Interested Article - Факторы транскрипции

megan
  • 2020-07-29
  • 1

Факторы транскрипции (транскрипционные факторы) — белки́ , контролирующие процесс синтеза мРНК , а также других видов РНК на матрице ДНК ( транскрипцию ) путём связывания со специфичными участками ДНК . Транскрипционные факторы выполняют свою функцию либо самостоятельно, либо в комплексе с другими белками. Они обеспечивают снижение ( репрессоры ) или повышение ( активаторы ) константы связывания РНК-полимеразы с регуляторными последовательностями регулируемого гена .

Определяющая черта факторов транскрипции — наличие в их составе одного или более ДНК-связывающих доменов , которые взаимодействуют с характерными участками ДНК, расположенными в регуляторных областях генов. Другие белки, играющие ключевую роль в регуляции экспрессии генов , такие как коактиваторы , гистонацетилазы , киназы , метилазы , не имеют ДНК-связывающих доменов, и, следовательно, не могут быть причислены к транскрипционным факторам .

Структура комплекса TATA-связывающего белка/транскрипционного фактора TF(II)B из археи Pyrococcus woesei с ДНК по результатам рентгеноструктурного анализа . Сверху — схематичное изображение третичной структуры , снизу — молекулярной поверхности комплекса

Консервативность у различных организмов

Факторы транскрипции необходимы для регуляции экспрессии генов и обнаружены у всех живых организмов. Их количество, как абсолютное, так и удельное, возрастает с ростом размера генома .

В геноме человека обнаружено более 2600 белков, имеющих ДНК-связывающий домен, и большинство из них предположительно являются факторами транскрипции . Следовательно, около 10 % всех генов в геноме кодируют транскрипционные факторы. Таким образом, они являются самым большим семейством белков человека . Более того, активность многих генов регулируется корпоративным взаимодействием большого числа различных факторов транскрипции, что позволяет обеспечить каждому из генов уникальный способ регуляции в процессе развития организма .

Функции

Факторы транскрипции — одна из групп белков, обеспечивающих прочтение и интерпретацию генетической информации. Они связывают ДНК и способствуют инициации программы повышения или понижения транскрипции гена. Таким образом, они жизненно необходимы для нормального функционирования организма на всех уровнях. Ниже перечислены важнейшие из процессов, в которые вовлечены факторы транскрипции.

Регуляция базальной экспрессии генов

Фоновая транскрипционная активность обеспечивается набором ТФ, общим для всех генов. Важный класс эукариотических факторов транскрипции — GTFs (general transcription factors) . Многие из его представителей не связывают ДНК непосредственно, а входят в состав комплекса инициации транскрипции (преинициирующего комплекса), который напрямую взаимодействует с РНК-полимеразой. Наиболее распространенными GTF являются , , (связываются с т. н. ТАТА-боксом (элементом промотора )), , , и .

Помимо ТФ, необходимых для экспрессии всех генов, существуют также специфичные факторы транскрипции, обеспечивающие включение/выключение определённых генов в нужный момент.

Регуляция онтогенеза

Многие ТФ многоклеточных организмов вовлечены в обеспечение их развития . Действуя в соответствии с генетической программой и/или в ответ на внешние воздействия, они инициируют или подавляют транскрипцию определённых генов, что влечет за собой изменения в клеточной морфологии, клеточную дифференциацию, морфогенез , органогенез и т. д. Например, семейство гомеобоксных ТФ критично для формирования правильной морфологии тела у организмов от дрозофилы до человека . Мутации генов этих белков ( гомеозисные мутации ) у дрозофил приводят к серьёзным нарушениям в дифференцировке сегментов тела данных насекомых (например, развитие ног вместо усиков).

Другой пример данной группы ТФ — продукт гена полопределяющего региона Y (SRY, Sex-determining Region Y), который играет важную роль в детерминации пола человека.

Ответ на внеклеточные сигналы

Согласованная регуляция взаимодействия клеток многоклеточного организма осуществляется путём высвобождения специальных молекул ( гормонов , цитокинов и т. п.), которые вызывают сигнальный каскад в клетках-мишенях. В случае, если сигнал вызывает изменение уровня экспрессии определённых генов, конечным звеном каскада часто оказываются ТФ . Эстрогеновый сигнальный путь — пример короткого каскада, включающего транскрипционный фактор рецептора эстрогена: эстроген секретируется тканями плаценты и яичника, преодолевает плазматическую мембрану реципиентных клеток, и связывается со своим рецептором в цитоплазме. Рецептор эстрогена проникает в ядро и связывает специфичный участок ДНК, изменяя регуляции транскрипции соответствующего гена .

