Interested Article - Графодатский, Александр Сергеевич

Внешние медиафайлы
Изображения
Видеофайлы

Графодатский Александр Сергеевич (20 мая 1951 , Новосибирск) — советский и российский биолог , доктор биологических наук , член-корреспондент РАН , профессор Новосибирского Государственного университета .

Биография

В 1974 году окончил Государственный университет в Новосибирске.
До 1976 года работает лаборантом Института цитологии и генетики Сибирского Отделения АН СССР .
В 1976—1983 годах занимает должность младшего научного сотрудника.
До 1986 года является старшим научным сотрудником Института цитологии и генетики .
В 1989 году заведует лабораторией цитогенетики животных.
С 2009 года ведёт научную деятельность в Институте химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН в Новосибирске .
В 2012 году руководит лабораторией цитогенетики животных и отделом разнообразия и эволюции геномов.
В 2012—2017 — заместитель директора по научной работе Института молекулярной и клеточной биологии СО РАН.
В 2019 году избран членом-корреспондентом РАН .

Научная деятельность

В 1979 году защитил кандидатскую диссертацию «Сравнительная цитогенетика куницеобразных (Carnivora, Mustelidae)» по специальности «Генетика».
В 1992 году защитил докторскую диссертацию «Цитогенетические аспекты филогении млекопитающих» по специальности «Генетика».
Сфера научных интересов: цитогенетика, разнообразие геномов, эволюция млекопитающих.
Основные направления исследований:

  • Сравнительный анализ геномов человека и всех видов домашних, пушных, исчезающих видов фауны.
  • Изучение особенностей эволюции млекопитающих, ряда таксонов рыб, амфибий, рептилий и птиц.
  • Определение особенностей молекулярной организации и эволюции половых и добавочных хромосом .

Занимается популяризацией науки .

Участие в международных научных организациях

Научные труды

Автор и соавтор 234 научных работ, в том числе 11 монографий.

