Interested Article - Гистондеацетилаза 2

ainsleigh
  • 2020-12-15
  • 1

Гистондеацетилаза 2 — фермент из семейства деацетилаз гистонов , кодируемый у человека геном HDAC2 .

Функция

Продукт гена HDAC2 относится к семейству деацетилаз гистонов . Гистондеацетилазы работают в составе крупных мультибелковых комплексов и отвечают за деацетилирование остатков лизина на N-концевой области кóровых гистонов (H2A, H2B, H3 и H4). Этот белок также формирует комплексы транскрипционных репрессоров , связываясь с различными белками, в том числе YY1, одним из фактором транскрипции млекопитающих. Гистондеацетилаза 2 играет важную роль в регуляции транскрипции , клеточного цикла и в развитии.

Взаимодействия

Гистондезацетилаза 2 взаимодействует с:

Примечания

  1. ↑ - Ensembl , May 2017
  2. ↑ - Ensembl , May 2017
  3. Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. Betz R., Gray S.G., Ekström C., Larsson C., Ekström T.J. Human histone deacetylase 2, HDAC2 (Human RPD3), is localized to 6q21 by radiation hybrid mapping (англ.) // Genomics : journal. — Academic Press , 1998. — December ( vol. 52 , no. 2 ). — P. 245—246 . — doi : . — .
  6. .
  7. ↑ Schmidt D.R., Schreiber S.L. Molecular association between ATR and two components of the nucleosome remodeling and deacetylating complex, HDAC2 and CHD4 (англ.) // Biochemistry : journal. — Vol. 38 , no. 44 . — P. 14711—14717 . — doi : . — .
  8. ↑ Yoon Y.M., Baek K.H., Jeong S.J., Shin H.J., Ha G.H., Jeon A.H., Hwang S.G., Chun J.S., Lee C.W. WD repeat-containing mitotic checkpoint proteins act as transcriptional repressors during interphase (англ.) // (англ.) ( : journal. — Vol. 575 , no. 1—3 . — P. 23—9 . — doi : . — .
  9. ↑ Hakimi M.A., Dong Y., Lane W.S., Speicher D.W., Shiekhattar R. A candidate X-linked mental retardation gene is a component of a new family of histone deacetylase-containing complexes (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — Vol. 278 , no. 9 . — P. 7234—7239 . — doi : . — .
  10. ↑ Tong J.K., Hassig C.A., Schnitzler G.R., Kingston R.E., Schreiber S.L. Chromatin deacetylation by an ATP-dependent nucleosome remodelling complex (англ.) // Nature : journal. — Vol. 395 , no. 6705 . — P. 917—921 . — doi : . — .
  11. ↑ Hakimi M.A., Bochar D.A., Schmiesing J.A., Dong Y., Barak O.G., Speicher D.W., Yokomori K., Shiekhattar R. A chromatin remodelling complex that loads cohesin onto human chromosomes (англ.) // Nature : journal. — Vol. 418 , no. 6901 . — P. 994—998 . — doi : . — .
  12. Rountree M.R., Bachman K.E., Baylin S.B. DNMT1 binds HDAC2 and a new co-repressor, DMAP1, to form a complex at replication foci (англ.) // Nat. Genet. : journal. — Vol. 25 , no. 3 . — P. 269—277 . — doi : . — .
  13. ↑ van der Vlag J., Otte A.P. Transcriptional repression mediated by the human polycomb-group protein EED involves histone deacetylation (англ.) // Nat. Genet. : journal. — Vol. 23 , no. 4 . — P. 474—478 . — doi : . — .
  14. Yang W.M., Yao Y.L., Seto E. The FK506-binding protein 25 functionally associates with histone deacetylases and with transcription factor YY1 (англ.) // (англ.) ( : journal. — Vol. 20 , no. 17 . — P. 4814—4825 . — doi : . — . — PMC .
  15. . 2010-10-07. из оригинала 3 января 2012 . Дата обращения: 9 апреля 2015 .
  16. Wen Y.D., Cress W.D., Roy A.L., Seto E. Histone deacetylase 3 binds to and regulates the multifunctional transcription factor TFII-I (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — Vol. 278 , no. 3 . — P. 1841—1847 . — doi : . — .