Ответ на изменение окружающей среды

ТФ — не единственные конечные звенья сигнальных каскадов, возникающих в ответ на различные внешние стимулы, но они тоже могут быть эффекторами в сигнальных каскадах, индуцируемых воздействием окружающей среды. Например, фактор теплового шока (HSF) активирует гены белков теплового шока , которые обеспечивают выживание при повышении температуры (например, шапероны ) , фактор, индуцируемый гипоксией (HIF) — при снижении концентрации кислорода ; белок SREBP (sterol regulatory element binding protein) помогает поддерживать необходимое содержание липидов в клетках .

Контроль клеточного цикла

Многие ТФ, особенно онкогены и онкосупрессоры, участвуют в регуляции клеточного цикла . Они определяют переход от одной фазы клеточного цикла к другой, частоту делений и интенсивность роста. Один из наиболее известных подобных ТФ — онкоген Myc , играющий важную роль в росте клеток и направлении их в апоптоз .

Регуляция

Все общебиологические процессы имеют многоуровневую регуляцию и контроль. Это верно и для ТФ — ТФ не только обеспечивают регуляцию уровня накопления белков и РНК в клетке, но и регулируют активность собственных генов (часто с помощью других ТФ). Ниже кратко описаны основные способы регуляции активности ТФ.

Общие для всех белков

Уровень накопления ТФ в клетке регулируется по той же схеме, что и у других белков за счет контроля транскрипции, деградации мРНК, трансляции , постпроцессинга белка, его внутриклеточной локализации и деградации. Возможна саморегуляция по принципу отрицательной обратной связи — ТФ репрессирует активность кодирующего его гена.

Внутриядерная локализация

У эукариотических организмов процессы транскрипции и трансляции пространственно разделены — они происходят в ядре и цитоплазме соответственно. После синтеза ТФ должны проникнуть в ядро, преодолев двойную мембрану. Многие белки, функционирующие в ядре, имеют сигнал ядерной локализации — специфичный участок полипептидной цепи, адресующий белок в ядро. Для многих ТФ транслокация является ключевым фактором в регуляции их активности . Важные классы ТФ, такие как некоторые ядерные рецепторы, должны сперва связать эндогенный лиганд - агонист в цитоплазме и только потом транспортироваться в ядро .

Активация

ТФ могут быть активированы/деактивированны путём воздействия на их сигнал-чувствительный домен различным образом:

  • связывание лиганда — необходимой для функционирования субстанции, не входящий в состав полипептида (например, ионов Zn 2+ )
  • фосфорилирование — многие ТФ должны быть фосфорилированы для получения возможности связывать ДНК.
  • взаимодействие с другими ТФ и/или корегуляторными белками.

Доступность сайта связывания ДНК

У эукариот гены, не транскрибируемые постоянно, часто находятся в гетерохроматине (участках ДНК, плотно упакованных за счет связывания гистонов и организованных в компактные хроматиновые фибриллы). ДНК в составе гетерохроматина недоступна для многих факторов транскрипции. Для того, чтобы ТФ могли связаться с ДНК, гетерохроматин должен быть трансформирован в эухроматин , обычно путём модификаций гистонов. Также для связывания ТФ с ДНК важную роль играет свобода хроматина от нуклеосом . Хроматин свободный от нуклеосом называется открытым хроматином и значительно чаще связывает факторы транскрипции, чем связанный с нуклеосомами хроматин. Перераспределение нуклеосом осуществляют факторы ремоделирования хроматина . Сайт связывания ТФ на ДНК может быть недоступным и в случае, если он связан другим фактором транскрипции. Пары факторов транскрипции могут играть антагонистическую роль (активатор — репрессор) при регуляции активности одного гена.

Наличие других кофакторов/транскрипционных факторов

Большинство ТФ не работают в одиночку. Часто для активации транскрипции гена с его регуляторными элементами должно связаться большое количество ТФ. Связывании ТФ вызывает привлечение промежуточных белков, таких как кофакторы, что приводит к сборке преинициационного комплекса и посадке на промотор РНК-полимеразы.

