Interested Article - Коронавирусы (подсемейство)

Коро́навирусы ( лат. Orthocoronavirinae ) — подсемейство вирусов из семейства Coronaviridae , объединяющее оболочечные РНК -содержащие плеоморфные вирусы, вызывающие широкий спектр заболеваний различной тяжести у животных, включая человека . В большинстве случаев коронавирусные инфекции протекают в лёгкой форме, однако в XXI веке происходили вспышки тяжёлых заболеваний, вызываемых бетакоронавирусами MERS-CoV и SARS-CoV , а также SARS-CoV-2 . Это вирусы с (+)одноцепочечной РНК-геном и нуклеокапсидом спиральной симметрии. Размер генома коронавирусов варьируется от приблизительно 27 до 34 килобаз, самый большой среди известных РНК-вирусов.

Геном

Коронавирусы содержат геном с одноцепочечной смысловой РНК . Размер их генома колеблется от 27 до 34 килобаз является одним из самых больших среди РНК-вирусов. Геном имеет 5'-метилированный кэп и 3'-полиаденилированный хвост. Геномная организация коронавируса: 5'-НТО лидерная последовательность — репликаза / транскриптаза — шип (S) — оболочка (E) — нуклеокапсид (N) — 3’НТО — поли(A) хвост. Открытые рамки считывания 1a и 1b, которые занимают первые две трети генома, кодируют полипротеин репликазы / транскриптазы. Полипротеины репликазы / транскриптазы саморасщепляется, образуя неструктурные белки (nsps). Далее идут рамки считывания, кодирующие четыре основных структурных белка: шип, оболочку, мембрану и нуклеокапсид. Перемежаясь с этими рамками расположены рамки считывания для вспомогательных белков. Количество вспомогательных белков и их функция различны для разных коронавирусов.

Жизненный цикл

Зарождение

Инфекция начинается, когда вирусный шип (S) гликопротеин прикрепляется к своему комплементарному рецептору клетки-хозяина. После прикрепления протеаза клетки-хозяина расщепляется и активирует прикрепленный к рецептору спайковый белок. В зависимости от доступной протеазы клетки-хозяина, расщепление и активация позволяют клетке проникать посредством эндоцитоза или прямого слияния вирусной оболочки с мембраной хозяина. При проникновении в клетку-хозяина вирусная частица не имеет покрытия и ее геном попадает в цитоплазму клетки. Геном РНК коронавируса имеет 5'-метилированную кепку и 3'-полиаденилированный хвост, что позволяет РНК прикрепляться к рибосоме клетки-хозяина для трансляции. Рибосома хозяина транслирует исходную перекрывающуюся открытую рамку считывания генома вируса и образует длинный полипротеин. Полипротеин имеет свои собственные протеазы, которые расщепляют полипротеин на множество неструктурных белков.

Классификация

До 2009 года представителей подсемейства объединяли в род Coronavirus , но в 2009 году систематику коронавирусов пересмотрели: Coronavirus разделили на 3 рода ( Alphacoronavirus , Betacoronavirus , Gammacoronavirus ), объединённых в подсемейство Coronavirinae .

Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) по состоянию на апрель 2020 года выделяет в подсемействе 4 рода :

Род (14 подродов и 19 видов)
Род (5 подродов и 14 видов)
Род (3 подрода и 5 видов)
Род (3 подрода и 7 видов)

Примечания

Комментарии

Плеоморфные вирусы — вирусы, варьирующие по форме и размерам.

Источники

(англ.) на сайте Международного комитета по таксономии вирусов (ICTV) .
/ Горбаленя А. Е. // Конго — Крещение. — М. : Большая российская энциклопедия, 2010. — С. 352. — ( Большая российская энциклопедия : [в 35 т.] / гл. ред. Ю. С. Осипов ; 2004—2017, т. 15). — ISBN 978-5-85270-346-0 .
Щелканов М. Ю., Попова А. Ю., Дедков В. Г., Акимкин В. Г., Малеев В. В. (рус.) // Инфекция и иммунитет : научная статья. — 2020. — Т. 10 , № 2 . — С. 221—246 . 25 июня 2020 года.
↑ Zumla A., Chan J. F. W., Azhar E. I., Hui D. S. C., Yuen K.-Y. Coronaviruses — drug discovery and therapeutic options (англ.) // Nature Reviews Drug Discovery . — 2016. — Vol. 15 . — P. 327—347 . — doi : .
от 9 августа 2016 на Wayback Machine на сайте ICTV (англ.) (Дата обращения: 19 июля 2019) .
: [ англ. ] : [ 7 февраля 2019 ] // ICTV. — Code(s) assigned: 2008.085-126V. — 2008. — P. 3—6. — 37 p.
(англ.) на сайте Международного комитета по таксономии вирусов (ICTV) . (Дата обращения: 25 мая 2020) .