Фернандо Самбрано в качестве футболиста выступал за клуб «Хетафе Депортиво» — предшественника
Хетафе
. Закончив игровую карьеру, возглавлял команды низших дивизионов — Сан-Фернандо, Вальдепеньяс, Колониа Москардо.
В ходе сезона
возглавил
Райо Вальекано
, с которым проработал несколько сезонов (с перерывом). В
1999 году
возглавил
Атлетико Мадрид Б
, а через два года и основную команду
Атлетико Мадрид
после отставки
Радомира Антича
. По итогам сезона
матрасники
покинули
Примеру
, но Самбрано остался на посту главного тренера, но вскоре его сместил
Маркос Алонсо
. По одному сезону поработал в клубах «
Кордоба
» и «
Сьюдад де Мурсия
».