  17. ↑ Fischer D.D., Cai R., Bhatia U., Asselbergs F.A., Song C., Terry R., Trogani N., Widmer R., Atadja P., Cohen D. Isolation and characterization of a novel class II histone deacetylase, HDAC10 (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — Vol. 277 , no. 8 . — P. 6656—6666 . — doi : . — .
  18. ↑ Yao Y.L., Yang W.M. The metastasis-associated proteins 1 and 2 form distinct protein complexes with histone deacetylase activity (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — Vol. 278 , no. 43 . — P. 42560—42568 . — doi : . — .
  19. ↑ Hakimi M.A., Bochar D.A., Chenoweth J., Lane W.S., Mandel G., Shiekhattar R. A core-BRAF35 complex containing histone deacetylase mediates repression of neuronal-specific genes (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — Vol. 99 , no. 11 . — P. 7420—7425 . — doi : . — . — PMC .
  20. ↑ Johnson C.A., White D.A., Lavender J.S., O'Neill L.P., Turner B.M. Human class I histone deacetylase complexes show enhanced catalytic activity in the presence of ATP and co-immunoprecipitate with the ATP-dependent chaperone protein Hsp70 (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — Vol. 277 , no. 11 . — P. 9590—9597 . — doi : . — .
  21. Fischle W., Dequiedt F., Hendzel M.J., Guenther M.G., Lazar M.A., Voelter W., Verdin E. Enzymatic activity associated with class II HDACs is dependent on a multiprotein complex containing HDAC3 and SMRT/N-CoR (англ.) // (англ.) ( : journal. — Vol. 9 , no. 1 . — P. 45—57 . — doi : . — .
  22. Fischle W., Dequiedt F., Fillion M., Hendzel M.J., Voelter W., Verdin E. Human HDAC7 histone deacetylase activity is associated with HDAC3 in vivo (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — Vol. 276 , no. 38 . — P. 35826—35835 . — doi : . — .
  23. Ashburner B.P., Westerheide S.D., Baldwin A.S. The p65 (RelA) subunit of NF-kappaB interacts with the histone deacetylase (HDAC) corepressors HDAC1 and HDAC2 to negatively regulate gene expression (англ.) // (англ.) ( : journal. — Vol. 21 , no. 20 . — P. 7065—7077 . — doi : . — . — PMC .
  24. ↑ Zhang Y., Ng H.H., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Bird A., Reinberg D. Analysis of the NuRD subunits reveals a histone deacetylase core complex and a connection with DNA methylation (англ.) // Genes Dev. : journal. — Vol. 13 , no. 15 . — P. 1924—1935 . — doi : . — . — PMC .
  25. Hassig C.A., Tong J.K., Fleischer T.C., Owa T., Grable P.G., Ayer D.E., Schreiber S.L. A role for histone deacetylase activity in HDAC1-mediated transcriptional repression (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — Vol. 95 , no. 7 . — P. 3519—3524 . — doi : . — . — PMC .
  26. Zhang Y., Iratni R., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Reinberg D. Histone deacetylases and SAP18, a novel polypeptide, are components of a human Sin3 complex (англ.) // Cell : journal. — Cell Press . — Vol. 89 , no. 3 . — P. 357—364 . — doi : . — .
  27. Wysocka J., Myers M.P., Laherty C.D., Eisenman R.N., Herr W. Human Sin3 deacetylase and trithorax-related Set1/Ash2 histone H3-K4 methyltransferase are tethered together selectively by the cell-proliferation factor HCF-1 (англ.) // Genes Dev. : journal. — Vol. 17 , no. 7 . — P. 896—911 . — doi : . — . — PMC .
