Interested Article - SATB1

amity
  • 2020-01-24
  • 1

ATB1 (специальный богатый АТ связывающий последовательности белок 1) — белок , кодируемый у человека геном SATB1 .

Функция

SATB1, глобальный организатор хроматина и фактор транскрипции , возник как ключевой фактор более высокого порядка интеграции архитектуры хроматина с генной регуляцией . Недавние исследования разгадали роль SATB1 в организации цикличности хроматина и его динамичный характер реакции на физиологические стимулы . На уровне генома , SATB1 по-видимому, играет важную роль в организации транскрипционно уравновешенного хроматина. SATB1 организует локус MHC class-I в различных петлях хроматина, связывая MAR ядерных матриц при фиксированных расстояниях. Сайленсинг SATB1 имитирует эффекты обработки на петле хроматина архитектуры локуса и изменения экспрессии генов в локусе. SATB1, как также было выявлено, может вызвать рост опухоли рака молочной железы и метастазирования путём изменения экспрессии большого числа генов.

Взаимодействия

SATB1, как было выявлено, взаимодействует с HDAC1 , , MTA2 , CHD4 , , POLR2J и .

Примечания

  1. . 5 декабря 2010 года.
  2. Pavan Kumar P., Purbey P.K., Sinha C.K., Notani D., Limaye A., Jayani R.S., Galande S. Phosphorylation of SATB1, a global gene regulator, acts as a molecular switch regulating its transcriptional activity in vivo (англ.) // (англ.) ( : journal. — 2006. — April ( vol. 22 , no. 2 ). — P. 231—243 . — doi : . — .
  3. Galande S., Purbey P.K., Notani D., Kumar P.P. The third dimension of gene regulation: organization of dynamic chromatin loopscape by SATB1 (англ.) // Curr. Opin. Genet. Dev. : journal. — 2007. — October ( vol. 17 , no. 5 ). — P. 408—414 . — doi : . — .
  4. ↑ Yasui, Dag; Miyano Masaru, Cai Shutao, Varga-Weisz Patrick, Kohwi-Shigematsu Terumi. SATB1 targets chromatin remodelling to regulate genes over long distances (англ.) // Nature : journal. — England, 2002. — October ( vol. 419 , no. 6907 ). — P. 641—645 . — ISSN . — doi : . — .
  5. Liu, J; Barnett A; Neufeld E J; Dudley J P. Homeoproteins CDP and SATB1 Interact: Potential for Tissue-Specific Regulation (англ.) // (англ.) ( : journal. — UNITED STATES, 1999. — July ( vol. 19 , no. 7 ). — P. 4918—4926 . — ISSN . — . — PMC .
  6. Durrin, Linda K; Krontiris Theodore G. The thymocyte-specific MAR binding protein, SATB1, interacts in vitro with a novel variant of DNA-directed RNA polymerase II, subunit 11 (англ.) // Genomics : journal. — United States: Academic Press , 2002. — June ( vol. 79 , no. 6 ). — P. 809—817 . — ISSN . — doi : . — .