Структура

ТФ являются модульными по структуре и содержат следующие домены :

  • ДНК-связывающий домен (DBD) — взаимодействует со специфичными последовательностями ДНК, характерными для промоторов и энхансеров . Специфичность распознавания определённых последовательностей определяет набор генов, подверженных регуляции данным ТФ;
  • трансактивирующий домен (TAD) — содержит участки связывания других белков, например, транскрипционных корегуляторов ;
  • сигналраспознающий домен (SSD) (например, лиганд-связывающий домен), который чувствителен к внешнем сигналам и отвечающим за передачу сигнала к другим компонентам транскрипционного комплекса, что вызывает повышение или понижение уровня экспрессии.

ДНК-связывающий домен

Структурно-функциональная единица (домен) факторов транскрипции, связывающая ДНК, называется ДНК-связывающим доменом. Ниже приведен список важнейших семейств ДНК-связывающих доменов/ТФ:

Семейство
Спираль-петля-спираль (helix-loop-helix) 47460 IPR001092
Лейциновая молния 57959 IPR004827
C-концевые эффекторные домены составных регуляторов ответа 46894 IPR001789
GCC box 54175
Спираль-поворот-спираль (helix-turn-helix)
Гомеодоменные белки — связывают гомеобокс (особый участок ДНК). Играют критическую роль в индивидуальном развитии организмов ( онтогенезе ). 46689 IPR009057
Подобные репрессору фага лямбда 47413 IPR010982
srf-подобные 55455 IPR002100
Парный бокс
winged helix 46785 IPR011991
Цинковые пальцы
* многодоменные цинковые пальцы типа Cys 2 His 2 57667 IPR007087
* Zn 2 /Cys 6 57701
* цинковые пальцы типа Zn 2 /Cys 8 ядерных рецепторов гормонов 57716 IPR001628

Сайты связывания ТФ

Участки ДНК, которые взаимодействуют с факторами транскрипции, называются сайтами связывания ТФ. Взаимодействие осуществляется за счет электростатических сил , водородных связей и сил Ван-дер-Ваальса . За счет корпоративного, стерически детерминированного действия данных сил, которое определяется пространственной структурой белковой молекулы, ТФ связываться только с определёнными участками ДНК. Не все нуклеотидные основания в ДНК, входящие в сайт связывания ТФ, имеют одинаковую значимость при взаимодействии с белком. Вследствие этого, ТФ обычно связывают не участок со строго определённой первичной структурой, а группу структур с близким сходством, каждую — с разной степенью сродства. Например, хотя консенсусной последовательностью сайта связывания ТАТА-связывающих белков является ТАТАААА, они могут взаимодействовать также с ТАТАТАТ и ТАТАТАА.

Вследствие того, что ТФ взаимодействуют с короткими участками ДНК гетерогенной структуры, потенциальные сайты связывания ТФ могут возникать случайно в достаточно протяженной молекуле ДНК. Маловероятно, однако, что ТФ взаимодействуют со всеми подходящими элементами в геноме.

Различные ограничения, такие как доступность сайтов и наличие кофакторов, могут способствовать направлению ТФ в нужные участки ДНК. Таким образом, затруднительно на основании последовательности генома достоверно предсказать реальное место посадки ТФ на ДНК in vivo . Дополнительная специфичность ТФ может опосредоваться наличием нескольких ДНК связывающих доменов в составе одного белка, которые взаимодействуют с двумя или более смежными последовательностями одновременно.

Клинические аспекты

В связи с ключевой ролью ТФ в процессе реализации наследственной информации, некоторые заболевания человека могут быть вызваны мутациями в генах ТФ. Ниже приведены некоторые наиболее изученные нарушения подобного рода:

  • Синдром Ретта . Мутации в гене ТФ ассоциированы с синдромом Ретта, нарушением в развитии нервной системы .
  • Диабеты . Редкая форма диабета , называемая MODY (Maturity onset diabetes of the young) может быть обусловлена мутациями в генах некоторых ТФ .
  • Developmental verbal dyspraxia . (нарушение речевых функций). Мутации в гене ТФ FOXP2 ассоциированы с развитием данного заболевания, при котором человек не может производить координированных движений, необходимых для речевой функции .
  • Аутоиммунные заболевания . Мутации в гене ТФ FOXP3 связаны с аутоиммунным заболеванием IPEX (immune dysregulation polyendocrinopathy enteropathy X-linked syndrome) .
  • Рак . Многие факторы транскрипции являются онкогенами или онкосупрессорами, и их мутации или неправильная регуляция могут приводить к развитию рака. Например, синдром Li-Fraumeni обусловлен мутациями в гене онкосупрессора p53 .