  28. Mazumdar A., Wang R.A., Mishra S.K., Adam L., Bagheri-Yarmand R., Mandal M., Vadlamudi R.K., Kumar R. Transcriptional repression of oestrogen receptor by metastasis-associated protein 1 corepressor (англ.) // Nat. Cell Biol. : journal. — Vol. 3 , no. 1 . — P. 30—7 . — doi : . — .
  29. ↑ Laherty C.D., Yang W.M., Sun J.M., Davie J.R., Seto E., Eisenman R.N. Histone deacetylases associated with the mSin3 corepressor mediate mad transcriptional repression (англ.) // Cell : journal. — Cell Press . — Vol. 89 , no. 3 . — P. 349—356 . — doi : . — .
  30. Spronk C.A., Tessari M., Kaan A.M., Jansen J.F., Vermeulen M., Stunnenberg H.G., Vuister G.W. The Mad1-Sin3B interaction involves a novel helical fold (англ.) // Nat. Struct. Biol. : journal. — Vol. 7 , no. 12 . — P. 1100—1104 . — doi : . — .
  31. Brackertz M., Boeke J., Zhang R., Renkawitz R. Two highly related p66 proteins comprise a new family of potent transcriptional repressors interacting with MBD2 and MBD3 (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — Vol. 277 , no. 43 . — P. 40958—40966 . — doi : . — .
  32. Ng H.H., Zhang Y., Hendrich B., Johnson C.A., Turner B.M., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Reinberg D., Bird A. MBD2 is a transcriptional repressor belonging to the MeCP1 histone deacetylase complex (англ.) // Nat. Genet. : journal. — Vol. 23 , no. 1 . — P. 58—61 . — doi : . — .
  33. Iwase S., Januma A., Miyamoto K., Shono N., Honda A., Yanagisawa J., Baba T. Characterization of BHC80 in BRAF-HDAC complex, involved in neuron-specific gene repression (англ.) // (англ.) ( : journal. — Vol. 322 , no. 2 . — P. 601—608 . — doi : . — .
  34. Jin Q., van Eynde A., Beullens M., Roy N., Thiel G., Stalmans W., Bollen M. The protein phosphatase-1 (PP1) regulator, nuclear inhibitor of PP1 (NIPP1), interacts with the polycomb group protein, embryonic ectoderm development (EED), and functions as a transcriptional repressor (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — Vol. 278 , no. 33 . — P. 30677—30685 . — doi : . — .
  35. ↑ Zhang Y., Dufau M.L. Dual mechanisms of regulation of transcription of luteinizing hormone receptor gene by nuclear orphan receptors and histone deacetylase complexes (англ.) // (англ.) ( : journal. — Vol. 85 , no. 2—5 . — P. 401—414 . — doi : . — .
  36. ↑ Zhang Y., Dufau M.L. Silencing of transcription of the human luteinizing hormone receptor gene by histone deacetylase-mSin3A complex (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — Vol. 277 , no. 36 . — P. 33431—33438 . — doi : . — .
  37. You A., Tong J.K., Grozinger C.M., Schreiber S.L. CoREST is an integral component of the CoREST- human histone deacetylase complex (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — Vol. 98 , no. 4 . — P. 1454—1458 . — doi : . — . — PMC .
  38. Kiernan R., Brès V., Ng R.W., Coudart M.P., El Messaoudi S., Sardet C., Jin D.Y., Emiliani S., Benkirane M. Post-activation turn-off of NF-kappa B-dependent transcription is regulated by acetylation of p65 (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — Vol. 278 , no. 4 . — P. 2758—2766 . — doi : . — .
  39. Yu Z., Zhang W., Kone B.C. Histone deacetylases augment cytokine induction of the iNOS gene (англ.) // (англ.) ( : journal. — Vol. 13 , no. 8 . — P. 2009—2017 . — doi : . — .
