Interested Article - Бета-вариант SARS-CoV-2

Страны с подтвержденными случаями заражения штаммом 501.V2 по состоянию на 29 декабря 2020 года

Бета-вариант коронавируса SARS-CoV-2 , также известный как линия 501.V2, 20C/501Y.V2 или B.1.351 (в прессе также встречаются названия «африканский штамм» или «южноафриканский штамм» ) — вариант вируса SARS-CoV-2 , вызывающего COVID-19 . Впервые обнаружен в округе Бухта Нельсона Манделы Восточно-Капской провинции ЮАР , о чём сообщило министерство здравоохранения ЮАР 18 декабря 2020 года .

Характеристика

Cодержит несколько мутаций, которые позволяют ему легче прикрепляться к клеткам человека из-за трех мутаций в рецептор-связывающем домене (RBD) в спайковом гликопротеине вируса: N501Y (аминокислота аспарагин (N) заменена на аминокислоту тирозин (Y) в позиции 501), K417N и E484K. Две из этих мутаций (E484K и N501Y) находятся в рецептор-связывающем мотиве (RBM) рецептор-связывающего домена (RBD).

Мутация N501Y также была обнаружена в штамме 202012/01 , широко распространившимся в Великобритании. Две другие мутации, обнаруженные в 501.V2 — E484K и K417N, в британском штамме отсутствуют. Кроме того, 501.V2 не имеет мутации 69-70del, обнаруженной в другом штамме.

Обнаружение

Новый штамм был обнаружен путем секвенирования полного генома. Несколько геномных последовательностей из этой линии были отправлены в базу данных генетических последовательностей GISAID, например, последовательность EPI_ISL_678597.

Международное распространение

23 декабря Мэтт Хэнкок объявил, что два человека, которые приехали из Южной Африки в Великобританию, были инфицированы 501.V2. 28 декабря этот штамм был обнаружен у двух человек в Швейцарии и у одного человека в Финляндии. 29 декабря штамм был обнаружен у путешественника, приехавшего из Южной Африки в Японию, и у одного международного путешественника в Квинсленде, Австралия. 30 декабря штамм был обнаружен в Замбии. 31 декабря он был также обнаружен во Франции у пассажира, возвращавшегося из Южной Африки. 2 января 2021 года первый случай заражения этим штаммом был выявлен в Южной Корее. Австрия сообщила о своем первом случае заражения этим штаммом, а также о четырёх случаях заражения британским штаммом 4 января. 8 января 2021 года Ирландия сообщила об обнаружении 3 случаев заболевания этим штаммом, все из которых были связаны с поездками из Южной Африки.

В России данный штамм впервые был выявлен в марте 2021 года .

Нечувствительность к вакцинам

4 января 2021 года газета The Telegraph сообщила, что оксфордский иммунолог сэр Джон Белл считает, что новый южноафриканский штамм вызывает «большой вопрос», поскольку он может быть устойчивым к вакцинам, тем самым разрушая надежды и заменяя их страхом . В тот же день профессор вакцинологии Шабир Мадхи заявил CBS News, что нет уверенности в том, что новый штамм 501.V2 сможет «обойти» защиту вакциной, но он полагает, что она «может быть менее эффективна» . Дополнительные мутации в белке-шипе в штамме 501.V2 были названы доцентом кафедры клеточной микробиологии Университета Рединга Саймоном Кларком как вызывающий беспокойство фактор, поскольку они «могут сделать вирус менее восприимчивым к иммунному ответу, вызванному вакциной». Лоуренс Янг, вирусолог из Уорикского университета, также отметил, что множественные спайковые мутации этого штамма «могут привести к некоторому уходу от иммунной защиты» .

Некоторые исследования показывают ускользание этого штамма от нейтрализующего многоклонального антитела, нацеленного на спайк-белок SARS-CoV-2 .

Угур Сахин, исполнительный директор BioNTech , заявил, что необходимы дальнейшие исследования, чтобы убедиться, что нынешняя вакцина производства этой компании работает против штамма 501.V2, однако, если вакцину будет необходимо скорректировать, компания может сделать это примерно за 6 недель .

