Протеом — совокупность белков организма, производимых клеткой, тканью или организмом в определённый период времени. Или, более строго, это совокупность экспрессированных белков в данном типе клеток или в организме, в данный период времени при данных условиях. Термин является производным слова «протеин» (белок), аналогичным по происхождению слову « геном » (совокупность всех генов организма).

Термин применялся к нескольким разным типам биологических систем. Протеом клетки — совокупность белков, найденных в определённой клетке при определённых внешних условиях, как например, под действием определенных гормонов . Полный протеом организма — совокупный набор протеомов всех клеток. Термином «протеом» также обозначают набор белков субклеточного организма, например вируса (вирусный протеом).

Протеом, особенно у эукариот , больше, чем геном, то есть количество белков превышает количество генов . Это связано с альтернативным сплайсингом , а также с посттрансляционной модификацией белков, например, их гликозилированием и фосфорилированием .

В то время как геном определяется последовательностью нуклеотидов , протеом не сводится к сумме последовательностей аминокислот . Протеом включает в себя также пространственные структуры всех содержащихся в нём белков (см. вторичная структура белка , третичная структура белков ) и функционального взаимодействия между ними.

Протеомика — наука о протеомах, развивалась в значительной степени путём разделения белков методом двумерного электрофореза . Первое измерение — разделение белков на основе их электрического заряда методом изоэлектрического фокусирования . Второе измерение — разделение белков на основе их молекулярного веса методом .

История

Термин «протеом» предложил в 1994 году австралийский учёный на симпозиуме 2D Electrophoresis: from protein maps to genomes" в городе Сиена , Италия . В печати термин появился в 1995 году в публикации части кандидатской диссертации Уилкинса.

Исследование протеома — крупный международный научный проект . В 2001 году для работы над ним была создана международная Организация протеома человека ( англ. Human Proteome Organization/HUPO ). Особое внимание участников проекта вызывают белки крови, печени и головного мозга.

См. также

• Проект «Протеом человека»
• Протеоформы
• Транскриптом

Примечания

Ссылки

• Базы данных: PIR | Swissprot | Pfam