Министерство возникло 8 декабря 1992 года законом № 548/1992, которым были внесены поправки в закон № 2/1969 «о создании министерств и других центральных органов государственного управления Чешской Республики».
Координирует деятельность центральных органов, органов управления, органов местного самоуправления и юридических лиц, имеющих значение для обороны государства, по подготовке к обороне
Руководит военной разведкой
Обеспечивает неприкосновенность воздушного пространства Чешской Республики и координацию военного воздушного движения с гражданским воздушным движением
Организует и осуществляет мероприятия по мобилизации Армии Чешской Республики, ведению учета граждан, подлежащих призыву на военную службу, и ведению учета материальных средств, которые будут предоставлены для нужд Армии Чешской Республики в период боевой готовности
Призывает граждан Чешской Республики на военную службу
Организует сотрудничество с армиями других государств в рамках структур европейской безопасности
Осуществляет государственный надзор за радиационной защитой объектов военного назначения