  40. Lai A., Lee J.M., Yang W.M., DeCaprio J.A., Kaelin W.G., Seto E., Branton P.E. RBP1 recruits both histone deacetylase-dependent and -independent repression activities to retinoblastoma family proteins (англ.) // (англ.) ( : journal. — Vol. 19 , no. 10 . — P. 6632—6641 . — . — PMC .
  41. Zhang Y., Sun Z.W., Iratni R., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Hampsey M., Reinberg D. SAP30, a novel protein conserved between human and yeast, is a component of a histone deacetylase complex (англ.) // (англ.) ( : journal. — Vol. 1 , no. 7 . — P. 1021—1031 . — doi : . — .
  42. Kuzmichev A., Zhang Y., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Reinberg D. Role of the Sin3-histone deacetylase complex in growth regulation by the candidate tumor suppressor p33(ING1) (англ.) // (англ.) ( : journal. — Vol. 22 , no. 3 . — P. 835—848 . — doi : . — . — PMC .
  43. Fleischer T.C., Yun U.J., Ayer D.E. Identification and characterization of three new components of the mSin3A corepressor complex (англ.) // (англ.) ( : journal. — Vol. 23 , no. 10 . — P. 3456—3467 . — doi : . — . — PMC .
  44. Yang L., Mei Q., Zielinska-Kwiatkowska A., Matsui Y., Blackburn M.L., Benedetti D., Krumm A.A., Taborsky G.J., Chansky H.A. An ERG (ets-related gene)-associated histone methyltransferase interacts with histone deacetylases 1/2 and transcription co-repressors mSin3A/B (англ.) // (англ.) ( : journal. — Vol. 369 , no. Pt 3 . — P. 651—657 . — doi : . — . — PMC .
  45. Zhou S., Fujimuro M., Hsieh J.J., Chen L., Hayward S.D. A role for SKIP in EBNA2 activation of CBF1-repressed promoters (англ.) // (англ.) ( : journal. — Vol. 74 , no. 4 . — P. 1939—1947 . — doi : . — . — PMC .
  46. Vaute O., Nicolas E., Vandel L., Trouche D. Functional and physical interaction between the histone methyl transferase Suv39H1 and histone deacetylases (англ.) // (англ.) ( : journal. — Vol. 30 , no. 2 . — P. 475—481 . — doi : . — . — PMC .
  47. ↑ Won J., Yim J., Kim T.K. Sp1 and Sp3 recruit histone deacetylase to repress transcription of human telomerase reverse transcriptase (hTERT) promoter in normal human somatic cells (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — Vol. 277 , no. 41 . — P. 38230—38238 . — doi : . — .
  48. ↑ Sun J.M., Chen H.Y., Moniwa M., Litchfield D.W., Seto E., Davie J.R. The transcriptional repressor Sp3 is associated with CK2-phosphorylated histone deacetylase 2 (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — Vol. 277 , no. 39 . — P. 35783—35786 . — doi : . — .
  49. Tsai S.C., Valkov N., Yang W.M., Gump J., Sullivan D., Seto E. Histone deacetylase interacts directly with DNA topoisomerase II (англ.) // Nat. Genet. : journal. — Vol. 26 , no. 3 . — P. 349—353 . — doi : . — .
  50. Yang W.M., Yao Y.L., Sun J.M., Davie J.R., Seto E. Isolation and characterization of cDNAs corresponding to an additional member of the human histone deacetylase gene family (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — Vol. 272 , no. 44 . — P. 28001—28007 . — doi : . — .
  51. Yao Y.L., Yang W.M., Seto E. Regulation of transcription factor YY1 by acetylation and deacetylation (англ.) // (англ.) ( : journal. — Vol. 21 , no. 17 . — P. 5979—5991 . — doi : . — . — PMC .
  52. Kalenik J.L., Chen D., Bradley M.E., Chen S.J., Lee T.C. Yeast two-hybrid cloning of a novel zinc finger protein that interacts with the multifunctional transcription factor YY1 (англ.) // (англ.) ( : journal. — Vol. 25 , no. 4 . — P. 843—849 . — doi : . — . — PMC .