Классификация

ТФ могут классифицироваться по (1) механизму действия, (2) регуляторной функции, (3) структуре ДНК-связывающего домена, а также на натуральные и (5)искусственные.

Механизм действия

По данному признаку выделяют три класса ТФ:

  • Главные факторы транскрипции (GTFs) , вовлеченные в образование инициационного комплекса. Наиболее важные из них — TFIIA, TFIIB, TFIID, TFIIE, TFIIF, и TFIIH. Они присутствуют во всех клетках и взаимодействуют с кором промотора генов, транскрибируемых РНК-полимеразой второго класса.
  • ТФ, взаимодействующие с upstream-участками ДНК , (областями, расположенными до промотора, лежащими относительно него с другой стороны от кодирующей области гена ).
  • Индуцируемые ТФ сходны с предыдущим классом, но требуют активации либо ингибирования.

Функция

  1. Конститутивные — присутствуют всегда во всех клетках — главные факторы транскрипции, Sp1 , NF1 , .
  2. Активируемые (активны в определённых условиях)
    1. Участвующие в развитии организма (клетко-специфичные) — экспрессия строго контролируется, но, начав экспрессироваться, не требуют дополнительной активации — GATA, HNF, PIT-1, MyoD, Myf5, Hox, Winged Helix.
    2. Сигнал-зависимые — требуют внешнего сигнала для активации
      1. внеклеточные сигнал-зависимые — ядерные рецепторы
      2. внутриклеточные сигнал-зависимые — активируются низкомолекулярными внутриклеточными соединениями — , p53 , одиночные ядерные рецепторы
      3. мембраносвязанные рецептор-зависимые — фосфорилируются киназами сигнального каскада
        1. резидентные ядерные факторы — находятся в ядре независимо от активации — CREB, AP-1, Mef2
        2. латентные цитоплазматические факторы — в неактивном состоянии локализованы в цитоплазме, после активации транспортируются в ядро — STAT, R-SMAD, NF-kB , Notch , TUBBY, NFAT.

Структурная классификация

ДНК-связывающий домен типа « лейциновая молния » в комплексе с ДНК. Вверху — схематичное изображение молекулярной поверхности, внизу — третичной структуры комплекса.
ДНК-связывающий домен типа « спираль-петля-спираль » в комплексе с ДНК. Вверху — схематичное изображение третичной структуры, внизу — молекулярной поверхности комплекса.

Факторы транскрипции классифицируют на основании сходства первичной структуры (что предполагает и сходство третичной структуры) ДНК-связывающих доменов .

