Interested Article - SMART (база данных)

SMART (Simple Modular Architecture Research Tool) — база данных, используемая при идентификации и анализе белковых доменов в белковых последовательностях . SMART использует для обнаружения доменов в белковых последовательностях алгоритм, основанный на применении скрытых марковских моделей ко множественным выравниваниям . По данным на январь 2012 года SMART содержала модели 1009 доменов . Данные SMART использовались при создании Базы Консервативных Доменов ( , Conserved Domain Database) и также представляются как часть базы данных .

База данных организована Европейской молекулярно-биологической лабораторией в Гейдельберге .

См. также

Ссылки

Примечания

Schultz J., Milpetz F., Bork P., Ponting C. P. SMART, a simple modular architecture research tool: identification of signaling domains (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1998. — May ( vol. 95 , no. 11 ). — P. 5857—5864 . — doi : . — . — PMC .
Letunic I., Doerks T., Bork P. SMART 6: recent updates and new developments (англ.) // (англ.) ( : journal. — 2009. — January ( vol. 37 , no. Database issue ). — P. D229—32 . — doi : . — . — PMC .
Letunic I., Doerks T., Bork P. SMART 7: recent updates to the protein domain annotation resource (англ.) // (англ.) ( : journal. — 2012. — January ( vol. 40 , no. Database issue ). — P. D302—5 . — doi : . — . — PMC .
Mulder N. J., Apweiler R., Attwood T. K., et al. InterPro: an integrated documentation resource for protein families, domains and functional sites (англ.) // Brief. Bioinformatics : journal. — 2002. — September ( vol. 3 , no. 3 ). — P. 225—235 . — doi : . — .