивных генов.

Клиническое значение

Снижение RbAp48 в зубчатой извилине гиппокампа мозга, как подозревают, является основной причиной потери памяти при нормальном старении . Возрастное снижение RbAp48 наблюдается в зубчатой извилине при вскрытии тканей после смерти человека, а также у мышей. Кроме того в доминантной негативной форме RbAp48 вызывает дефицит памяти у молодых мышей подобно тому, что наблюдается у пожилых мышей. И, наконец, перенос генов лентивирусов для увеличения экспрессии RbAp48 в мозге, реверсирует нарушения памяти у пожилых мышей.

RBBP4 использует частично PKA - CREB1-CPB пути. Таким образом, одним из возможных терапевтических подходов для восстановления возрастной потери памяти является использование PKA-CREB1-CPB путей метаболизма стимулирующих препаратов. Ранее было показано, что агонисты дофамина D1/D5, такие как 6-Br-APB и SKF-38393 , которые положительно соединены с аденилатциклазой и цАМФ Фосфодиэстеразы ингибитора уменьшают дефекты памяти у пожилых мышей.

Взаимодействия

RBBP4, как было выявлено, взаимодействует с:

Примечания

  1. Qian Y.W., Wang Y.C., Hollingsworth RE Jr, Jones D., Ling N., Lee E.Y. A retinoblastoma-binding protein related to a negative regulator of Ras in yeast (англ.) // Nature : journal. — 1993. — September ( vol. 364 , no. 6438 ). — P. 648—652 . — doi : . — .
  2. Barak O., Lazzaro M.A., Lane W.S., Speicher D.W., Picketts D.J., Shiekhattar R. Isolation of human NURF: a regulator of Engrailed gene expression (англ.) // (англ.) : journal. — 2003. — November ( vol. 22 , no. 22 ). — P. 6089—6100 . — doi : . — . — PMC .
  3. .
  4. Pavlopoulos E., Jones S., Kosmidis S., Close M., Kim C., Kovalerchik O., Small S.A., Kandel E.R. Molecular Mechanism for Age-Related Memory Loss: The Histone-Binding Protein RbAp48 (англ.) // (англ.) : journal. — 2013. — August ( vol. 5 , no. 200 ). — P. 200ra115 . — doi : . — .
  5. Bach M.E., Barad M., Son H., Zhuo M., Lu Y.F., Shih R., Mansuy I., Hawkins R.D., Kandel E.R. Age-related defects in spatial memory are correlated with defects in the late phase of hippocampal long-term potentiation in vitro and are attenuated by drugs that enhance the cAMP signaling pathway (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1999. — April ( vol. 96 , no. 9 ). — P. 5280—5285 . — doi : . — . — PMC .
  6. Yarden R.I., Brody L.C. BRCA1 interacts with components of the histone deacetylase complex (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1999. — Vol. 96 , no. 9 . — P. 4983—4988 . — doi : . — . — PMC .
  7. Zhang Q., Vo N., Goodman R.H. Histone binding protein RbAp48 interacts with a complex of CREB binding protein and phosphorylated CREB (англ.) // (англ.) : journal. — 2000. — Vol. 20 , no. 14 . — P. 4970—4978 . — doi : . — . — PMC .
  8. Feng Q., Cao R., Xia L., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Zhang Y. Identification and functional characterization of the p66/p68 components of the MeCP1 complex (англ.) // (англ.) : journal. — 2002. — Vol. 22 , no. 2 . — P. 536—546 . — doi : . — . — PMC .
  9. Zhang Y., Dufau M.L. Dual mechanisms of regulation of transcription of luteinizing hormone receptor gene by nuclear orphan receptors and histone deacetylase complexes (англ.) // (англ.) : journal. — 2003. — Vol. 85 , no. 2—5 . — P. 401—414 . — doi : . — .
  10. Yao Y.L., Yang W.M. The metastasis-associated proteins 1 and 2 form distinct protein complexes with histone deacetylase activity (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2003. — Vol. 278 , no. 43 . — P. 42560—42568 . — doi : . — .
  11. Nicolas E., Ait-Si-Ali S., Trouche D. The histone deacetylase HDAC3 targets RbAp48 to the retinoblastoma protein (англ.) // (англ.) : journal. — 2001. — Vol. 29 , no. 15 . — P. 3131—3136 . — doi : . — . — PMC .
