Interested Article - Mercury (кристаллография)

Mercury — бесплатное программное обеспечение, разработанное . Первоначально разработано как инструмент визуализации кристаллической структуры . Mercury предоставляет возможность трехмерной визуализации кристаллической структуры, а также рисовании и анализе кристаллической упаковки и межмолекулярных взаимодействий . Текущая версия Mercury может читать файлы типов «. cif », «.mol», «.mol2», «.pdb», «.res», «.sd» и «.xyz». Mercury имеет собственный формат файла с расширением имени файла «.mryx» .

История

Кембриджский центр кристаллографических данных (CCDC) разработал и запустил две программы, названные ConQuest и Mercury , которые работают под Windows и различными типами Unix , включая Linux . ConQuest как поисковый интерфейс для (CSD) с кодом Fortran , который выполняет широкий спектр задач, таких как поиск двухмерных и трехмерных подструктур. Программа Mercury представлена как визуализатор кристаллической структуры, обладающий возможностями работы с межмолекулярными контактами. Программа Mercury полностью написана на объектно-ориентированном C++ . Для создания графического интерфейса используется библиотека C++ Qt , а для рендеринга трехмерной графики — OpenGL . Основная цель первого поколения Mercury была обеспечить трехмерное изображение кристаллических структур в форматах .MOL2, .PDB, .CIF, .MOL . В первой версии около 2800 пользователей подписались на список обновлений Mercury по электронной почте . Версия Mercury 2.0, выпущенная в 2008 году, содержит дополнительные инструменты для интерпретации и сравнения тенденций упаковки в кристаллических структурах. С 2015 года Mercury предоставляет дополнительные функции для создания 3D-печати . Текущая версия 4.0 Mercury в большей степени усовершенствовала свой визуальный интерфейс по сравнению со своими старыми версиями .

Лицензия

Mercury доступен в виде бесплатной загрузки программного обеспечения и полной версии Mercury с более расширенными функциями, доступными с лицензией CSD, расширенные функции отключаются при отсутствии такой лицензии. Кембриджский центр кристаллографических данных (CCDC) предоставляет лицензию CSD академическим учреждениям .

См. также

Примечания

Clare F., Macrae (28 February 2006). (PDF) . Journal of Applied Crystallography . 39 . doi : .
↑ . ccdc.cam.ac.uk . Дата обращения: 18 апреля 2022. 19 апреля 2022 года.
Allen, Frank H. (2002-05-29). "The Cambridge Structural Database: a quarter of a million crystal structures and rising". Acta Crystallographica Section B Structural Science . International Union of Crystallography (IUCr). 58 (3): 380—388. doi : . ISSN .
Bruno, I. J. . Acta Crystallographica Section B . B58 . doi : . из оригинала 23 апреля 2022 . Дата обращения: 18 апреля 2022 .
I. Sovago, C. F. Macrae. (PDF) . Journal of Applied Crystallography . 53 . doi : . (PDF) из оригинала 3 февраля 2022 . Дата обращения: 18 апреля 2022 .
(англ.) . The Cambridge Crystallographic Data Centre (CCDC) (19 августа 2015). Дата обращения: 18 мая 2019. 18 мая 2019 года.