• Футбольные клубы Эстонии, прекратившие существование ‎ (7: 7 с.)

*

• Женские футбольные клубы Эстонии ‎ (1: 1 с.)

Н

• ФК «Нарва-Транс» ‎ (3: 2 кат., 1 с.)

Ф

• ФК «Инфонет» ‎ (3: 1 кат., 2 с.)
• ФК «Левадия» ‎ (8: 5 кат., 3 с.)
• ФК «Нымме Калью» ‎ (5: 3 кат., 2 с.)
• ФК «Пайде» ‎ (2: 2 кат.)
• ФК «Флора» ‎ (5: 4 кат., 1 с.)
• Футбольные клубы Пярну ‎ (3: 3 с.)

А

• Аякс (футбольный клуб, Таллин)

В

• Валга (футбольный клуб)

Д

• Динамо (футбольный клуб, Таллин)

К

• Калев (футбольный клуб, Силламяэ)
• Калев (футбольный клуб, Таллин)
• Курессааре (футбольный клуб)

Л

• Лантана (футбольный клуб)
• Легион (футбольный клуб, Таллин)

М

• Мааг (футбольный клуб)
• Маарду Линнамеэсконд

Н

• Нарва-Транс
• Норма (футбольный клуб)

П

• Пайде (футбольный клуб)

С

• Сантос (футбольный клуб, Тарту)
• Спорт (футбольный клуб, Таллин)

Т

• Таллинна Садам
• Таммека (футбольный клуб)
• Тарвас (футбольный клуб)
• Тулевик
• ТФМК (футбольный клуб)

У

• Уорриор (футбольный клуб)

Ф

• Феникс (футбольный клуб, Йыхви)
• ФКИ Левадия U21
• Флора (женский футбольный клуб)
• Флора-2

Х

• Харью (футбольный клуб)