В соответствии с Переходной Конституцией Республики Южный Судан главой государства и правительства, Главнокомандующим Народно-освободительной армией Судана и Верховным Главнокомандующим любых других регулярных войск является Президент. Избирается на 4 года всеобщим тайным голосованием. Может быть отрешён от должности в случае отставки, неспособности исполнять обязанности Президента и отрешения от должности (
импичмента
). В том случае, если президентское место освобождается до выборов, в течение двухнедельного срока его занимает Вице-президент.
Президент обязан:
охранять безопасность Южного Судана и защищать его территориальную целостность;
контролировать деятельность конституционных и исполнительных учреждений и обеспечивать достойное лидерство в государственных делах;
назначать конституционных и судебных должностных лиц;
председательствовать на заседании Кабинета Министров;
объявлять и прекращать чрезвычайное положение;
инициировать конституционные поправки и законодательные акты, а также одобрять и подписывать законопроекты, принятые
;
созывать, собирать, переносить и продлевать заседания Парламента;
подтверждать смертный приговор, даровать помилование и снимать судимость и штрафы;
назначать советников Президента;
назначать временные комиссии и комитеты;
устанавливать независимые учреждения и комиссии;
присваивать награды;
представлять на высшем уровне Правительство и народ Южного Судана;
объявлять войну;
представлять Государство в международных отношениях, назначать послов государства и принимать иностранных послов;
направлять и контролировать внешнюю политику и ратифицировать договора и международные соглашения по согласованию с Парламентом;
запрашивать мнение
по любым конституционным вопросам;
отстранять от должности губернатора штата и распускать законодательное собрание штата в случае возникновения кризиса в стране, который угрожает национальной безопасности и территориальной целостности;
назначать исполняющего обязанности губернатора, который в течение шестидесяти дней должен подготовить выборы в штате, в котором был смещен с должности губернатор либо было распущено законодательное собрание штата в соответствии с положениями настоящей Конституции, соответствующей конституции штата и закона;
выполнять любые другие функции, которые могут быть предусмотрены законом.