Литература

  • Ahringer J. NuRD and SIN3 histone deacetylase complexes in development (англ.) // (англ.) ( : journal. — 2000. — Vol. 16 , no. 8 . — P. 351—356 . — doi : . — .
  • Verdin E., Dequiedt F., Kasler H.G. Class II histone deacetylases: versatile regulators (англ.) // (англ.) ( : journal. — 2003. — Vol. 19 , no. 5 . — P. 286—293 . — doi : . — .
  • Zhang Y., Dufau M.L. Dual mechanisms of regulation of transcription of luteinizing hormone receptor gene by nuclear orphan receptors and histone deacetylase complexes (англ.) // (англ.) ( : journal. — 2003. — Vol. 85 , no. 2—5 . — P. 401—414 . — doi : . — .
  • Furukawa Y., Kawakami T., Sudo K., Inazawa J., Matsumine A., Akiyama T., Nakamura Y. Isolation and mapping of a human gene (RPD3L1) that is homologous to RPD3, a transcription factor in Saccharomyces cerevisiae (англ.) // (англ.) ( : journal. — 1996. — Vol. 73 , no. 1—2 . — P. 130—133 . — doi : . — .
  • Yang W.M., Inouye C., Zeng Y., Bearss D., Seto E. Transcriptional repression by YY1 is mediated by interaction with a mammalian homolog of the yeast global regulator RPD3 (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1996. — Vol. 93 , no. 23 . — P. 12845—12850 . — doi : . — . — PMC .
  • Laherty C.D., Yang W.M., Sun J.M., Davie J.R., Seto E., Eisenman R.N. Histone deacetylases associated with the mSin3 corepressor mediate mad transcriptional repression (англ.) // Cell : journal. — Cell Press , 1997. — Vol. 89 , no. 3 . — P. 349—356 . — doi : . — .
  • Zhang Y., Iratni R., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Reinberg D. Histone deacetylases and SAP18, a novel polypeptide, are components of a human Sin3 complex (англ.) // Cell : journal. — Cell Press , 1997. — Vol. 89 , no. 3 . — P. 357—364 . — doi : . — .
  • Yang W.M., Yao Y.L., Sun J.M., Davie J.R., Seto E. Isolation and characterization of cDNAs corresponding to an additional member of the human histone deacetylase gene family (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1997. — Vol. 272 , no. 44 . — P. 28001—28007 . — doi : . — .
  • Hassig C.A., Tong J.K., Fleischer T.C., Owa T., Grable P.G., Ayer D.E., Schreiber S.L. A role for histone deacetylase activity in HDAC1-mediated transcriptional repression (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1998. — Vol. 95 , no. 7 . — P. 3519—3524 . — doi : . — . — PMC .
  • Randhawa G.S., Bell D.W., Testa J.R., Feinberg A.P. Identification and mapping of human histone acetylation modifier gene homologues (англ.) // Genomics : journal. — Academic Press , 1998. — Vol. 51 , no. 2 . — P. 262—269 . — doi : . — .
  • Zhang Y., LeRoy G., Seelig H.P., Lane W.S., Reinberg D. The dermatomyositis-specific autoantigen Mi2 is a component of a complex containing histone deacetylase and nucleosome remodeling activities (англ.) // Cell : journal. — Cell Press , 1998. — Vol. 95 , no. 2 . — P. 279—289 . — doi : . — .
  • Tong J.K., Hassig C.A., Schnitzler G.R., Kingston R.E., Schreiber S.L. Chromatin deacetylation by an ATP-dependent nucleosome remodelling complex (англ.) // Nature : journal. — 1998. — Vol. 395 , no. 6705 . — P. 917—921 . — doi : . — .
  • Hsieh J.J., Zhou S., Chen L., Young D.B., Hayward S.D. CIR, a corepressor linking the DNA binding factor CBF1 to the histone deacetylase complex (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1999. — Vol. 96 , no. 1 . — P. 23—8 . — doi : . — . — PMC .
  • Yarden R.I., Brody L.C. BRCA1 interacts with components of the histone deacetylase complex (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1999. — Vol. 96 , no. 9 . — P. 4983—4988 . — doi : . — . — PMC .
  • Koipally J., Renold A., Kim J., Georgopoulos K. Repression by Ikaros and Aiolos is mediated through histone deacetylase complexes (англ.) // (англ.) ( : journal. — 1999. — Vol. 18 , no. 11 . — P. 3090—3100 . — doi : . — . — PMC .
  • Zhang Y., Ng H.H., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Bird A., Reinberg D. Analysis of the NuRD subunits reveals a histone deacetylase core complex and a connection with DNA methylation (англ.) // Genes Dev. : journal. — 1999. — Vol. 13 , no. 15 . — P. 1924—1935 . — doi : . — . — PMC .
  • Ng H.H., Zhang Y., Hendrich B., Johnson C.A., Turner B.M., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Reinberg D., Bird A. MBD2 is a transcriptional repressor belonging to the MeCP1 histone deacetylase complex (англ.) // Nat. Genet. : journal. — 1999. — Vol. 23 , no. 1 . — P. 58—61 . — doi : . — .
  • Wade P.A., Gegonne A., Jones P.L., Ballestar E., Aubry F., Wolffe A.P. Mi-2 complex couples DNA methylation to chromatin remodelling and histone deacetylation (англ.) // Nat. Genet. : journal. — 1999. — Vol. 23 , no. 1 . — P. 62—6 . — doi : . — .
  • Lai A., Lee J.M., Yang W.M., DeCaprio J.A., Kaelin W.G., Seto E., Branton P.E. RBP1 Recruits Both Histone Deacetylase-Dependent and -Independent Repression Activities to Retinoblastoma Family Proteins (англ.) // (англ.) ( : journal. — 2000. — Vol. 19 , no. 10 . — P. 6632—6641 . — . — PMC .
Источник —

ainsleigh
  • 2020-12-15
  • 1
  • Tags:

Same as Гистондеацетилаза 2

The title for the last searches