  12. Grozinger C.M., Hassig C.A., Schreiber S.L. Three proteins define a class of human histone deacetylases related to yeast Hda1p (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1999. — Vol. 96 , no. 9 . — P. 4868—4873 . — doi : . — . — PMC .
  13. You A., Tong J.K., Grozinger C.M., Schreiber S.L. CoREST is an integral component of the CoREST- human histone deacetylase complex (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2001. — Vol. 98 , no. 4 . — P. 1454—1458 . — doi : . — . — PMC .
  14. Hassig C.A., Fleischer T.C., Billin A.N., Schreiber S.L., Ayer D.E. Histone deacetylase activity is required for full transcriptional repression by mSin3A (англ.) // Cell : journal. — Cell Press , 1997. — Vol. 89 , no. 3 . — P. 341—347 . — doi : . — .
  15. Ng H.H., Zhang Y., Hendrich B., Johnson C.A., Turner B.M., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Reinberg D., Bird A. MBD2 is a transcriptional repressor belonging to the MeCP1 histone deacetylase complex (англ.) // Nat. Genet. : journal. — 1999. — Vol. 23 , no. 1 . — P. 58—61 . — doi : . — .
  16. Zhang Y., Ng H.H., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Bird A., Reinberg D. Analysis of the NuRD subunits reveals a histone deacetylase core complex and a connection with DNA methylation (англ.) // Genes Dev. : journal. — 1999. — Vol. 13 , no. 15 . — P. 1924—1935 . — doi : . — . — PMC .
  17. Zhang Y., Dufau M.L. Silencing of transcription of the human luteinizing hormone receptor gene by histone deacetylase-mSin3A complex (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2002. — Vol. 277 , no. 36 . — P. 33431—33438 . — doi : . — .
  18. Hassig C.A., Tong J.K., Fleischer T.C., Owa T., Grable P.G., Ayer D.E., Schreiber S.L. A role for histone deacetylase activity in HDAC1-mediated transcriptional repression (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1998. — Vol. 95 , no. 7 . — P. 3519—3524 . — doi : . — . — PMC .
  19. Zhang Y., Iratni R., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Reinberg D. Histone deacetylases and SAP18, a novel polypeptide, are components of a human Sin3 complex (англ.) // Cell : journal. — Cell Press , 1997. — Vol. 89 , no. 3 . — P. 357—364 . — doi : . — .
  20. Hakimi M.A., Dong Y., Lane W.S., Speicher D.W., Shiekhattar R. A candidate X-linked mental retardation gene is a component of a new family of histone deacetylase-containing complexes (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2003. — Vol. 278 , no. 9 . — P. 7234—7239 . — doi : . — .
  21. Tong J.K., Hassig C.A., Schnitzler G.R., Kingston R.E., Schreiber S.L. Chromatin deacetylation by an ATP-dependent nucleosome remodelling complex (англ.) // Nature : journal. — 1998. — Vol. 395 , no. 6705 . — P. 917—921 . — doi : . — .
  22. Qian Y.W., Lee E.Y. Dual retinoblastoma-binding proteins with properties related to a negative regulator of ras in yeast (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1995. — Vol. 270 , no. 43 . — P. 25507—25513 . — doi : . — .
  23. Nicolas E., Morales V., Magnaghi-Jaulin L., Harel-Bellan A., Richard-Foy H., Trouche D. RbAp48 belongs to the histone deacetylase complex that associates with the retinoblastoma protein (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2000. — Vol. 275 , no. 13 . — P. 9797—9804 . — doi : . — .
  24. Zhang Y., Sun Z.W., Iratni R., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Hampsey M., Reinberg D. SAP30, a novel protein conserved between human and yeast, is a component of a histone deacetylase complex (англ.) // (англ.) : journal. — 1998. — Vol. 1 , no. 7 . — P. 1021—1031 . — doi : . — .
  25. Kuzmichev A., Zhang Y., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Reinberg D. Role of the Sin3-histone deacetylase complex in growth regulation by the candidate tumor suppressor p33(ING1) (англ.) // (англ.) : journal. — 2002. — Vol. 22 , no. 3 . — P. 835—848 . — doi : . — . — PMC .