Литература

  • Dickinson L.A., Joh T., Kohwi Y., Kohwi-Shigematsu T. A tissue-specific MAR/SAR DNA-binding protein with unusual binding site recognition (англ.) // Cell : journal. — Cell Press , 1992. — Vol. 70 , no. 4 . — P. 631—645 . — doi : . — .
  • Robertson N.G., Khetarpal U., Gutiérrez-Espeleta G.A., et al. Isolation of novel and known genes from a human fetal cochlear cDNA library using subtractive hybridization and differential screening (англ.) // Genomics : journal. — Academic Press , 1995. — Vol. 23 , no. 1 . — P. 42—50 . — doi : . — .
  • Nakagomi K., Kohwi Y., Dickinson L.A., Kohwi-Shigematsu T. A novel DNA-binding motif in the nuclear matrix attachment DNA-binding protein SATB1 (англ.) // (англ.) ( : journal. — 1994. — Vol. 14 , no. 3 . — P. 1852—1860 . — . — PMC .
  • Xu L., Deng H.X., Xia J.H., et al. Assignment of SATB1 to human chromosome band 3p23 by in situ hybridization (англ.) // (англ.) ( : journal. — 1997. — Vol. 77 , no. 3—4 . — P. 205—206 . — doi : . — .
  • Reddy P.H., Stockburger E., Gillevet P., Tagle D.A. Mapping and characterization of novel (CAG)n repeat cDNAs from adult human brain derived by the oligo capture method (англ.) // Genomics : journal. — Academic Press , 1998. — Vol. 46 , no. 2 . — P. 174—182 . — doi : . — .
  • Escalier D., Allenet B., Badrichani A., Garchon H.J. High level expression of the Xlr nuclear protein in immature thymocytes and colocalization with the matrix-associated region-binding SATB1 protein (англ.) // (англ.) ( : journal. — 1999. — Vol. 162 , no. 1 . — P. 292—298 . — .
  • Liu J., Barnett A., Neufeld E.J., Dudley J.P. Homeoproteins CDP and SATB1 Interact: Potential for Tissue-Specific Regulation (англ.) // (англ.) ( : journal. — 1999. — Vol. 19 , no. 7 . — P. 4918—4926 . — . — PMC .
  • Galande S., Dickinson L.A., Mian I.S., et al. SATB1 Cleavage by Caspase 6 Disrupts PDZ Domain-Mediated Dimerization, Causing Detachment from Chromatin Early in T-Cell Apoptosis (англ.) // (англ.) ( : journal. — 2001. — Vol. 21 , no. 16 . — P. 5591—5604 . — doi : . — . — PMC .
  • Kieffer L.J., Greally J.M., Landres I., et al. Identification of a candidate regulatory region in the human CD8 gene complex by colocalization of DNase I hypersensitive sites and matrix attachment regions which bind SATB1 and GATA-3 (англ.) // (англ.) ( : journal. — 2002. — Vol. 168 , no. 8 . — P. 3915—3922 . — doi : . — .
  • Durrin L.K., Krontiris T.G. The thymocyte-specific MAR binding protein, SATB1, interacts in vitro with a novel variant of DNA-directed RNA polymerase II, subunit 11 (англ.) // Genomics : journal. — Academic Press , 2002. — Vol. 79 , no. 6 . — P. 809—817 . — doi : . — .
  • Yasui D., Miyano M., Cai S., et al. SATB1 targets chromatin remodelling to regulate genes over long distances (англ.) // Nature. — 2002. — Vol. 419 , no. 6907 . — P. 641—645 . — doi : . — .
  • Strausberg R.L., Feingold E.A., Grouse L.H., et al. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99 , no. 26 . — P. 16899—16903 . — doi : . — . — PMC .
  • Cai S., Han H.J., Kohwi-Shigematsu T. Tissue-specific nuclear architecture and gene expression regulated by SATB1 (англ.) // Nat. Genet. : journal. — 2003. — Vol. 34 , no. 1 . — P. 42—51 . — doi : . — .
  • Fujii Y., Kumatori A., Nakamura M. SATB1 makes a complex with p300 and represses gp91(phox) promoter activity (англ.) // Microbiol. Immunol. : journal. — 2004. — Vol. 47 , no. 10 . — P. 803—811 . — doi : . — .
  • Gerhard D.S., Wagner L., Feingold E.A., et al. The Status, Quality, and Expansion of the NIH Full-Length cDNA Project: The Mammalian Gene Collection (MGC) (англ.) // (англ.) ( : journal. — 2004. — Vol. 14 , no. 10B . — P. 2121—2127 . — doi : . — . — PMC .
  • Gocke C.B., Yu H., Kang J. Systematic identification and analysis of mammalian small ubiquitin-like modifier substrates (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2005. — Vol. 280 , no. 6 . — P. 5004—5012 . — doi : . — .
  • Wen J., Huang S., Rogers H., et al. SATB1 family protein expressed during early erythroid differentiation modifies globin gene expression (англ.) // (англ.) ( : journal. — (англ.) ( , 2005. — Vol. 105 , no. 8 . — P. 3330—3339 . — doi : . — .
  • Seo J., Lozano M.M., Dudley J.P. Nuclear matrix binding regulates SATB1-mediated transcriptional repression (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2005. — Vol. 280 , no. 26 . — P. 24600—24609 . — doi : . — .
  • Nakayama Y., Mian I.S., Kohwi-Shigematsu T., Ogawa T. A nuclear targeting determinant for SATB1, a genome organizer in the T cell lineage (англ.) // (англ.) ( : journal. — 2006. — Vol. 4 , no. 8 . — P. 1099—1106 . — .
  • Rual J.F., Venkatesan K., Hao T., et al. Towards a proteome-scale map of the human protein-protein interaction network (англ.) // Nature : journal. — 2005. — Vol. 437 , no. 7062 . — P. 1173—1178 . — doi : . — .
Источник —

amity
  • 2020-01-24
  • 1
  • Tags:

Same as SATB1

The title for the last searches