  • 1 Надкласс: Basic Domains ( Basic-helix-loop-helix )
    • 1.1 Класс: Лейциновая молния ( )
      • 1.1.1 Семейство: (-like) components; includes ( / )
      • 1.1.2 Семейство: CREB
      • 1.1.3 Семейство: -like factors
      • 1.1.4 Семейство: bZIP /
      • 1.1.5 Семейство: Plant G-box binding factors
      • 1.1.6 Семейство: ZIP only
    • 1.2 Класс: Спираль-петля-спираль ( bHLH )
      • 1.2.1 Семейство: Ubiquitous (Класс A) factors
      • 1.2.2 Семейство: Myogenic transcription factors ( )
      • 1.2.3 Семейство: Achaete-Scute
      • 1.2.4 Семейство: Tal/Twist/Atonal/Hen
    • 1.3 Класс: Спираль-петля-спираль / лейциновая молния factors ( )
      • 1.3.1 Семейство: Ubiquitous bHLH-ZIP factors; includes USF ( USF1 , ); SREBP ( )
      • 1.3.2 Семейство: Cell-cycle controlling factors; includes c-Myc
    • 1.4 Класс: NF-1
      • 1.4.1 Семейство: NF-1 ( )
    • 1.5 Класс: RF-X
      • 1.5.1 Семейство: RF-X ( , , )
    • 1.6 Класс: bHSH
  • 2 Надкласс: Zinc-coordinating DNA-binding domains
    • 2.1 Класс: Cys4 zinc finger of type
      • 2.1.1 Семейство:
      • 2.1.2 Семейство: -like factors
    • 2.2 Класс: diverse Cys4 zinc fingers
      • 2.2.1 Семейство:
    • 2.3 Класс: Cys2His2 zinc finger domain
      • 2.3.1 Семейство: Ubiquitous factors, includes , Sp1
      • 2.3.2 Семейство: Developmental / cell cycle regulators; includes
      • 2.3.4 Семейство: Large factors with NF-6B-like binding properties
    • 2.4 Класс: Cys6 cysteine-zinc cluster
    • 2.5 Класс: Zinc fingers of alternating composition
  • 3 Надкласс: Спираль-поворот-спираль
    • 3.1 Класс: Гомеодомен
      • 3.1.1 Семейство: Homeo domain only; includes
      • 3.1.2 Семейство: factors; includes
      • 3.1.3 Семейство: Homeo domain with LIM region
      • 3.1.4 Семейство: homeo domain plus zinc finger motifs
    • 3.2 Класс: Paired box
      • 3.2.1 Семейство: Paired plus homeo domain
      • 3.2.2 Семейство: Paired domain only
    • 3.3 Класс: /
      • 3.3.1 Семейство: Developmental regulators; includes
      • 3.3.2 Семейство: Tissue-specific regulators
      • 3.3.3 Семейство: Cell-cycle controlling factors
      • 3.3.0 Семейство: Other regulators
    • 3.4 Класс:
      • 3.4.1 Семейство: HSF
    • 3.5 Класс: Tryptophan clusters
      • 3.5.1 Семейство: Myb
      • 3.5.2 Семейство: Ets-type
      • 3.5.3 Семейство:
    • 3.6 Класс: TEA (transcriptional enhancer factor) domain
      • 3.6.1 Семейство: TEA ( , , , )
  • 4 Надкласс: beta-Scaffold Factors with Minor Groove Contacts
    • 4.1 Класс: RHR (Rel homology region)
      • 4.1.1 Семейство: Rel/ ; NF-kappaB
      • 4.1.2 Семейство: ankyrin only
      • 4.1.3 Семейство: NF-AT ( N uclear F actor of A ctivated T -cells) ( , , )
    • 4.2 Класс: STAT
      • 4.2.1 Семейство:
    • 4.3 Класс: p53
      • 4.3.1 Семейство: p53
    • 4.4 Класс: MADS box
      • 4.4.1 Семейство: Regulators of differentiation; includes ( )
        • 4.4.2 Семейство: Responders to external signals, SRF ( ) ( )
    • 4.5 Класс: beta-Barrel alpha-helix transcription factors
    • 4.6 Класс:
      • 4.6.1 Семейство: TBP
      • 4.7.1 Семейство: , SRY
      • 4.7.2 Семейство: TCF-1 ( )
      • 4.7.3 Семейство: HMG2-related,
      • 4.7.5 Семейство: MATA
    • 4.8 Класс: Heteromeric CCAAT factors
      • 4.8.1 Семейство: Heteromeric CCAAT factors
    • 4.9 Класс: Grainyhead
      • 4.9.1 Семейство: Grainyhead
    • 4.10 Класс: Cold-shock domain factors
      • 4.10.1 Семейство: csd
    • 4.11 Класс: Runt
      • 4.11.1 Семейство: Runt
  • 0 Надкласс: Другие факторы транскрипции
    • 0.1 Класс: Copper fist proteins
    • 0.2 Класс: HMGI(Y) ( )
      • 0.2.1 Семейство: HMGI(Y)
    • 0.3 Класс: Pocket domain
    • 0.4 Класс: E1A-like factors
    • 0.5 Класс: AP2/EREBP-related factors
      • 0.5.1 Семейство:
      • 0.5.2 Семейство: EREBP
      • 0.5.3 Надсемейство:
        • 0.5.3.1 Семейство: ARF
        • 0.5.3.2 Семейство: ABI
        • 0.5.3.3 Семейство: RAV

Искусственные факторы транскрипции

Систему CRISPR можно адаптировать так, чтобы она действовала как транскрипционный фактор (crisprTF). Для этого CRISPR-ассоциированный белок, известный как Cas9 , изменяют так, чтобы он после связывания с ДНК больше не мог её расщепить. Затем к нему добавляют сегмент, который активирует или подавляет экспрессию генов путём модуляции транскрипционного механизма клетки . В отличие от транскрипционных факторов на базе цинковых пальцев и , для узнавания ДНК системе CRISPR-Cas требуется только создание соответствующей последовательности РНК-«гида», а не создание новых белковых доменов фермента, что делает его гораздо более доступным благодаря дешевизне и простоте (вплоть до того что разработан набор правил — «грамматика» — описывающих, как спроектировать синтетический транскрипционный фактор (STFS) и программа для его автоматизированного проектирования ).