Литература

  • . . Bethesda, MD: National Center for Biotechnology Information (NCBI) . Дата обращения: 6 сентября 2013. 3 декабря 2013 года.
  • Bauw G; Rasmussen HH; van den Bulcke M; Damme, Jozef Van; Puype, Magda; Gesser, Borbala; Celis, Julio E.; Vandekerckhove, Joël. Two-dimensional gel electrophoresis, protein electroblotting and microsequencing: a direct link between proteins and genes (англ.) // Electrophoresis : journal. — 1990. — Vol. 11 , no. 7 . — P. 528—536 . — doi : . — .
  • Grozinger CM; Hassig C.A., Schreiber S.L. Three proteins define a class of human histone deacetylases related to yeast Hda1p (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1999. — Vol. 96 , no. 9 . — P. 4868—4873 . — doi : . — . — PMC .
  • Hassig CA; Tong JK; Fleischer TC; Owa, T; Grable, PG; Ayer, DE; Schreiber, S.L. A role for histone deacetylase activity in HDAC1-mediated transcriptional repression (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1998. — Vol. 95 , no. 7 . — P. 3519—3524 . — doi : . — . — PMC .
  • Marheineke K; Krude T. Nucleosome assembly activity and intracellular localization of human CAF-1 changes during the cell division cycle (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1998. — Vol. 273 , no. 24 . — P. 15279—15286 . — doi : . — .
  • Maruyama K; Sugano S. Oligo-capping: a simple method to replace the cap structure of eukaryotic mRNAs with oligoribonucleotides (англ.) // (англ.) : journal. — Elsevier , 1994. — Vol. 138 , no. 1—2 . — P. 171—174 . — doi : . — .
  • Qian YW; Lee E.Y. Dual retinoblastoma-binding proteins with properties related to a negative regulator of ras in yeast (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1995. — Vol. 270 , no. 43 . — P. 25507—25513 . — doi : . — .
  • Rasmussen HH; van Damme J; Puype M; Gesser, Borbala; Celis, Julio E.; Vandekerckhove, Joël. Microsequences of 145 proteins recorded in the two-dimensional gel protein database of normal human epidermal keratinocytes (англ.) // Electrophoresis : journal. — 1993. — Vol. 13 , no. 12 . — P. 960—969 . — doi : . — .
  • Suzuki Y; Yoshitomo-Nakagawa K; Maruyama K; Suyama, Akira; Sugano, Sumio. Construction and characterization of a full length-enriched and a 5'-end-enriched cDNA library (англ.) // (англ.) : journal. — Elsevier , 1997. — Vol. 200 , no. 1—2 . — P. 149—156 . — doi : . — .
  • Taunton J; Hassig C.A., Schreiber S.L. A mammalian histone deacetylase related to the yeast transcriptional regulator Rpd3p (англ.) // Science : journal. — 1996. — Vol. 272 , no. 5260 . — P. 408—411 . — doi : . — .
  • Tong JK; Hassig CA; Schnitzler GR; Schnitzler, Gavin R.; Kingston, Robert E. Chromatin deacetylation by an ATP-dependent nucleosome remodelling complex (англ.) // Nature : journal. — 1998. — Vol. 395 , no. 6705 . — P. 917—921 . — doi : . — .
  • Verreault A; Kaufman PD; Kobayashi R., Stillman B. Nucleosomal DNA regulates the core-histone-binding subunit of the human Hat1 acetyltransferase (англ.) // Curr. Biol. : journal. — 1998. — Vol. 8 , no. 2 . — P. 96—108 . — doi : . — .
  • Verreault A; Kaufman PD; Kobayashi R., Stillman B. Nucleosome assembly by a complex of CAF-1 and acetylated histones H3/H4 (англ.) // Cell : journal. — Cell Press , 1996. — Vol. 87 , no. 1 . — P. 95—104 . — doi : . — .
  • Wolffe AP; Urnov FD; Guschin D. Co-repressor complexes and remodelling chromatin for repression (англ.) // (англ.) : journal. — 2001. — Vol. 28 , no. 4 . — P. 379—386 . — doi : . — .
  • Yarden RI; Brody L.C. BRCA1 interacts with components of the histone deacetylase complex (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1999. — Vol. 96 , no. 9 . — P. 4983—4988 . — doi : . — . — PMC .
  • Zhang Y; Ng HH; Erdjument-Bromage H; Tempst, P.; Bird, A.; Reinberg, D. Analysis of the NuRD subunits reveals a histone deacetylase core complex and a connection with DNA methylation (англ.) // Genes Dev. : journal. — 1999. — Vol. 13 , no. 15 . — P. 1924—1935 . — doi : . — . — PMC .
  • Zhang Y; Iratni R; Erdjument-Bromage H; Tempst, Paul; Reinberg, Danny. Histone deacetylases and SAP18, a novel polypeptide, are components of a human Sin3 complex (англ.) // Cell : journal. — Cell Press , 1997. — Vol. 89 , no. 3 . — P. 357—364 . — doi : . — .
  • Zhang Y; Sun ZW; Iratni R; Erdjument-Bromage, Hediye; Tempst, Paul; Hampsey, Michael; Reinberg, Danny. SAP30, a novel protein conserved between human and yeast, is a component of a histone deacetylase complex (англ.) // (англ.) : journal. — 1998. — Vol. 1 , no. 7 . — P. 1021—1031 . — doi : . — .
  • Zhang Y; LeRoy G; Seelig HP; Lane, William S; Reinberg, Danny. The dermatomyositis-specific autoantigen Mi2 is a component of a complex containing histone deacetylase and nucleosome remodeling activities (англ.) // Cell : journal. — Cell Press , 1998. — Vol. 95 , no. 2 . — P. 279—289 . — doi : . — .
  • Zhang Y; Dufau M.L. Dual mechanisms of regulation of transcription of luteinizing hormone receptor gene by nuclear orphan receptors and histone deacetylase complexes (англ.) // (англ.) : journal. — 2003. — Vol. 85 , no. 2—5 . — P. 401—414 . — doi : . — .
Источник —

Same as RBBP4