Трепанация ( лат. trepanatio ) — хирургическая операция пробуравливания кости, имеющая целью проникнуть к болезненному очагу (Ушаков).

Выделяют несколько её видов:

• Трепанация черепа ( лат. trepanatio cranii ) — хирургическая операция образования отверстия в костях черепа с целью доступа к подлежащей полости.
• Трепанация сосцевидного отростка височной кости ( лат. mastoidotomia, antrotomia ) при мастоидите.
• Трепанация трубчатых костей при остеомиелите .
• Трепанация зуба ( лат. trepanatio dentis ) — вскрытие его полости.
• Трепано-биопсия — взятие костного мозга для исследования.