8 января Guardian сообщила, что вакцина Pfizer и BioNTech от COVID-19 показала в тестах, включающих 20 анализов крови, что она способна обеспечивать защиту от штамма 501.V2. Необходимы дальнейшие исследования, чтобы установить точную степень защиты .

Компания Модерна планирует протестировать новую версию своей вакцины , специально модифицированную для защиты от штамма 501.V2 , аналогичные меры предпринимает компания Novavax . По данным клинического исследования вакцины Ad26.COV2.S компании Johnson & Johnson, её эффективность на юге Африки на 15 % ниже, чем в США (57 % и 72 % соответственно); разница, вероятно, связана с распространенностью штамма 501.V2 в ЮАР . Ещё одно исследование вакцины ( NVX-CoV2373 производства Novavax) показало эффективность в 60 % (для ВИЧ-негативных участников) в Южной Африке по сравнению с эффективностью 90 % в Великобритании. По данным Reuters, вакцина Pfizer лишь немного менее эффективна против 501.V2 . Компания AstraZeneca планирует адаптировать свою вакцину к данному штамму, новая вакцина должна быть готова к осени 2021 .

24 февраля 2021 года компания Модерна объявила о начале клинических исследований новой версии своей вакцины. Новая версия разработана специально для борьбы с 501.V2 .

Мутация E484K

Сообщается, что изменение аминокислоты E484K, мутация рецептор-связывающего домена (RBD), «связана с ускользанием от нейтрализующих антител», что может отрицательно повлиять на эффективность вакцин против COVID, нацеленных на спайк-белок . Спайковая мутация E484K была связана со случаем повторного заражения штаммом 501.V2 SARS-CoV-2 в Бразилии, что, по мнению исследователей, было первым подобным случаем повторного заражения штаммом, содержащим данную мутацию .

Статистика

Случаи по странам (по состоянию на 9 января 2021)
Страна Подтвержденных случаев Дата Источники
Великобритания 2 23 декабря 2020
Швейцария 2 28 декабря 2020
Финляндия 1 28 декабря 2020
Япония 1 29 декабря 2020
Австралия 1 29 декабря 2020
Замбия 1 30 декабря 2020
Франция 1 31 декабря 2020
Южная Корея 1 2 января 2021
Австрия 1 4 января 2021
Ирландия 3 8 января 2021
Канада 1 8 января 2021
В мире (11 других стран) 15