  • Графодатский АС, Исаенко АА, Терновский ДВ, Раджабли СИ. Конститутивный гетерохроматин и размеры геномов ряда видов куницеобразных (Carnivora, Mustelidae). Генетика 13: 2123-2128, 1977
  • Графодатский АС, Раджабли СИ. Хромосомы сельскохозяйственных и лабораторных животных. Атлас. Новосибирск. Наука. 1988
  • Graphodatsky AS. Conserved and variable elements of mammalian chromosomes. in: Halnan CRE, ed. Cytogenetics of animals, Oxon, UK: CAB International Press, 1989, pp 95-124
  • Yang F., O'Brien PCM, Milne BS, Graphodatsky AS, Solanky N, Trifonov V, Rens W, Sargan D, Ferguson-Smith MA. A complete comparative chromosome map for the dog, red fox and human and its integration with canine genetic maps. Genomics 62: 189-202, 1999
  • Graphodatsky AS, Yang F, O’Brien PCM, Perelman P, Milne N, Serdukova N, Kawada S-I, Ferguson-Smith MA. Phylogenetic implications of the 38 putative ancestral chromosome segments for four canid species. Cytogenet Cell Genet 92: 243-247, 2001
  • Graphodatsky AS, Yang F, Perelman PL, O'Brien PCM, Serdukova NA, Milne BS, Biltueva LS, Fu B, Vorobieva NV, Kawada S-I, Robinson TJ, Ferguson-Smith MA. Comparative molecular cytogenetic studies in the order Carnivora: mapping chromosomal rearrangements onto the phylogenetic tree. Cytogenet Genome Res 96: 137-145, 2002
  • Yang F, Alkalaeva EZ, Perelman PL, Pardini AT, Harrison WR, O’Brien PCM, Fu B, Graphodatsky AS, Ferguson-Smith MA. Reciprocal chromosome painting between human, aardvark and elephant (Superorder Afrotheria) reveals the likely eutherian ancestral karyotype. Proc Natl Acad Sci USA 100: 1062-1066, 2003
  • Yang F. Graphodatsky A.S. Integrated comparative genome maps and their implications for karyotype evolution of carnivores. in: Chromosome today, Schmid M and Nanda I, eds. Kluwer Academic Publishers, The Netherlands 14: 215-224, 2004
  • Graphodatsky AS, Kukekova AV, Yudkin DV, Trifonov VA, Vorobieva NV, Beklemisheva VR, Perelman PL, Graphodatskaya DA, Trut LN, Yang F., Ferguson-Smith MA, Acland GM, Aguirre GD. The proto-oncogene c-kit maps to canid B-chromosomes. Chromosome Res 13: 113-122, 2005
  • Yang F, Graphodatsky AS, Li T, Fu B, Dobigny G, Wang J, Perelman PL, Serdukova NA, Su W, O’Brien PCM, Wang Y, Ferguson-Smith MA, Volobouev V, Nie W. Comparative genome maps of the pangolin, hedgehog, sloth, anteater and human revealed by cross-species chromosome painting: further insight into the ancestral karyotype and genome evolution of eutherian mammals. Chromosome Res 14: 283-296, 2006
  • Froenicke L, Graphodatsky A, Muller S, Lyons LA, Robinson TJ, Volleth M, Yang F, Wienberg J. Are molecular cytogenetics and bioinformatics suggesting diverging models of ancestral mammalian genomes? Genome Res 16: 306-310, 2006
  • Графодатский АС. Сравнительная хромосомика. Мол Биол 41: 408-422, 2007
  • Graphodatsky AS, Perelman PL, Sokolovskaya NV, Beklemisheva VR, Serdukova NA, O’Brien SJ, Ferguson-Smith MA, Yang F. Phylogenomics of the dog and fox family (Canidae, Carnivora) revealed by chromosome painting. Chromosome Res 16: 129-143, 2008
  • Graphodatsky AS, Yang F, Dobigny G, Romanenko SA, Biltueva LS, Perelman PL, Beklemisheva VR, Alkalaeva EZ, Serdukova NA, Ferguson-Smith MA, Murphy WJ, Robinson TJ. Tracking genome organization in rodents by ZOO-FISH. Chromosome Res 16: 261-274, 2008
  • Kulemzina AI, Trifonov VA, Perelman PL, Rubtsova NV, Volobuev V, Ferguson-Smith MA, Stanyon R, Yang F, Graphodatsky AS. Cross-species chromosome painting in Cetartiodactyla: reconstructing the karyotype evolution in key phylogenetic lineages. Chromosome Res 17: 419-436, 2009
  • Genome 10K community of scientists. A proposal to obtain whole genome sequence for 10,000 vertebrate species. J Heredity 100: 659-674, 2009
  • Beklemisheva VR, Romanenko SA, Biltueva LS, Trifonov VA, Vorobieva NV, Serdukova NA, Rubtsova NV, Brandler OV, O'Brien PC, Yang F, Stanyon R, Ferguson-Smith MA, Graphodatsky AS. Reconstruction of karyotype evolution in core Glires. I. The genome homology revealed by comparative chromosome painting. Chromosome Res 19: 549–565, 2011
  • Graphodatsky AS, Trifonov VA, Stanyon R. The genome diversity and karyotype evolution of mammals. Mol Cytogen 4: 22, 2011
  • Romanenko SA, Perelman PL, Trifonov VA, Graphodatsky AS. Chromosomal evolution of Rodentia. Heredity 108: 4-16, 2011