См. также

Примечания

  1. . Дата обращения: 1 июля 2020. 4 июля 2020 года.
  2. ↑ Latchman D.S. Transcription factors: an overview (англ.) // (англ.) ( : journal. — 1997. — Vol. 29 , no. 12 . — P. 1305—1312 . — doi : . — .
  3. Karin M. Too many transcription factors: positive and negative interactions (англ.) // New Biol. : journal. — 1990. — Vol. 2 , no. 2 . — P. 126—131 . — .
  4. Roeder R.G. The role of general initiation factors in transcription by RNA polymerase II (англ.) // (англ.) ( : journal. — 1996. — Vol. 21 , no. 9 . — P. 327—335 . — doi : . — .
  5. Nikolov D.B., Burley S.K. RNA polymerase II transcription initiation: a structural view (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1997. — Vol. 94 , no. 1 . — P. 15—22 . — doi : . — .
  6. Lee T.I., Young R.A. Transcription of eukaryotic protein-coding genes (англ.) // Annu. Rev. Genet. : journal. — 2000. — Vol. 34 . — P. 77—137 . — doi : . — .
  7. Mitchell P.J., Tjian R. Transcriptional regulation in mammalian cells by sequence-specific DNA binding proteins (англ.) // Science : journal. — 1989. — Vol. 245 , no. 4916 . — P. 371—378 . — doi : . — .
  8. Ptashne M., Gann A. Transcriptional activation by recruitment (англ.) // Nature. — 1997. — Vol. 386 , no. 6625 . — P. 569—577 . — doi : . — .
  9. ↑ Brivanlou A.H., Darnell J.E. Signal transduction and the control of gene expression (англ.) // Science : journal. — 2002. — Vol. 295 , no. 5556 . — P. 813—818 . — doi : . — .
  10. van Nimwegen E. Scaling laws in the functional content of genomes (англ.) // (англ.) ( : journal. — 2003. — Vol. 19 , no. 9 . — P. 479—484 . — doi : . — .
  11. Babu M.M., Luscombe N.M., Aravind L., Gerstein M., Teichmann S.A. Structure and evolution of transcriptional regulatory networks (англ.) // Curr. Opin. Struct. Biol. : journal. — 2004. — Vol. 14 , no. 3 . — P. 283—291 . — doi : . — .
  12. Lambert S. A. , Jolma A. , Campitelli L. F. , Das P. K. , Yin Y. , Albu M. , Chen X. , Taipale J. , Hughes T. R. , Weirauch M. T. (англ.) // Cell. — 2018. — 8 February ( vol. 172 , no. 4 ). — P. 650—665 . — doi : . — . [ ]
  13. Reese J.C. Basal transcription factors (неопр.) // Current opinion in genetics & development. — 2003. — April ( т. 13 , № 2 ). — С. 114—118 . — doi : . — .
  14. Shilatifard A., Conaway R.C., Conaway J.W. The RNA polymerase II elongation complex (англ.) // (англ.) ( : journal. — 2003. — Vol. 72 . — P. 693—715 . — doi : . — .
  15. Thomas M.C., Chiang C.M. The general transcription machinery and general cofactors (англ.) // Critical reviews in biochemistry and molecular biology : journal. — 2006. — Vol. 41 , no. 3 . — P. 105—178 . — .
  16. Lobe C.G. Transcription factors and mammalian development (неопр.) // Current topics in developmental biology. — 1992. — Т. 27 . — С. 351—383 . — .
  17. Lemons D., McGinnis W. Genomic evolution of Hox gene clusters (англ.) // Science : journal. — 2006. — September ( vol. 313 , no. 5795 ). — P. 1918—1922 . — doi : . — .
  18. Moens C.B., Selleri L. Hox cofactors in vertebrate development (неопр.) // Developmental biology. — 2006. — March ( т. 291 , № 2 ). — С. 193—206 . — doi : . — .