См. также

Примечания

  1. . — «Варианты коронавируса COVID-19 станут обозначать буквами греческого алфавита, чтобы не дискриминировать страны, где эти штаммы обнаружили впервые, и для удобства произношения в ненаучном разговоре, сообщила Всемирная организация здравоохранения (ВОЗ). В соответствии с новой системой, "британский" штамм коронавируса B.1.1.7 получит название "Альфа", вариант B.1.351, впервые обнаруженный в ЮАР, станет "Бетой", а бразильский P.1 - "Гаммой". Два подвида "индийского" штамма коронавируса - B.1.617.2 и B.1.617.1 - назовут "Дельтой" и "Каппой" соответственно.» Дата обращения: 28 июня 2021. 28 июня 2021 года.
  2. CDC. (амер. англ.) . Centers for Disease Control and Prevention (11 февраля 2020). Дата обращения: 9 января 2021. 15 мая 2021 года.
  3. . www.mk.ru . Дата обращения: 9 января 2021. 11 января 2021 года.
  4. . lenta.ru . Дата обращения: 9 января 2021. 4 января 2021 года.
  5. (англ.) . www.iol.co.za . Дата обращения: 9 января 2021. 26 мая 2021 года.
  6. . BBC News . 2020-12-28. из оригинала 11 февраля 2021 . Дата обращения: 9 января 2021 .
  7. Fink, Sheri (2020-12-18). . The New York Times . из оригинала 21 декабря 2020 . Дата обращения: 9 января 2021 .
  8. . Дата обращения: 2 сентября 2022. 2 сентября 2022 года.
  9. Knapton, Sarah (2021-01-04). . The Telegraph . из оригинала 15 декабря 2021 . Дата обращения: 5 января 2021 .
  10. (амер. англ.) . www.cbsnews.com . Дата обращения: 5 января 2021. 3 декабря 2021 года.
  11. . CBC . из оригинала 5 января 2021 . Дата обращения: 5 января 2021 .
  12. Yiska Weisblum, Fabian Schmidt, Fengwen Zhang, Justin DaSilva, Daniel Poston. // eLife. — Т. 9 . — ISSN . — doi : . 3 января 2021 года.
  13. . Дата обращения: 24 января 2021. 15 января 2021 года.
  14. (англ.) . euronews (22 декабря 2020). Дата обращения: 5 января 2021. 8 января 2021 года.
  15. Geddes, Linda (2021-01-08). . The Guardian . из оригинала 8 января 2021 . Дата обращения: 9 января 2021 .
  16. Grady, Denise (2021-01-25). . The New York Times . из оригинала 25 января 2021 . Дата обращения: 25 января 2021 .
  17. (англ.) . ir.novavax.com . Дата обращения: 30 января 2021. 6 июня 2021 года.
  18. . РБК . Дата обращения: 29 января 2021. 29 января 2021 года.
  19. . Bloomberg.com . 2021-01-28. из оригинала 29 января 2021 . Дата обращения: 29 января 2021 .
  20. Geddes, Linda (2021-01-08). . The Guardian . из оригинала 8 января 2021 . Дата обращения: 1 февраля 2021 .
  21. . РБК . Дата обращения: 12 февраля 2021. 13 февраля 2021 года.
  22. . Дата обращения: 26 февраля 2021. 27 февраля 2021 года.
  23. Berkeley Lovelace Jr. (англ.) . CNBC (24 февраля 2021). Дата обращения: 26 февраля 2021. 25 февраля 2021 года.
  24. (англ.) . France 24 (13 января 2021). Дата обращения: 24 января 2021. 31 августа 2021 года.
  25. Ewen Callaway. (англ.) // Nature. — 2021-01-07. — Vol. 589 , iss. 7841 . — P. 177–178 . — doi : . 20 декабря 2021 года.
  26. Brito, Ricardo (2021-01-09). . Reuters . из оригинала 28 января 2021 . Дата обращения: 24 января 2021 .
  27. . . Дата обращения: 23 декабря 2020. 23 декабря 2020 года.
  28. . BusinessInsider . Дата обращения: 29 декабря 2020. 19 ноября 2021 года.
  29. . Yle News . Дата обращения: 29 декабря 2020. 31 октября 2021 года.
  30. (амер. англ.) . News24 . Дата обращения: 29 декабря 2020. 19 ноября 2021 года.
  31. . 9 News (29 декабря 2020). Дата обращения: 9 января 2021. 19 ноября 2021 года.
  32. . Luksaka Times (англ.) . 2020-12-30. из оригинала 7 января 2021 . Дата обращения: 8 января 2021 . {{ cite news }} : Указан более чем один параметр |accessdate= and |access-date= ( справка )
  33. . France 24 . France. 2020-12-31. из оригинала 19 ноября 2021 . Дата обращения: 8 января 2021 . {{ cite news }} : Указан более чем один параметр |accessdate= and |access-date= ( справка )
  34. [South Africa's 'mutant corona' first confirmed in Korea... 4 additional variations from UK] (кор.) . Donga Ilbo. 2021-01-02. из оригинала 19 ноября 2021 . Дата обращения: 13 июня 2021 .
  35. Ellyatt, Holly (2021-01-06). . CNBC . из оригинала 7 января 2021 . Дата обращения: 8 января 2021 . {{ cite news }} : Указан более чем один параметр |accessdate= and |access-date= ( справка )
  36. . . (8 января 2021). Дата обращения: 8 января 2021. 7 декабря 2021 года.
  37. . CBC News (8 января 2021). Дата обращения: 9 января 2021. 9 января 2021 года.

Ссылки

Источник —

Same as Бета-вариант SARS-CoV-2