Interested Article - Гаплогруппа DE

delana
  • 2020-12-31
  • 1

Гаплогруппа DE — человеческая Y-хромосомная гаплогруппа . Её определяют мутации однонуклеотидного полиморфизма M1(YAP), M145(P205), M203, P144, P153, P165, P167, P183 .

Она известна за счёт определяющего её полиморфизма уникального события — инсерции . Эта мутация произошла, когда участок ДНК Alu , копирующий себя, добавил копию в Y-хромосому. Так, Y-хромосомы, содержащие мутацию YAP, называют YAP+, а не содержащие — YAP-.

Появление

Происходит от мутации гаплогруппы CT , произошедшей у мужчины , жившего около 68,5 тыс. лет назад (дата определена по снипам компанией YFull ).

По одной версии, гаплогруппа DE и YAP+ появились в Африке . Это подтверждается тем, что:

  1. В Африке YAP имеет наибольшее распространение (более 80 %).
  2. DE содержит две подгруппы, которые не пересекаются филогенетически или географически.
  3. Гаплогруппа C появилась примерно в одно время с DE где-то в Азии, и нет никаких свидетельств, в том числе археологических, о миграциях народов из Азии в Африку в ту эпоху.

Более вероятно, что YAP+ родом из Азии. Это подтверждают следующие аргументы:

  1. Учитывая наличие YAP у носителей гаплогруппы D в северо-восточной Индии и на Андаманских островах , можно предположить, что в Южной Азии некоторые из хромосом M168 привели к добавлению YAP и мутации M174 .
  2. Гаплогруппа CT , от которой происходит DE, имеет неафриканское происхождение .
  3. Существуют свидетельства несколько более поздних перемещений хромосом из Азии в Африку. Большинство африканских линий E имеет явное европеоидное ближневосточное или североафриканское происхождение и их распространение в Африке среди негроидов объясняется эффектом основателя и замещением исконно негроидных линий A и B.

Однако не исключено формирование гаплогруппы в Северной или Восточной Африке.

В 2016 году Позник и Андерхилл показали, что Y-хромосомная гаплогруппа E возникла за пределами Африки, а общий предок всех неафриканских линий (TMRCA), в том числе гаплогрупп DE и CF , жил ~ 76 тыс. лет назад . Разделение гаплогруппы DE на субклады D и E произошло 69,0 ± 14,7 тыс. л. н., приход носителей гаплогруппы Е в Африку произошёл 65,5 ± 8,5 тыс. лет назад .

Крис Тайлер-Смит с коллегами считают, что линии DE и CF разошлись 77 тыс. л. н. (исходя из скорости мутации 0,76×10-9 на пару нуклеотидов в год) .

Этногеографическое распространение

До сих пор не было найдено ни одного живущего в настоящий момент представителя парагруппы DE. Найденные 5 образцов у нигерийцев оказались на самом деле редким субкладом гаплогруппы D2 (A5580.2) . То же самое относится к образцу из народа налу из Гвинеи-Бисау . У двух представителей на Тибете , оказался на самом деле субклад D-M174, а также у одного образца из Республики Алтай в Бешпельтире .

Дерево

Филогенетическое дерево YCC 2008 .

  • DE (YAP, M145 [P205], M203, P144, P153, P165, P167, P183)
    • DE*
    • D (M174, (021355))
    • E (SRY4064, M96, P29, P150, P152, P154, P155, P156, P162)

Примечания

  1. Karafet et al. (2008), от 7 июня 2008 на Wayback Machine , Genome Research, DOI: 10.1101/gr.7172008
  2. , Nature 505, 87–91 (02 January 2014)
  3. Underhill. The case for an African rather than an Asian origin of the human Y-chromosome YAP insertion // (англ.) . — 2001. — ISBN 9810247842 .
  4. ↑ Chandrasekar et al. (2007), от 7 ноября 2017 на Wayback Machine , 1: Ann Hum Biol. 2007 Sep-Oct;34(5):582-6.
  5. Дата обращения: 7 июля 2009. 20 мая 2011 года.
  6. . Дата обращения: 23 июля 2016. 18 августа 2016 года.
  7. Stone, Linda. // (неопр.) . — 2007.
  8. Chuan-Chao Wang , Li Hui . , bioRxiv posted online May 3, 2014
  9. Posnik G. D. et al. (2016) от 28 мая 2017 на Wayback Machine , Nature Genetics, 48, 593–599.
  10. Vicente M Cabrera et al. от 14 января 2018 на Wayback Machine , December 13, 2017
  11. Tyler-Smith, Chris; Xue, Yali; Thomas, Mark G.; Yang, Huanming; Arciero, Elena; Asan; Connell, Bruce A.; Jones, Abigail L.; Haber, Marc. (англ.) // Genetics : journal. — 2019. — 13 June. — P. genetics.302368.2019 . — ISSN . — doi : . — .
  12. Weale et al. (2003), от 5 мая 2009 на Wayback Machine , Genetics, Vol. 165, 229—234
  13. Rosa; et al. (2007), (PDF) , BMC Evolutionary Biology , 7 : 124, doi : {{ citation }} : Явное указание et al. в: |author= ( справка ) Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) ( ссылка ) . Дата обращения: 7 июля 2009. Архивировано 30 мая 2009 года.
  14. Shi et al. (2008) от 31 марта 2010 на Wayback Machine , BMC Biology
  15. Kharkov et al. (2007)
  16. Karafet et al. (2008), от 7 июня 2008 на Wayback Machine , Genome Research, DOI: 10.1101/gr.7172008
п • о • р Эволюционное древо гаплогрупп Y-хромосомы человека
Y-хромосомный Адам
A0-T
A00 A0 A1
A1a
A1b1 BT
B CT
DE CF
D E C F
F1  F2  F3
G
H IJK
IJ K
I J K2
L (K1a) T (K1b) K2a/K2a1/ NO /NO1
N O P (K2b2) /P1
S (K2b1a) M (K2b1b) Q R
Источник —

delana
  • 2020-12-31
  • 1
  • Tags:

Same as Гаплогруппа DE

The title for the last searches