18-нитевой β-цилиндр. Бактериальный сахарозоспецифически йпорин из S. typhimurium. Он расположен в мембране и позволяет сахарозе диффундировать через нее. ( PDB )

8-нитевой β-цилиндр. Человеческий ретинол-связывающий белок, связанный с ретинолом (витамином А) в синем цвете.( PDB )

β-цилиндр — разновидность третичной структуры белков; β-складчатый слой , свернутый с образованием замкнутой структуры, в которой первая цепь водородными связями связана с последней. Как правило, β-цепи в β-цилиндрах расположены в антипараллельной ориентации. Чаще всего β-цилиндры формируют такие белки, как порины и другие пронизывающие мембраны белки, и белки, связывающие внутри цилиндра гидрофобные лиганды, такие как липокалины . Примерно 2-3 % генов в грамотрицательных бактериальных геномах кодируют бета-цилиндры .

Во многих случаях пряди содержат чередующиеся неполярные ( гидрофильные и гидрофобные ) аминокислоты, так что гидрофобные остатки ориентированы во внутреннюю часть цилиндра с образованием гидрофобного ядра, а полярные остатки ориентированы наружу цилиндра на открытой для растворителя поверхности. Порины и другие мембранные белки , содержащие бета-цилиндры, меняют эту картину, причем гидрофобные остатки ориентированы наружу, где они контактируют с окружающими липидами, а гидрофильные остатки ориентированы к водной внутренней поре.

Все бета-цилиндры можно классифицировать по двум целочисленным параметрам: число прядей в бета-листе, n , и «число сдвига», S , мера колебания цепей в бета-листе . Эти два параметра (n и S) связаны с углом наклона бета-нитей относительно оси ствола .

См. также

• Вторичная структура
• Мотив (молекулярная биология)
• А льфа-спираль
• Бета-лист
• Бета сэндвич

Примечания

Дальнейшее чтение

Это заготовка статьи по биохимии . Помогите Википедии, дополнив её.