  19. Ottolenghi C., Uda M., Crisponi L., Omari S., Cao A., Forabosco A., Schlessinger D. Determination and stability of sex (неопр.) // BioEssays : news and reviews in molecular, cellular and developmental biology. — 2007. — January ( т. 29 , № 1 ). — С. 15—25 . — doi : . — .
  20. Pawson T. Signal transduction--a conserved pathway from the membrane to the nucleus (англ.) // Developmental genetics : journal. — 1993. — Vol. 14 , no. 5 . — P. 333—338 . — doi : . — .
  21. Osborne C.K., Schiff R., Fuqua S.A., Shou J. Estrogen receptor: current understanding of its activation and modulation (англ.) // (англ.) ( : journal. — 2001. — December ( vol. 7 , no. 12 Suppl ). — P. 4338s—4342s; discussion 4411s—4412s . — .
  22. Shamovsky I., Nudler E. (англ.) // Cell. Mol. Life Sci. : journal. — 2008. — March ( vol. 65 , no. 6 ). — P. 855—861 . — doi : . — .
  23. Benizri E., Ginouvès A., Berra E. The magic of the hypoxia-signaling cascade (англ.) // Cell. Mol. Life Sci. : journal. — 2008. — April ( vol. 65 , no. 7—8 ). — P. 1133—1149 . — doi : . — .
  24. Weber L.W., Boll M., Stampfl A. (англ.) // (англ.) ( : journal. — 2004. — November ( vol. 10 , no. 21 ). — P. 3081—3087 . — . 11 августа 2007 года.
  25. ↑ Whiteside S.T., Goodbourn S. (англ.) // (англ.) ( : journal. — (англ.) ( , 1993. — April ( vol. 104 ( Pt 4) ). — P. 949—955 . — .
  26. Bohmann D. Transcription factor phosphorylation: a link between signal transduction and the regulation of gene expression (англ.) // Cancer cells (Cold Spring Harbor, N.Y. : 1989) : journal. — 1990. — November ( vol. 2 , no. 11 ). — P. 337—344 . — .
  27. Weigel N.L., Moore N.L. Steroid Receptor Phosphorylation: A Key Modulator of Multiple Receptor Functions (англ.) : journal. — 2007. — .
  28. Wärnmark A., Treuter E., Wright A.P., Gustafsson J-Å. Activation functions 1 and 2 of nuclear receptors: molecular strategies for transcriptional activation (англ.) // (англ.) ( : journal. — 2003. — Vol. 17 , no. 10 . — P. 1901—1909 . — doi : . — .
  29. Littlewood T.D., Evan G.I. Transcription factors 2: helix-loop-helix (неопр.) // Protein profile. — 1995. — Т. 2 , № 6 . — С. 621—702 . — .
  30. Vinson C., Myakishev M., Acharya A., Mir A.A., Moll J.R., Bonovich M. Classification of human B-ZIP proteins based on dimerization properties (англ.) // (англ.) ( : journal. — 2002. — September ( vol. 22 , no. 18 ). — P. 6321—6335 . — doi : . — . — PMC .
  31. Wintjens R., Rooman M. Structural classification of HTH DNA-binding domains and protein-DNA interaction modes (англ.) // (англ.) ( : journal. — 1996. — September ( vol. 262 , no. 2 ). — P. 294—313 . — doi : . — .
  32. Gehring W.J., Affolter M., Bürglin T. Homeodomain proteins (англ.) // (англ.) ( : journal. — 1994. — Vol. 63 . — P. 487—526 . — doi : . — .
  33. Dahl E., Koseki H., Balling R. Pax genes and organogenesis (неопр.) // BioEssays : news and reviews in molecular, cellular and developmental biology. — 1997. — September ( т. 19 , № 9 ). — С. 755—765 . — doi : . — .
  34. Laity J.H., Lee B.M., Wright P.E. Zinc finger proteins: new insights into structural and functional diversity (англ.) // Current opinion in structural biology : journal. — 2001. — February ( vol. 11 , no. 1 ). — P. 39—46 . — doi : . — .
