Флаг города Ялуторовска представляет собой прямоугольное полотнище синего цвета, высота и ширина которого соотносятся как 2:3, в центре которого изображено серебряное мельничное колесо с лопастями — гербовая эмблема города Ялуторовска. Высота эмблемы колеса составляет 1/2 высоты полотнища. Оборотная сторона флага является зеркальным отображением его лицевой стороны. Эмблема колеса (если она изображается не серебром) должна быть окрашена в цвет, максимально приближенный к серебряному, но не переходить в серый или белый цвет.