  • Stanyon R, Graphodatsky A. (Ed’s) Evolutionary dynamics of mammalian karyotypes. Karger, Basel, Switzerland, 2012, 208 pp
  • Nie W, Wang J, Su W, Wang D, Tanomtong A, Perelman PL, Graphodatsky AS, Yang F. Chromosomal rearrangements and karyotype evolution in carnivores revealed by chromosome painting. Heredity 108: 17-27, 2012
  • Romanenko SA, Perelman PL, Trifonov VA, Graphodatsky AS. Chromosomal evolution of Rodentia. Heredity 108: 4-16, 2012
  • Thalmann O,... , Druzhkova A, Graphodatsky A,... Wayne RK. Complete mitochondrial genomes of ancient canines suggest a European origin of domestic dogs. Science 342: 871-874, 2013
  • Trifonov VA, Romanenko SS, Beklemisheva VR, Biltueva LS, Makunin AI, Lemskaya NA, Kulemzina AI, Stanyon R, Graphodatsky AS. Evolutionary plasticity of acipenseriform genomes. Chromosoma 125: 661-668, 2016
  • Beklemisheva VR, Perelman PL, Lemskaya NA, Kulemzina AI, Proskuryakova AA, Burkanov VN, Graphodatsky AS. The ancestral carnivore karyotype as substantiated by comparative chromosome painting of three pinnipeds, the walrus, the steller sea lion and the Baikal seal (Pinnipedia, Carnivora). PLoS ONE 11(1): e0147647, 2016
  • Druzhkova AS, Makunin AI, Vorobieva NV, Vasiliev SK, Ovodov ND, Shunkov MV, Trifonov VA, Graphodatsky AS. Complete mitochondrial genome of an extinct Equus ( Sussemionus ) ovodovi specimen from Denisova cave (Altai, Russia). Mitochondrial DNA Part B 2(1): 79-81, 2017
  • Proskuryakova AA, Kulemzina AI, Perelman PL, Makunin AI, Larkin DM, Farré M, Kukekova AV, Johnson JL, Lemskaya NA, Beklemisheva VR, Roelke-Parker ME, Bellizzi J, Ryder OA, O’Brien SJ, Graphodatsky AS. X chromosome evolution in Cetartiodactyla. Genes 8(9): 216, 2017
  • Romanenko SA, Serdyukova NA, Perelman PL, Pavlova SV, Bulatova NS, Golenishchev FN, Stanyon R, Graphodatsky AS. Intrachromosomal rearrangements in rodents from the perspective of comparative region-specific painting. Genes 8(9): 215, 2017
  • Proskuryakova AA, Kulemzina AI, Perelman PL, Serdukova NA, Ryder OA, Graphodatsky AS. The case of X and Y localization of nucleolus organizer regions (NORs) in Tragulus javanicus (Cetartiodactyla, Mammalia). Genes 9(6): 312, 2018
  • Makunin AI, Rajičić M, Karamysheva TV, Romanenko SA, Druzhkova AS, Blagojević J, Vujošević M, Rubtsov NB, Graphodatsky AS, Trifonov VA. Low-pass single-chromosome sequencing of human small supernumerary marker chromosomes (sSMCs) and Apodemus B chromosomes. Chromosoma 127(3): 301–311, 2018
  • Makunin AI, Romanenko SA, Beklemisheva VR, Perelman PL, Druzhkova AS, Petrova KO, Prokopov DY, Chernyaeva EN, Johnson JL, Kukekova AV, Yang F, Ferguson-Smith MA, Graphodatsky AS, Trifonov VA. Sequencing of supernumerary chromosomes of red fox and raccoon dog confirms a non-random gene acquisition by B chromosomes. Genes 9(8): 405, 2018
  • Kukekova AV,... Serdyukova NA,... Beklemischeva V,... Perelman PL, Graphodatsky AS,... Zhang G. Red fox genome assembly identifies genomic regions associated with tame and aggressive behaviours. Nature Ecol Evol 2: 1479-1491, 2018
  • Farré M, Kim J, Proskuryakova AA, Zhang Y, Kulemzina AI, Li Q, Zhou Y, Xiong Y, Johnson JL, Perelman P, Johnson WE, Warren WC, Kukekova AV, Zhang G, O'Brien SJ, Ryder OA, Graphodatsky AS, Ma J, Lewin HA, Larkin DM. Evolution of gene regulation in ruminants differs between evolutionary breakpoint regions and homologous synteny blocks. Genome Res 29(4): 576-589, 2019
  • Farré M, Li Q, Darolti I, Zhou Y, Damas J, Proskuryakova AA, Kulemzina AI, Chemnick LG, Kim J, Ryder OA, Ma J, Graphodatsky AS, Zhang G, Larkin DM, Lewin HA. An integrated chromosome-scale genome assembly of the Masai giraffe ( Giraffa camelopardalis tippelskirchi ). GigaScience 8(8): giz090, 2019
  • Atlas of mammalian chromosomes (2nd edition). eds. Graphodatsky AS, Perelman PL, O’Brien SJ. Wiley-Blackwell, USA, 2020, 1008 p

Примечания

  1. (15 ноября 2019). Дата обращения: 22 апреля 2020.
  2. (24 ноября 2011). Дата обращения: 22 апреля 2020. 12 сентября 2021 года.
  3. . Дата обращения: 22 апреля 2020. 2 апреля 2019 года.
  4. . Дата обращения: 22 апреля 2020. 29 апреля 2020 года.

Ссылки

  • на официальном сайте РАН
  • . mcb.nsc.ru. Дата обращения: 20 апреля 2020. 24 февраля 2020 года.
  • от 4 августа 2020 на Wayback Machine
Источник —

Same as Графодатский, Александр Сергеевич