  35. Wolfe S.A., Nekludova L., Pabo C.O. DNA recognition by Cys2His2 zinc finger proteins (англ.) // Annual review of biophysics and biomolecular structure : journal. — 2000. — Vol. 29 . — P. 183—212 . — doi : . — .
  36. Fichou Y., Nectoux J., Bahi-Buisson N., Rosas-Vargas H., Girard B., Chelly J., Bienvenu T. The first missense mutation causing Rett syndrome specifically affecting the MeCP2_e1 isoform. (англ.) // Neurogenetics : journal. — 2008. — November. — .
  37. Al-Quobaili F., Montenarh M. Pancreatic duodenal homeobox factor-1 and diabetes mellitus type 2 (review). (англ.) // (англ.) ( : journal. — 2008. — Vol. 21(4) . — P. 399—404 . — .
  38. Lai C.S., Fisher S.E., Hurst J.A., Vargha-Khadem F., Monaco AP. A forkhead-domain gene is mutated in a severe speech and language disorder. (англ.) // Nature : journal. — 2001. — Vol. 413(6855) . — P. 519—523 . — .
  39. ↑ Banerjee-Basu S., Baxevanis A.D. Structural analysis of disease-causing mutations in the P-subfamily of forkhead transcription factors. (англ.) // Proteins : journal. — 2004. — Vol. 54(4) . — P. 639—647 . — .
  40. Ariffin H., Martel-Planche G., Daud S.S., Ibrahim K., Hainaut P. Li-Fraumeni syndrome in a Malaysian kindred. (неопр.) // Cancer Genet Cytogenet.. — 2008. — Т. 186(1) . — С. 49—53 . — .
  41. Stegmaier P., Kel A.E., Wingender E. (англ.) // Genome informatics. International Conference on Genome Informatics : journal. — 2004. — Vol. 15 , no. 2 . — P. 276—286 . — . 19 июня 2013 года.
  42. Matys V., Kel-Margoulis O.V., Fricke E., Liebich I., Land S., Barre-Dirrie A., Reuter I., Chekmenev D., Krull M., Hornischer K., Voss N., Stegmaier P., Lewicki-Potapov B., Saxel H., Kel A.E., Wingender E. TRANSFAC and its module TRANSCompel: transcriptional gene regulation in eukaryotes (англ.) // (англ.) ( : journal. — 2006. — Vol. 34 , no. Database issue . — P. D108—10 . — doi : . — .
  43. . Дата обращения: 5 августа 2007. 21 марта 2012 года.
  44. Qi Lei S. , Larson Matthew H. , Gilbert Luke A. , Doudna Jennifer A. , Weissman Jonathan S. , Arkin Adam P. , Lim Wendell A. (англ.) // Cell. — 2013. — February ( vol. 152 , no. 5 ). — P. 1173—1183 . — ISSN . — doi : . — . [ ]
  45. Farzadfard Fahim , Perli Samuel D. , Lu Timothy K. (англ.) // ACS Synthetic Biology. — 2013. — 11 September ( vol. 2 , no. 10 ). — P. 604—613 . — ISSN . — doi : . — . [ ]
  46. Gilbert Luke A. , Larson Matthew H. , Morsut Leonardo , Liu Zairan , Brar Gloria A. , Torres Sandra E. , Stern-Ginossar Noam , Brandman Onn , Whitehead Evan H. , Doudna Jennifer A. , Lim Wendell A. , Weissman Jonathan S. , Qi Lei S. // Cell. — 2013. — Июль ( т. 154 , № 2 ). — С. 442—451 . — ISSN . — doi : . — . [ ]
  47. Perez-Pinera Pablo , Kocak D Dewran , Vockley Christopher M , Adler Andrew F , Kabadi Ami M , Polstein Lauren R , Thakore Pratiksha I , Glass Katherine A , Ousterout David G , Leong Kam W , Guilak Farshid , Crawford Gregory E , Reddy Timothy E , Gersbach Charles A. (англ.) // Nature Methods. — 2013. — 25 July ( vol. 10 , no. 10 ). — P. 973—976 . — ISSN . — doi : . — . [ ]
  48. Purcell Oliver , Peccoud Jean , Lu Timothy K. (англ.) // ACS Synthetic Biology. — 2014. — 3 January ( vol. 3 , no. 10 ). — P. 737—744 . — ISSN . — doi : . — . [ ]
Источник —

megan
  • 2020-07-29
  • 1
  • Tags:

Same as Факторы транскрипции

The title for the last searches